RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622018.4

HPCAL1-208, Transcript of hippocalcin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPCAL1, Length 1,535 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1-208ENST00000622018 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
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HPCAL1-208ENST00000622018 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.79■■□□□ 1.88
HPCAL1-208ENST00000622018 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.74■■□□□ 1.87
HPCAL1-208ENST00000622018 CEP162Q5TB80 1403 aa26.72■■□□□ 1.87
HPCAL1-208ENST00000622018 IQGAP2Q13576 1575 aa26.71■■□□□ 1.87
HPCAL1-208ENST00000622018 OSCARQ8IYS5 282 aa26.66■■□□□ 1.86
HPCAL1-208ENST00000622018 CLIP1P30622 1438 aa26.66■■□□□ 1.86
HPCAL1-208ENST00000622018 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.6■■□□□ 1.85
HPCAL1-208ENST00000622018 JPH4Q96JJ6 628 aa26.6■■□□□ 1.85
HPCAL1-208ENST00000622018 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.56■■□□□ 1.84
HPCAL1-208ENST00000622018 P3H3Q8IVL6 736 aa26.55■■□□□ 1.84
HPCAL1-208ENST00000622018 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.55■■□□□ 1.84
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HPCAL1-208ENST00000622018 DISP1Q96F81 1524 aa26.48■■□□□ 1.83
HPCAL1-208ENST00000622018 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.47■■□□□ 1.83
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HPCAL1-208ENST00000622018 KIAA0556O60303 1618 aa26.44■■□□□ 1.82
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HPCAL1-208ENST00000622018 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.38■■□□□ 1.81
HPCAL1-208ENST00000622018 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.32■■□□□ 1.8
HPCAL1-208ENST00000622018 FMN1Q68DA7 1419 aa26.29■■□□□ 1.8
HPCAL1-208ENST00000622018 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.27■■□□□ 1.8
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HPCAL1-208ENST00000622018 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.12■■□□□ 1.77
HPCAL1-208ENST00000622018 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.12■■□□□ 1.77
HPCAL1-208ENST00000622018 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.12■■□□□ 1.77
HPCAL1-208ENST00000622018 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.11■■□□□ 1.77
HPCAL1-208ENST00000622018 ABCA8O94911 1581 aa26.1■■□□□ 1.77
HPCAL1-208ENST00000622018 APLP2Q06481 763 aa26.09■■□□□ 1.77
HPCAL1-208ENST00000622018 UACAQ9BZF9 1416 aa26.08■■□□□ 1.77
HPCAL1-208ENST00000622018 ARID3CA6NKF2 412 aa26.08■■□□□ 1.77
HPCAL1-208ENST00000622018 HECW1Q76N89 1606 aa26.08■■□□□ 1.76
HPCAL1-208ENST00000622018 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
HPCAL1-208ENST00000622018 ABCC2Q92887 1545 aa26■■□□□ 1.75
HPCAL1-208ENST00000622018 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26■■□□□ 1.75
HPCAL1-208ENST00000622018 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
HPCAL1-208ENST00000622018 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
HPCAL1-208ENST00000622018 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.98■■□□□ 1.75
HPCAL1-208ENST00000622018 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
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HPCAL1-208ENST00000622018 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
HPCAL1-208ENST00000622018 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.97■■□□□ 1.75
HPCAL1-208ENST00000622018 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.97■■□□□ 1.75
HPCAL1-208ENST00000622018 TIAM1Q13009 1591 aa25.96■■□□□ 1.75
HPCAL1-208ENST00000622018 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.94■■□□□ 1.74
HPCAL1-208ENST00000622018 MAP3K1Q13233 1512 aa25.93■■□□□ 1.74
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HPCAL1-208ENST00000622018 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
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HPCAL1-208ENST00000622018 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.85■■□□□ 1.73
HPCAL1-208ENST00000622018 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.84■■□□□ 1.73
HPCAL1-208ENST00000622018 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
HPCAL1-208ENST00000622018 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
HPCAL1-208ENST00000622018 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
HPCAL1-208ENST00000622018 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.81■■□□□ 1.72
HPCAL1-208ENST00000622018 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.8■■□□□ 1.72
HPCAL1-208ENST00000622018 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.77■■□□□ 1.72
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HPCAL1-208ENST00000622018 ASXL2Q76L83 1435 aa25.69■■□□□ 1.7
HPCAL1-208ENST00000622018 KCNH8Q96L42 1107 aa25.66■■□□□ 1.7
HPCAL1-208ENST00000622018 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.66■■□□□ 1.7
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HPCAL1-208ENST00000622018 NCOA2Q15596 1464 aa25.65■■□□□ 1.7
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HPCAL1-208ENST00000622018 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.53■■□□□ 1.68
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HPCAL1-208ENST00000622018 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
HPCAL1-208ENST00000622018 DIP2BQ9P265 1576 aa25.39■■□□□ 1.65
HPCAL1-208ENST00000622018 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
HPCAL1-208ENST00000622018 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.38■■□□□ 1.65
HPCAL1-208ENST00000622018 PLCH2O75038 1416 aa25.37■■□□□ 1.65
HPCAL1-208ENST00000622018 PREX2Q70Z35 1606 aa25.37■■□□□ 1.65
HPCAL1-208ENST00000622018 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.36■■□□□ 1.65
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