RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622018.4

HPCAL1-208, Transcript of hippocalcin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPCAL1, Length 1,535 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1-208ENST00000622018 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.88■■■■□ 3.81
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HPCAL1-208ENST00000622018 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.97■■■□□ 2.71
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HPCAL1-208ENST00000622018 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.83■■■□□ 2.69
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HPCAL1-208ENST00000622018 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.7■■■□□ 2.34
HPCAL1-208ENST00000622018 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.67■■■□□ 2.34
HPCAL1-208ENST00000622018 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.64■■■□□ 2.34
HPCAL1-208ENST00000622018 SMARCA2P51531 1590 aa29.63■■■□□ 2.33
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HPCAL1-208ENST00000622018 NESP48681 1621 aa28.66■■■□□ 2.18
HPCAL1-208ENST00000622018 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.6■■■□□ 2.17
HPCAL1-208ENST00000622018 PRDM2Q13029 1718 aa28.46■■■□□ 2.15
HPCAL1-208ENST00000622018 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.42■■■□□ 2.14
HPCAL1-208ENST00000622018 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.41■■■□□ 2.14
HPCAL1-208ENST00000622018 ABCC8Q09428 1581 aa28.32■■■□□ 2.12
HPCAL1-208ENST00000622018 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.29■■■□□ 2.12
HPCAL1-208ENST00000622018 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.28■■■□□ 2.12
HPCAL1-208ENST00000622018 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.27■■■□□ 2.12
HPCAL1-208ENST00000622018 ERCC6Q03468 1493 aa28.25■■■□□ 2.11
HPCAL1-208ENST00000622018 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
HPCAL1-208ENST00000622018 TRIM41Q8WV44 630 aa28.13■■■□□ 2.09
HPCAL1-208ENST00000622018 SYNJ1O43426 1573 aa28.11■■■□□ 2.09
HPCAL1-208ENST00000622018 CUX1P39880 1505 aa28.11■■■□□ 2.09
HPCAL1-208ENST00000622018 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.08■■■□□ 2.09
HPCAL1-208ENST00000622018 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
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HPCAL1-208ENST00000622018 TOP2BQ02880 1626 aa28.03■■■□□ 2.08
HPCAL1-208ENST00000622018 TOPBP1Q92547 1522 aa28.03■■■□□ 2.08
HPCAL1-208ENST00000622018 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28■■■□□ 2.07
HPCAL1-208ENST00000622018 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
HPCAL1-208ENST00000622018 WDR62O43379 1518 aa27.94■■■□□ 2.06
HPCAL1-208ENST00000622018 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.9■■■□□ 2.06
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HPCAL1-208ENST00000622018 SOGA1O94964 1423 aa27.77■■■□□ 2.04
HPCAL1-208ENST00000622018 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.77■■■□□ 2.04
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HPCAL1-208ENST00000622018 IFT140Q96RY7 1462 aa27.64■■■□□ 2.02
HPCAL1-208ENST00000622018 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.63■■■□□ 2.01
HPCAL1-208ENST00000622018 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
HPCAL1-208ENST00000622018 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
HPCAL1-208ENST00000622018 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.6■■■□□ 2.01
HPCAL1-208ENST00000622018 WDR97A6NE52 1622 aa27.56■■■□□ 2
HPCAL1-208ENST00000622018 KIF27Q86VH2 1401 aa27.56■■■□□ 2
HPCAL1-208ENST00000622018 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
HPCAL1-208ENST00000622018 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
HPCAL1-208ENST00000622018 EEA1Q15075 1411 aa27.5■■□□□ 1.99
HPCAL1-208ENST00000622018 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.47■■□□□ 1.993e-10■■■■■ 34.9
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HPCAL1-208ENST00000622018 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.44■■□□□ 1.98
HPCAL1-208ENST00000622018 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.42■■□□□ 1.98
HPCAL1-208ENST00000622018 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
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HPCAL1-208ENST00000622018 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.3■■□□□ 1.96
HPCAL1-208ENST00000622018 PBRM1Q86U86 1689 aa27.3■■□□□ 1.96
HPCAL1-208ENST00000622018 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.27■■□□□ 1.96
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HPCAL1-208ENST00000622018 PRXQ9BXM0 1461 aa27.21■■□□□ 1.95
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HPCAL1-208ENST00000622018 KIF21BO75037 1637 aa27.15■■□□□ 1.94
HPCAL1-208ENST00000622018 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
HPCAL1-208ENST00000622018 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.14■■□□□ 1.94
HPCAL1-208ENST00000622018 ADAMTS12P58397 1594 aa27.14■■□□□ 1.94
HPCAL1-208ENST00000622018 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.14■■□□□ 1.94
HPCAL1-208ENST00000622018 GOLGA3Q08378 1498 aa27.1■■□□□ 1.93
HPCAL1-208ENST00000622018 FBLN2P98095 1184 aa27.06■■□□□ 1.92
HPCAL1-208ENST00000622018 SYNJ2O15056 1496 aa27.05■■□□□ 1.92
HPCAL1-208ENST00000622018 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
HPCAL1-208ENST00000622018 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
HPCAL1-208ENST00000622018 GRIN2AQ12879 1464 aa26.98■■□□□ 1.91
HPCAL1-208ENST00000622018 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.89■■□□□ 1.9
HPCAL1-208ENST00000622018 CHD1O14646 1710 aa26.89■■□□□ 1.9
HPCAL1-208ENST00000622018 CEP170Q5SW79 1584 aa26.82■■□□□ 1.88
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