RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619962.1

C1orf109-214, Transcript of chromosome 1 open reading frame 109, humanhuman

TSL 5

Gene C1orf109, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109-214ENST00000619962 JPH4Q96JJ6 628 aa31.38■■■□□ 2.61
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C1orf109-214ENST00000619962 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.24■■■□□ 2.59
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C1orf109-214ENST00000619962 PRXQ9BXM0 1461 aa31.12■■■□□ 2.57
C1orf109-214ENST00000619962 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
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C1orf109-214ENST00000619962 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.88■■■□□ 2.53
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C1orf109-214ENST00000619962 ASXL2Q76L83 1435 aa30.57■■■□□ 2.48
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C1orf109-214ENST00000619962 P3H3Q8IVL6 736 aa30.48■■■□□ 2.47
C1orf109-214ENST00000619962 GLI2P10070 1586 aa30.43■■■□□ 2.46
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C1orf109-214ENST00000619962 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.38■■■□□ 2.45
C1orf109-214ENST00000619962 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.38■■■□□ 2.45
C1orf109-214ENST00000619962 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.37■■■□□ 2.45
C1orf109-214ENST00000619962 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
C1orf109-214ENST00000619962 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.33■■■□□ 2.45
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C1orf109-214ENST00000619962 ATP10BO94823 1461 aa30.3■■■□□ 2.44
C1orf109-214ENST00000619962 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.29■■■□□ 2.44
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C1orf109-214ENST00000619962 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.26■■■□□ 2.44
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C1orf109-214ENST00000619962 CD109Q6YHK3 1445 aa30.09■■■□□ 2.41
C1orf109-214ENST00000619962 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.08■■■□□ 2.41
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C1orf109-214ENST00000619962 FMN1Q68DA7 1419 aa30.06■■■□□ 2.4
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C1orf109-214ENST00000619962 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.92■■■□□ 2.38
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C1orf109-214ENST00000619962 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.37
C1orf109-214ENST00000619962 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.83■■■□□ 2.37
C1orf109-214ENST00000619962 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.83■■■□□ 2.37
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C1orf109-214ENST00000619962 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
C1orf109-214ENST00000619962 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.72■■■□□ 2.35
C1orf109-214ENST00000619962 CEP162Q5TB80 1403 aa29.71■■■□□ 2.35
C1orf109-214ENST00000619962 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
C1orf109-214ENST00000619962 FANCAO15360 1455 aa29.68■■■□□ 2.34
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C1orf109-214ENST00000619962 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.66■■■□□ 2.34
C1orf109-214ENST00000619962 PLCH2O75038 1416 aa29.65■■■□□ 2.34
C1orf109-214ENST00000619962 AKNAQ7Z591 1439 aa29.64■■■□□ 2.34
C1orf109-214ENST00000619962 RAPGEF3O95398 923 aa29.63■■■□□ 2.33
C1orf109-214ENST00000619962 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.63■■■□□ 2.33
C1orf109-214ENST00000619962 ADGRL1O94910 1474 aa29.59■■■□□ 2.33
C1orf109-214ENST00000619962 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.58■■■□□ 2.33
C1orf109-214ENST00000619962 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
C1orf109-214ENST00000619962 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.53■■■□□ 2.32
C1orf109-214ENST00000619962 RICTORQ6R327 1708 aa29.52■■■□□ 2.32
C1orf109-214ENST00000619962 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.49■■■□□ 2.31
C1orf109-214ENST00000619962 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.48■■■□□ 2.31
C1orf109-214ENST00000619962 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.48■■■□□ 2.31
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