RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619962.1

C1orf109-214, Transcript of chromosome 1 open reading frame 109, humanhuman

TSL 5

Gene C1orf109, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109-214ENST00000619962 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.27■■■■■ 4.84
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C1orf109-214ENST00000619962 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.02■■■■□ 3.52
C1orf109-214ENST00000619962 SCRIBQ14160 1630 aa36.78■■■■□ 3.48
C1orf109-214ENST00000619962 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.77■■■■□ 3.48
C1orf109-214ENST00000619962 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.61■■■■□ 3.45
C1orf109-214ENST00000619962 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
C1orf109-214ENST00000619962 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.93■■■■□ 3.34
C1orf109-214ENST00000619962 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.75■■■■□ 3.31
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C1orf109-214ENST00000619962 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.09■■■■□ 3.21
C1orf109-214ENST00000619962 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
C1orf109-214ENST00000619962 SMARCA2P51531 1590 aa34.99■■■■□ 3.19
C1orf109-214ENST00000619962 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.9■■■■□ 3.18
C1orf109-214ENST00000619962 HMGXB3Q12766 1538 aa34.9■■■■□ 3.18
C1orf109-214ENST00000619962 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.87■■■■□ 3.17
C1orf109-214ENST00000619962 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
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C1orf109-214ENST00000619962 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.17■■■■□ 3.06
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C1orf109-214ENST00000619962 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.05■■■■□ 3.04
C1orf109-214ENST00000619962 CUX2O14529 1486 aa34.03■■■■□ 3.04
C1orf109-214ENST00000619962 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.95■■■■□ 3.02
C1orf109-214ENST00000619962 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
C1orf109-214ENST00000619962 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.84■■■■□ 3.01
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C1orf109-214ENST00000619962 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.65■■■□□ 2.98
C1orf109-214ENST00000619962 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.65■■■□□ 2.98
C1orf109-214ENST00000619962 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.63■■■□□ 2.97
C1orf109-214ENST00000619962 WDR62O43379 1518 aa33.58■■■□□ 2.97
C1orf109-214ENST00000619962 PRDM2Q13029 1718 aa33.39■■■□□ 2.94
C1orf109-214ENST00000619962 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
C1orf109-214ENST00000619962 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.29■■■□□ 2.92
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C1orf109-214ENST00000619962 TOPBP1Q92547 1522 aa33.09■■■□□ 2.89
C1orf109-214ENST00000619962 ABCC8Q09428 1581 aa33.01■■■□□ 2.88
C1orf109-214ENST00000619962 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.01■■■□□ 2.88
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C1orf109-214ENST00000619962 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
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C1orf109-214ENST00000619962 SOGA1O94964 1423 aa32.62■■■□□ 2.81
C1orf109-214ENST00000619962 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.6■■■□□ 2.81
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C1orf109-214ENST00000619962 WDR97A6NE52 1622 aa32.45■■■□□ 2.79
C1orf109-214ENST00000619962 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.42■■■□□ 2.78
C1orf109-214ENST00000619962 TOP2BQ02880 1626 aa32.37■■■□□ 2.77
C1orf109-214ENST00000619962 SYNJ1O43426 1573 aa32.36■■■□□ 2.77
C1orf109-214ENST00000619962 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.36■■■□□ 2.77
C1orf109-214ENST00000619962 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.36■■■□□ 2.77
C1orf109-214ENST00000619962 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.3■■■□□ 2.76
C1orf109-214ENST00000619962 GRIN2BQ13224 1484 aa32.29■■■□□ 2.76
C1orf109-214ENST00000619962 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.25■■■□□ 2.75
C1orf109-214ENST00000619962 CHD1O14646 1710 aa32.25■■■□□ 2.75
C1orf109-214ENST00000619962 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.25■■■□□ 2.75
C1orf109-214ENST00000619962 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
C1orf109-214ENST00000619962 FBLN2P98095 1184 aa32.16■■■□□ 2.74
C1orf109-214ENST00000619962 PBRM1Q86U86 1689 aa32.14■■■□□ 2.74
C1orf109-214ENST00000619962 SYNJ2O15056 1496 aa32.12■■■□□ 2.73
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C1orf109-214ENST00000619962 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.05■■■□□ 2.72
C1orf109-214ENST00000619962 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.05■■■□□ 2.72
C1orf109-214ENST00000619962 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.05■■■□□ 2.72
C1orf109-214ENST00000619962 TRIM41Q8WV44 630 aa32.01■■■□□ 2.71
C1orf109-214ENST00000619962 CLASP1Q7Z460 1538 aa32■■■□□ 2.71
C1orf109-214ENST00000619962 ADAMTS12P58397 1594 aa31.97■■■□□ 2.71
C1orf109-214ENST00000619962 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.94■■■□□ 2.7
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C1orf109-214ENST00000619962 NUP160Q12769 1436 aa31.8■■■□□ 2.68
C1orf109-214ENST00000619962 CEP170Q5SW79 1584 aa31.75■■■□□ 2.67
C1orf109-214ENST00000619962 KIF27Q86VH2 1401 aa31.74■■■□□ 2.67
C1orf109-214ENST00000619962 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.7■■■□□ 2.67
C1orf109-214ENST00000619962 IGF1RP08069 1367 aa31.68■■■□□ 2.66
C1orf109-214ENST00000619962 CUL7Q14999 1698 aa31.55■■■□□ 2.64
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C1orf109-214ENST00000619962 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.5■■■□□ 2.63
C1orf109-214ENST00000619962 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.45■■■□□ 2.63
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