RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 ARAP1Q96P48 1450 aa20.88■□□□□ 0.93
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RABGEF1-209ENST00000607882 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
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RABGEF1-209ENST00000607882 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.72■□□□□ 0.91
RABGEF1-209ENST00000607882 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
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RABGEF1-209ENST00000607882 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.41■□□□□ 0.86
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RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA0556O60303 1618 aa20.36■□□□□ 0.85
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RABGEF1-209ENST00000607882 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.33■□□□□ 0.84
RABGEF1-209ENST00000607882 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.32■□□□□ 0.84
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RABGEF1-209ENST00000607882 GOLGA3Q08378 1498 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNH8Q96L42 1107 aa20.27■□□□□ 0.83
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RABGEF1-209ENST00000607882 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
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RABGEF1-209ENST00000607882 ABCA8O94911 1581 aa20.11■□□□□ 0.81
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RABGEF1-209ENST00000607882 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.1■□□□□ 0.81
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RABGEF1-209ENST00000607882 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
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RABGEF1-209ENST00000607882 CEP162Q5TB80 1403 aa19.94■□□□□ 0.78
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RABGEF1-209ENST00000607882 CD109Q6YHK3 1445 aa19.9■□□□□ 0.78
RABGEF1-209ENST00000607882 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
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RABGEF1-209ENST00000607882 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
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RABGEF1-209ENST00000607882 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa19.81■□□□□ 0.76
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RABGEF1-209ENST00000607882 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa19.78■□□□□ 0.76
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RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGAP5Q13017 1502 aa19.59■□□□□ 0.73
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
RABGEF1-209ENST00000607882 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa19.58■□□□□ 0.73
RABGEF1-209ENST00000607882 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.58■□□□□ 0.73
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