RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.85■■■□□ 2.37
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RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.29■■□□□ 1.8
RABGEF1-209ENST00000607882 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.56■■□□□ 1.68
RABGEF1-209ENST00000607882 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.91■■□□□ 1.58
RABGEF1-209ENST00000607882 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
RABGEF1-209ENST00000607882 NACADO15069 1562 aa24.81■■□□□ 1.56
RABGEF1-209ENST00000607882 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
RABGEF1-209ENST00000607882 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.46■■□□□ 1.51
RABGEF1-209ENST00000607882 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.44■■□□□ 1.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SCRIBQ14160 1630 aa24.42■■□□□ 1.5
RABGEF1-209ENST00000607882 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.41■■□□□ 1.5
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.31■■□□□ 1.48
RABGEF1-209ENST00000607882 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.27■■□□□ 1.48
RABGEF1-209ENST00000607882 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGEF1-209ENST00000607882 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
RABGEF1-209ENST00000607882 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.6■■□□□ 1.37
RABGEF1-209ENST00000607882 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGEF1-209ENST00000607882 SMARCA4P51532 1647 aa23.16■■□□□ 1.3
RABGEF1-209ENST00000607882 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.15■■□□□ 1.3
RABGEF1-209ENST00000607882 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.1■■□□□ 1.29
RABGEF1-209ENST00000607882 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
RABGEF1-209ENST00000607882 NCAPD3P42695 1498 aa22.98■■□□□ 1.27
RABGEF1-209ENST00000607882 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RABGEF1-209ENST00000607882 SMARCA2P51531 1590 aa22.92■■□□□ 1.26
RABGEF1-209ENST00000607882 WIZO95785 1651 aa22.91■■□□□ 1.26
RABGEF1-209ENST00000607882 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1-209ENST00000607882 HMGXB3Q12766 1538 aa22.78■■□□□ 1.24
RABGEF1-209ENST00000607882 NESP48681 1621 aa22.77■■□□□ 1.24
RABGEF1-209ENST00000607882 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.75■■□□□ 1.23
RABGEF1-209ENST00000607882 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RABGEF1-209ENST00000607882 ERCC6Q03468 1493 aa22.59■■□□□ 1.21
RABGEF1-209ENST00000607882 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RABGEF1-209ENST00000607882 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.42■■□□□ 1.18
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGEF1-209ENST00000607882 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.33■■□□□ 1.16
RABGEF1-209ENST00000607882 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.31■■□□□ 1.16
RABGEF1-209ENST00000607882 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.28■■□□□ 1.16
RABGEF1-209ENST00000607882 CFTRP13569 1480 aa22.22■■□□□ 1.15
RABGEF1-209ENST00000607882 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGEF1-209ENST00000607882 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGEF1-209ENST00000607882 CUX2O14529 1486 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGEF1-209ENST00000607882 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1-209ENST00000607882 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR62O43379 1518 aa21.93■■□□□ 1.1
RABGEF1-209ENST00000607882 PRDM2Q13029 1718 aa21.84■■□□□ 1.09
RABGEF1-209ENST00000607882 TOPBP1Q92547 1522 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGEF1-209ENST00000607882 ABCC8Q09428 1581 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.69■■□□□ 1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.68■■□□□ 1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 CUX1P39880 1505 aa21.68■■□□□ 1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.062e-7■■■□□ 15.2
RABGEF1-209ENST00000607882 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
RABGEF1-209ENST00000607882 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.63■■□□□ 1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 SOGA1O94964 1423 aa21.6■■□□□ 1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 FBLN2P98095 1184 aa21.6■■□□□ 1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 IFT140Q96RY7 1462 aa21.59■■□□□ 1.05
RABGEF1-209ENST00000607882 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.046e-6■■■□□ 16.7
RABGEF1-209ENST00000607882 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
RABGEF1-209ENST00000607882 SYNJ1O43426 1573 aa21.51■■□□□ 1.03
RABGEF1-209ENST00000607882 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1-209ENST00000607882 OSCARQ8IYS5 282 aa21.42■■□□□ 1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 TOP2BQ02880 1626 aa21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.34■■□□□ 1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
RABGEF1-209ENST00000607882 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.31■■□□□ 1
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM41Q8WV44 630 aa21.31■■□□□ 1
RABGEF1-209ENST00000607882 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.29■■□□□ 1
RABGEF1-209ENST00000607882 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.28■■□□□ 1
RABGEF1-209ENST00000607882 GRIN2BQ13224 1484 aa21.25■□□□□ 0.99
RABGEF1-209ENST00000607882 CHD1O14646 1710 aa21.24■□□□□ 0.99
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR97A6NE52 1622 aa21.24■□□□□ 0.99
RABGEF1-209ENST00000607882 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.18■□□□□ 0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 PBRM1Q86U86 1689 aa21.17■□□□□ 0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.11■□□□□ 0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 SYNJ2O15056 1496 aa21.11■□□□□ 0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.1■□□□□ 0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.04■□□□□ 0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 KIF27Q86VH2 1401 aa21.04■□□□□ 0.96
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RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGEF11O15085 1522 aa21.02■□□□□ 0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 ADAMTS12P58397 1594 aa21.01■□□□□ 0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 GRIN2AQ12879 1464 aa21.01■□□□□ 0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21■□□□□ 0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21■□□□□ 0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21■□□□□ 0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.99■□□□□ 0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP170Q5SW79 1584 aa20.94■□□□□ 0.94
RABGEF1-209ENST00000607882 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1-209ENST00000607882 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.91■□□□□ 0.94
RABGEF1-209ENST00000607882 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.91■□□□□ 0.94
RABGEF1-209ENST00000607882 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.9■□□□□ 0.94
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