RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.41■■□□□ 1.18
HCG18-241ENST00000602290 FBXO41Q8TF61 875 aa22.39■■□□□ 1.17
HCG18-241ENST00000602290 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HCG18-241ENST00000602290 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.31■■□□□ 1.16
HCG18-241ENST00000602290 TSPOAP1O95153 1857 aa22.27■■□□□ 1.16
HCG18-241ENST00000602290 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.23■■□□□ 1.15
HCG18-241ENST00000602290 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
HCG18-241ENST00000602290 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.17■■□□□ 1.14
HCG18-241ENST00000602290 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
HCG18-241ENST00000602290 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.16■■□□□ 1.14
HCG18-241ENST00000602290 JPH4Q96JJ6 628 aa22.12■■□□□ 1.13
HCG18-241ENST00000602290 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HCG18-241ENST00000602290 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.09■■□□□ 1.13
HCG18-241ENST00000602290 GLI2P10070 1586 aa22.08■■□□□ 1.12
HCG18-241ENST00000602290 TOP2BQ02880 1626 aa21.99■■□□□ 1.11
HCG18-241ENST00000602290 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
HCG18-241ENST00000602290 SOCS7O14512 581 aa21.97■■□□□ 1.11
HCG18-241ENST00000602290 ABCC2Q92887 1545 aa21.92■■□□□ 1.1
HCG18-241ENST00000602290 ASXL2Q76L83 1435 aa21.92■■□□□ 1.1
HCG18-241ENST00000602290 ILDR2Q71H61 639 aa21.92■■□□□ 1.1
HCG18-241ENST00000602290 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.91■■□□□ 1.1
HCG18-241ENST00000602290 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.91■■□□□ 1.1
HCG18-241ENST00000602290 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.86■■□□□ 1.09
HCG18-241ENST00000602290 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.85■■□□□ 1.09
HCG18-241ENST00000602290 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HCG18-241ENST00000602290 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.82■■□□□ 1.08
HCG18-241ENST00000602290 CUL7Q14999 1698 aa21.77■■□□□ 1.08
HCG18-241ENST00000602290 PTPRGP23470 1445 aa21.77■■□□□ 1.08
HCG18-241ENST00000602290 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.77■■□□□ 1.07
HCG18-241ENST00000602290 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.74■■□□□ 1.07
HCG18-241ENST00000602290 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
HCG18-241ENST00000602290 KIF21BO75037 1637 aa21.73■■□□□ 1.07
HCG18-241ENST00000602290 PTPRMP28827 1452 aa21.71■■□□□ 1.07
HCG18-241ENST00000602290 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.68■■□□□ 1.06
HCG18-241ENST00000602290 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.67■■□□□ 1.06
HCG18-241ENST00000602290 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.66■■□□□ 1.06
HCG18-241ENST00000602290 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.62■■□□□ 1.05
HCG18-241ENST00000602290 UACAQ9BZF9 1416 aa21.62■■□□□ 1.05
HCG18-241ENST00000602290 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.6■■□□□ 1.05
HCG18-241ENST00000602290 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
HCG18-241ENST00000602290 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.55■■□□□ 1.04
HCG18-241ENST00000602290 CERKQ8TCT0 537 aa21.55■■□□□ 1.04
HCG18-241ENST00000602290 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.54■■□□□ 1.04
HCG18-241ENST00000602290 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
HCG18-241ENST00000602290 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.5■■□□□ 1.03
HCG18-241ENST00000602290 DISP1Q96F81 1524 aa21.49■■□□□ 1.03
HCG18-241ENST00000602290 MADDQ8WXG6 1647 aa21.48■■□□□ 1.03
HCG18-241ENST00000602290 CD109Q6YHK3 1445 aa21.46■■□□□ 1.03
HCG18-241ENST00000602290 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.46■■□□□ 1.03
HCG18-241ENST00000602290 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.46■■□□□ 1.03
HCG18-241ENST00000602290 IGF1RP08069 1367 aa21.46■■□□□ 1.03
HCG18-241ENST00000602290 IQGAP2Q13576 1575 aa21.44■■□□□ 1.02
HCG18-241ENST00000602290 HSPA2P54652 639 aa21.37■■□□□ 1.01
HCG18-241ENST00000602290 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HCG18-241ENST00000602290 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.31■■□□□ 1
HCG18-241ENST00000602290 KIAA0556O60303 1618 aa21.31■■□□□ 1
HCG18-241ENST00000602290 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.29■■□□□ 1
HCG18-241ENST00000602290 KIF27Q86VH2 1401 aa21.29■■□□□ 1
HCG18-241ENST00000602290 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.24■□□□□ 0.99
HCG18-241ENST00000602290 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.24■□□□□ 0.99
HCG18-241ENST00000602290 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.22■□□□□ 0.99
HCG18-241ENST00000602290 ABCA8O94911 1581 aa21.2■□□□□ 0.98
HCG18-241ENST00000602290 KCNH8Q96L42 1107 aa21.16■□□□□ 0.98
HCG18-241ENST00000602290 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.15■□□□□ 0.98
HCG18-241ENST00000602290 RAPGEF3O95398 923 aa21.15■□□□□ 0.98
HCG18-241ENST00000602290 NEO1Q92859 1461 aa21.14■□□□□ 0.98
HCG18-241ENST00000602290 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.13■□□□□ 0.97
HCG18-241ENST00000602290 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
HCG18-241ENST00000602290 STRCQ7RTU9 1775 aa21.12■□□□□ 0.97
HCG18-241ENST00000602290 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.12■□□□□ 0.97
HCG18-241ENST00000602290 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.1■□□□□ 0.97
HCG18-241ENST00000602290 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.09■□□□□ 0.97
HCG18-241ENST00000602290 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.08■□□□□ 0.96
HCG18-241ENST00000602290 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.07■□□□□ 0.96
HCG18-241ENST00000602290 FANCAO15360 1455 aa21.05■□□□□ 0.96
HCG18-241ENST00000602290 RICTORQ6R327 1708 aa21.02■□□□□ 0.96
HCG18-241ENST00000602290 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.02■□□□□ 0.96
HCG18-241ENST00000602290 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.01■□□□□ 0.95
HCG18-241ENST00000602290 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21■□□□□ 0.95
HCG18-241ENST00000602290 PTPRTO14522 1441 aa20.99■□□□□ 0.95
HCG18-241ENST00000602290 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.99■□□□□ 0.95
HCG18-241ENST00000602290 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.97■□□□□ 0.95
HCG18-241ENST00000602290 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.97■□□□□ 0.95
HCG18-241ENST00000602290 AKNAQ7Z591 1439 aa20.96■□□□□ 0.95
HCG18-241ENST00000602290 ATP10BO94823 1461 aa20.95■□□□□ 0.94
HCG18-241ENST00000602290 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.95■□□□□ 0.94
HCG18-241ENST00000602290 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.95■□□□□ 0.94
HCG18-241ENST00000602290 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
HCG18-241ENST00000602290 GOLGA3Q08378 1498 aa20.94■□□□□ 0.94
HCG18-241ENST00000602290 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.92■□□□□ 0.94
HCG18-241ENST00000602290 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.91■□□□□ 0.94
HCG18-241ENST00000602290 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
HCG18-241ENST00000602290 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.87■□□□□ 0.93
HCG18-241ENST00000602290 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.86■□□□□ 0.93
HCG18-241ENST00000602290 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.86■□□□□ 0.93
HCG18-241ENST00000602290 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.8■□□□□ 0.92
HCG18-241ENST00000602290 HECW1Q76N89 1606 aa20.79■□□□□ 0.92
HCG18-241ENST00000602290 MLECQ14165 292 aa20.79■□□□□ 0.92
HCG18-241ENST00000602290 ARID3CA6NKF2 412 aa20.78■□□□□ 0.92
HCG18-241ENST00000602290 NCOA1Q15788 1441 aa20.78■□□□□ 0.92
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