RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601533.5

DNAJB1-211, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B1, humanhuman

TSL 2

Gene DNAJB1, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB1-211ENST00000601533 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.79■■■□□ 2.36
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DNAJB1-211ENST00000601533 SHROOM2Q13796 1616 aa29.72■■■□□ 2.35
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DNAJB1-211ENST00000601533 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.66■■■□□ 2.34
DNAJB1-211ENST00000601533 ARHGEF11O15085 1522 aa29.66■■■□□ 2.34
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DNAJB1-211ENST00000601533 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.63■■■□□ 2.33
DNAJB1-211ENST00000601533 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.63■■■□□ 2.33
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DNAJB1-211ENST00000601533 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.54■■■□□ 2.32
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DNAJB1-211ENST00000601533 ARAP1Q96P48 1450 aa29.42■■■□□ 2.3
DNAJB1-211ENST00000601533 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.41■■■□□ 2.3
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DNAJB1-211ENST00000601533 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.32■■■□□ 2.28
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DNAJB1-211ENST00000601533 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
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DNAJB1-211ENST00000601533 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.2■■■□□ 2.26
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DNAJB1-211ENST00000601533 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.92■■■□□ 2.22
DNAJB1-211ENST00000601533 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
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DNAJB1-211ENST00000601533 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
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DNAJB1-211ENST00000601533 ARID3CA6NKF2 412 aa28.82■■■□□ 2.2
DNAJB1-211ENST00000601533 ATP10BO94823 1461 aa28.81■■■□□ 2.2
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DNAJB1-211ENST00000601533 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.65■■■□□ 2.18
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DNAJB1-211ENST00000601533 NCOA2Q15596 1464 aa28.24■■■□□ 2.11
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DNAJB1-211ENST00000601533 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.24■■■□□ 2.11
DNAJB1-211ENST00000601533 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.23■■■□□ 2.11
DNAJB1-211ENST00000601533 PREX2Q70Z35 1606 aa28.22■■■□□ 2.11
DNAJB1-211ENST00000601533 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.22■■■□□ 2.11
DNAJB1-211ENST00000601533 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.21■■■□□ 2.11
DNAJB1-211ENST00000601533 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.2■■■□□ 2.1
DNAJB1-211ENST00000601533 FANCAO15360 1455 aa28.19■■■□□ 2.1
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