RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601533.5

DNAJB1-211, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B1, humanhuman

TSL 2

Gene DNAJB1, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB1-211ENST00000601533 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.19■■■■■ 4.5
DNAJB1-211ENST00000601533 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.28■■■■□ 3.72
DNAJB1-211ENST00000601533 ABCC9O60706 1549 aa36.98■■■■□ 3.51
DNAJB1-211ENST00000601533 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.37
DNAJB1-211ENST00000601533 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.94■■■■□ 3.34
DNAJB1-211ENST00000601533 NACADO15069 1562 aa35.87■■■■□ 3.33
DNAJB1-211ENST00000601533 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.83■■■■□ 3.33
DNAJB1-211ENST00000601533 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.78■■■■□ 3.32
DNAJB1-211ENST00000601533 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.78■■■■□ 3.32
DNAJB1-211ENST00000601533 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.98■■■■□ 3.19
DNAJB1-211ENST00000601533 SCRIBQ14160 1630 aa34.94■■■■□ 3.18
DNAJB1-211ENST00000601533 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.63■■■■□ 3.13
DNAJB1-211ENST00000601533 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.59■■■■□ 3.13
DNAJB1-211ENST00000601533 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.4■■■■□ 3.1
DNAJB1-211ENST00000601533 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
DNAJB1-211ENST00000601533 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.55■■■□□ 2.96
DNAJB1-211ENST00000601533 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
DNAJB1-211ENST00000601533 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.49■■■□□ 2.95
DNAJB1-211ENST00000601533 SMARCA4P51532 1647 aa33.45■■■□□ 2.95
DNAJB1-211ENST00000601533 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.43■■■□□ 2.94
DNAJB1-211ENST00000601533 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.27■■■□□ 2.92
DNAJB1-211ENST00000601533 SMARCA2P51531 1590 aa33.17■■■□□ 2.9
DNAJB1-211ENST00000601533 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.12■■■□□ 2.89
DNAJB1-211ENST00000601533 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.1■■■□□ 2.89
DNAJB1-211ENST00000601533 NCAPD3P42695 1498 aa33.04■■■□□ 2.88
DNAJB1-211ENST00000601533 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
DNAJB1-211ENST00000601533 WIZO95785 1651 aa32.97■■■□□ 2.87
DNAJB1-211ENST00000601533 HMGXB3Q12766 1538 aa32.97■■■□□ 2.87
DNAJB1-211ENST00000601533 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
DNAJB1-211ENST00000601533 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
DNAJB1-211ENST00000601533 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
DNAJB1-211ENST00000601533 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.23■■■□□ 2.75
DNAJB1-211ENST00000601533 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.17■■■□□ 2.74
DNAJB1-211ENST00000601533 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.11■■■□□ 2.73
DNAJB1-211ENST00000601533 NESP48681 1621 aa32.09■■■□□ 2.73
DNAJB1-211ENST00000601533 CFTRP13569 1480 aa32.01■■■□□ 2.71
DNAJB1-211ENST00000601533 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.93■■■□□ 2.7
DNAJB1-211ENST00000601533 ERCC6Q03468 1493 aa31.92■■■□□ 2.7
DNAJB1-211ENST00000601533 PRDM2Q13029 1718 aa31.9■■■□□ 2.7
DNAJB1-211ENST00000601533 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.8■■■□□ 2.68
DNAJB1-211ENST00000601533 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.77■■■□□ 2.68
DNAJB1-211ENST00000601533 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.72■■■□□ 2.67
DNAJB1-211ENST00000601533 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.57■■■□□ 2.64
DNAJB1-211ENST00000601533 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
DNAJB1-211ENST00000601533 WDR62O43379 1518 aa31.44■■■□□ 2.62
DNAJB1-211ENST00000601533 CUX2O14529 1486 aa31.4■■■□□ 2.62
DNAJB1-211ENST00000601533 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.61
DNAJB1-211ENST00000601533 ABCC8Q09428 1581 aa31.38■■■□□ 2.61
DNAJB1-211ENST00000601533 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.33■■■□□ 2.61
DNAJB1-211ENST00000601533 TOPBP1Q92547 1522 aa31.29■■■□□ 2.6
DNAJB1-211ENST00000601533 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.2■■■□□ 2.59
DNAJB1-211ENST00000601533 CUX1P39880 1505 aa31.19■■■□□ 2.58
DNAJB1-211ENST00000601533 TOP2BQ02880 1626 aa31.09■■■□□ 2.57
DNAJB1-211ENST00000601533 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.09■■■□□ 2.57
DNAJB1-211ENST00000601533 SYNJ1O43426 1573 aa31.07■■■□□ 2.56
DNAJB1-211ENST00000601533 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
DNAJB1-211ENST00000601533 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.05■■■□□ 2.56
DNAJB1-211ENST00000601533 IFT140Q96RY7 1462 aa31.02■■■□□ 2.56
DNAJB1-211ENST00000601533 SOGA1O94964 1423 aa30.95■■■□□ 2.54
DNAJB1-211ENST00000601533 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
DNAJB1-211ENST00000601533 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.89■■■□□ 2.53
DNAJB1-211ENST00000601533 WDR97A6NE52 1622 aa30.79■■■□□ 2.52
DNAJB1-211ENST00000601533 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.78■■■□□ 2.52
DNAJB1-211ENST00000601533 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
DNAJB1-211ENST00000601533 TRIM41Q8WV44 630 aa30.76■■■□□ 2.51
DNAJB1-211ENST00000601533 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
DNAJB1-211ENST00000601533 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
DNAJB1-211ENST00000601533 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.67■■■□□ 2.58e-11■■■■□ 22.6
DNAJB1-211ENST00000601533 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.62■■■□□ 2.49
DNAJB1-211ENST00000601533 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.61■■■□□ 2.49
DNAJB1-211ENST00000601533 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.59■■■□□ 2.49
DNAJB1-211ENST00000601533 GRIN2BQ13224 1484 aa30.56■■■□□ 2.48
DNAJB1-211ENST00000601533 PBRM1Q86U86 1689 aa30.55■■■□□ 2.48
DNAJB1-211ENST00000601533 KIF27Q86VH2 1401 aa30.54■■■□□ 2.48
DNAJB1-211ENST00000601533 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.44■■■□□ 2.46
DNAJB1-211ENST00000601533 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
DNAJB1-211ENST00000601533 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.44■■■□□ 2.46
DNAJB1-211ENST00000601533 ADAMTS12P58397 1594 aa30.31■■■□□ 2.44
DNAJB1-211ENST00000601533 SYNJ2O15056 1496 aa30.31■■■□□ 2.44
DNAJB1-211ENST00000601533 CHD1O14646 1710 aa30.29■■■□□ 2.44
DNAJB1-211ENST00000601533 CUL7Q14999 1698 aa30.29■■■□□ 2.44
DNAJB1-211ENST00000601533 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.28■■■□□ 2.44
DNAJB1-211ENST00000601533 FBLN2P98095 1184 aa30.28■■■□□ 2.44
DNAJB1-211ENST00000601533 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.28■■■□□ 2.44
DNAJB1-211ENST00000601533 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
DNAJB1-211ENST00000601533 IGF1RP08069 1367 aa30.27■■■□□ 2.44
DNAJB1-211ENST00000601533 EEA1Q15075 1411 aa30.26■■■□□ 2.43
DNAJB1-211ENST00000601533 GRIN2AQ12879 1464 aa30.15■■■□□ 2.42
DNAJB1-211ENST00000601533 OSCARQ8IYS5 282 aa30.15■■■□□ 2.42
DNAJB1-211ENST00000601533 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.15■■■□□ 2.42
DNAJB1-211ENST00000601533 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.09■■■□□ 2.41
DNAJB1-211ENST00000601533 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
DNAJB1-211ENST00000601533 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.04■■■□□ 2.4
DNAJB1-211ENST00000601533 PRXQ9BXM0 1461 aa29.99■■■□□ 2.39
DNAJB1-211ENST00000601533 NUP160Q12769 1436 aa29.97■■■□□ 2.39
DNAJB1-211ENST00000601533 CEP170Q5SW79 1584 aa29.97■■■□□ 2.39
DNAJB1-211ENST00000601533 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.92■■■□□ 2.38
DNAJB1-211ENST00000601533 KIF21BO75037 1637 aa29.89■■■□□ 2.37
DNAJB1-211ENST00000601533 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.85■■■□□ 2.37
DNAJB1-211ENST00000601533 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms