RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601358.5

TIMM50-216, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMM50, Length 1,481 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-216ENST00000601358 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
TIMM50-216ENST00000601358 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.13■■■■□ 3.37
TIMM50-216ENST00000601358 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.08■■■■□ 3.37
TIMM50-216ENST00000601358 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.02■■■■□ 3.36
TIMM50-216ENST00000601358 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.82■■■■□ 3.32
TIMM50-216ENST00000601358 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.74■■■■□ 3.31
TIMM50-216ENST00000601358 IQGAP2Q13576 1575 aa35.74■■■■□ 3.31
TIMM50-216ENST00000601358 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
TIMM50-216ENST00000601358 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.72■■■■□ 3.31
TIMM50-216ENST00000601358 PTPRGP23470 1445 aa35.66■■■■□ 3.3
TIMM50-216ENST00000601358 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.61■■■■□ 3.29
TIMM50-216ENST00000601358 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.59■■■■□ 3.29
TIMM50-216ENST00000601358 PRXQ9BXM0 1461 aa35.52■■■■□ 3.28
TIMM50-216ENST00000601358 DISP1Q96F81 1524 aa35.51■■■■□ 3.27
TIMM50-216ENST00000601358 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.5■■■■□ 3.27
TIMM50-216ENST00000601358 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.49■■■■□ 3.27
TIMM50-216ENST00000601358 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.47■■■■□ 3.27
TIMM50-216ENST00000601358 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.46■■■■□ 3.27
TIMM50-216ENST00000601358 MAPKBP1O60336 1514 aa35.44■■■■□ 3.26
TIMM50-216ENST00000601358 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.44■■■■□ 3.26
TIMM50-216ENST00000601358 KIAA0556O60303 1618 aa35.38■■■■□ 3.25
TIMM50-216ENST00000601358 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.38■■■■□ 3.25
TIMM50-216ENST00000601358 UACAQ9BZF9 1416 aa35.37■■■■□ 3.25
TIMM50-216ENST00000601358 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
TIMM50-216ENST00000601358 EEA1Q15075 1411 aa35.35■■■■□ 3.25
TIMM50-216ENST00000601358 ABCC2Q92887 1545 aa35.34■■■■□ 3.25
TIMM50-216ENST00000601358 GOLGA3Q08378 1498 aa35.32■■■■□ 3.24
TIMM50-216ENST00000601358 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.31■■■■□ 3.24
TIMM50-216ENST00000601358 DIP2BQ9P265 1576 aa35.27■■■■□ 3.24
TIMM50-216ENST00000601358 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.25■■■■□ 3.23
TIMM50-216ENST00000601358 ASXL2Q76L83 1435 aa35.2■■■■□ 3.23
TIMM50-216ENST00000601358 P3H3Q8IVL6 736 aa35.17■■■■□ 3.22
TIMM50-216ENST00000601358 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.17■■■■□ 3.22
TIMM50-216ENST00000601358 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.14■■■■□ 3.22
TIMM50-216ENST00000601358 TSPOAP1O95153 1857 aa35.13■■■■□ 3.21
TIMM50-216ENST00000601358 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
TIMM50-216ENST00000601358 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
TIMM50-216ENST00000601358 ABCA8O94911 1581 aa35.02■■■■□ 3.2
TIMM50-216ENST00000601358 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35■■■■□ 3.19
TIMM50-216ENST00000601358 KIF21BO75037 1637 aa34.99■■■■□ 3.19
TIMM50-216ENST00000601358 GLI2P10070 1586 aa34.98■■■■□ 3.19
TIMM50-216ENST00000601358 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
TIMM50-216ENST00000601358 SAMD9Q5K651 1589 aa34.95■■■■□ 3.19
TIMM50-216ENST00000601358 ARID3CA6NKF2 412 aa34.93■■■■□ 3.18
TIMM50-216ENST00000601358 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
TIMM50-216ENST00000601358 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.91■■■■□ 3.18
TIMM50-216ENST00000601358 KDM6BO15054 1643 aa34.9■■■■□ 3.18
TIMM50-216ENST00000601358 KCNH8Q96L42 1107 aa34.9■■■■□ 3.18
TIMM50-216ENST00000601358 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
TIMM50-216ENST00000601358 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.82■■■■□ 3.16
TIMM50-216ENST00000601358 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
TIMM50-216ENST00000601358 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.81■■■■□ 3.16
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TIMM50-216ENST00000601358 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
TIMM50-216ENST00000601358 ATP10BO94823 1461 aa34.78■■■■□ 3.16
TIMM50-216ENST00000601358 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.77■■■■□ 3.16
TIMM50-216ENST00000601358 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.74■■■■□ 3.15
TIMM50-216ENST00000601358 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.73■■■■□ 3.15
TIMM50-216ENST00000601358 CD109Q6YHK3 1445 aa34.7■■■■□ 3.15
TIMM50-216ENST00000601358 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.64■■■■□ 3.14
TIMM50-216ENST00000601358 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
TIMM50-216ENST00000601358 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.58■■■■□ 3.13
TIMM50-216ENST00000601358 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
TIMM50-216ENST00000601358 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.55■■■■□ 3.12
TIMM50-216ENST00000601358 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
TIMM50-216ENST00000601358 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.51■■■■□ 3.11
TIMM50-216ENST00000601358 FMN1Q68DA7 1419 aa34.48■■■■□ 3.11
TIMM50-216ENST00000601358 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.46■■■■□ 3.11
TIMM50-216ENST00000601358 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.37■■■■□ 3.09
TIMM50-216ENST00000601358 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
TIMM50-216ENST00000601358 HECW1Q76N89 1606 aa34.33■■■■□ 3.09
TIMM50-216ENST00000601358 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.33■■■■□ 3.09
TIMM50-216ENST00000601358 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.31■■■■□ 3.08
TIMM50-216ENST00000601358 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
TIMM50-216ENST00000601358 NEO1Q92859 1461 aa34.26■■■■□ 3.07
TIMM50-216ENST00000601358 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.23■■■■□ 3.07
TIMM50-216ENST00000601358 RAPGEF3O95398 923 aa34.22■■■■□ 3.07
TIMM50-216ENST00000601358 CLIP1P30622 1438 aa34.19■■■■□ 3.06
TIMM50-216ENST00000601358 ADGRL1O94910 1474 aa34.18■■■■□ 3.06
TIMM50-216ENST00000601358 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.17■■■■□ 3.06
TIMM50-216ENST00000601358 FANCAO15360 1455 aa34.15■■■■□ 3.06
TIMM50-216ENST00000601358 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.13■■■■□ 3.05
TIMM50-216ENST00000601358 AKNAQ7Z591 1439 aa34.12■■■■□ 3.05
TIMM50-216ENST00000601358 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
TIMM50-216ENST00000601358 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.09■■■■□ 3.05
TIMM50-216ENST00000601358 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.09■■■■□ 3.05
TIMM50-216ENST00000601358 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
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TIMM50-216ENST00000601358 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.05■■■■□ 3.04
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TIMM50-216ENST00000601358 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.01■■■■□ 3.03
TIMM50-216ENST00000601358 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.01■■■■□ 3.03
TIMM50-216ENST00000601358 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.99■■■■□ 3.03
TIMM50-216ENST00000601358 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.99■■■■□ 3.03
TIMM50-216ENST00000601358 RICTORQ6R327 1708 aa33.95■■■■□ 3.02
TIMM50-216ENST00000601358 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.94■■■■□ 3.02
TIMM50-216ENST00000601358 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
TIMM50-216ENST00000601358 CEP162Q5TB80 1403 aa33.9■■■■□ 3.02
TIMM50-216ENST00000601358 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.89■■■■□ 3.02
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