RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601358.5

TIMM50-216, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMM50, Length 1,481 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-216ENST00000601358 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.85■■■■■ 5.89
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TIMM50-216ENST00000601358 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.84■■■■■ 4.61
TIMM50-216ENST00000601358 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.81■■■■■ 4.6
TIMM50-216ENST00000601358 NACADO15069 1562 aa43.64■■■■■ 4.58
TIMM50-216ENST00000601358 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.15■■■■■ 4.5
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TIMM50-216ENST00000601358 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.86■■■■■ 4.45
TIMM50-216ENST00000601358 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.81■■■■■ 4.44
TIMM50-216ENST00000601358 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.81■■■■■ 4.44
TIMM50-216ENST00000601358 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.55■■■■■ 4.4
TIMM50-216ENST00000601358 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.47■■■■■ 4.39
TIMM50-216ENST00000601358 SCRIBQ14160 1630 aa42.26■■■■■ 4.36
TIMM50-216ENST00000601358 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.94■■■■■ 4.3
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TIMM50-216ENST00000601358 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.41■■■■■ 4.22
TIMM50-216ENST00000601358 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.25■■■■■ 4.19
TIMM50-216ENST00000601358 SMARCA4P51532 1647 aa40.33■■■■■ 4.05
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TIMM50-216ENST00000601358 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.25■■■■■ 4.03
TIMM50-216ENST00000601358 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
TIMM50-216ENST00000601358 SMARCA2P51531 1590 aa40.17■■■■■ 4.02
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TIMM50-216ENST00000601358 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.96■■■■□ 3.99
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TIMM50-216ENST00000601358 ERCC6Q03468 1493 aa39.6■■■■□ 3.93
TIMM50-216ENST00000601358 WIZO95785 1651 aa39.52■■■■□ 3.92
TIMM50-216ENST00000601358 NESP48681 1621 aa39.52■■■■□ 3.92
TIMM50-216ENST00000601358 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
TIMM50-216ENST00000601358 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.3■■■■□ 3.88
TIMM50-216ENST00000601358 CUX2O14529 1486 aa39.26■■■■□ 3.88
TIMM50-216ENST00000601358 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.14■■■■□ 3.86
TIMM50-216ENST00000601358 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.13■■■■□ 3.85
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TIMM50-216ENST00000601358 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.01■■■■□ 3.83
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TIMM50-216ENST00000601358 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.72■■■■□ 3.79
TIMM50-216ENST00000601358 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.7■■■■□ 3.79
TIMM50-216ENST00000601358 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.68■■■■□ 3.78
TIMM50-216ENST00000601358 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.68■■■■□ 3.78
TIMM50-216ENST00000601358 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.64■■■■□ 3.78
TIMM50-216ENST00000601358 WDR62O43379 1518 aa38.55■■■■□ 3.76
TIMM50-216ENST00000601358 PRDM2Q13029 1718 aa38.39■■■■□ 3.74
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TIMM50-216ENST00000601358 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.18■■■■□ 3.7
TIMM50-216ENST00000601358 TOPBP1Q92547 1522 aa37.99■■■■□ 3.67
TIMM50-216ENST00000601358 ABCC8Q09428 1581 aa37.98■■■■□ 3.67
TIMM50-216ENST00000601358 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.88■■■■□ 3.66
TIMM50-216ENST00000601358 IFT140Q96RY7 1462 aa37.88■■■■□ 3.65
TIMM50-216ENST00000601358 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.76■■■■□ 3.64
TIMM50-216ENST00000601358 OSCARQ8IYS5 282 aa37.69■■■■□ 3.62
TIMM50-216ENST00000601358 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
TIMM50-216ENST00000601358 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.61
TIMM50-216ENST00000601358 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
TIMM50-216ENST00000601358 SOGA1O94964 1423 aa37.54■■■■□ 3.6
TIMM50-216ENST00000601358 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.53■■■■□ 3.63e-7■■■■□ 23.2
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TIMM50-216ENST00000601358 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.49■■■■□ 3.59
TIMM50-216ENST00000601358 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
TIMM50-216ENST00000601358 TRIM41Q8WV44 630 aa37.35■■■■□ 3.57
TIMM50-216ENST00000601358 FBLN2P98095 1184 aa37.32■■■■□ 3.56
TIMM50-216ENST00000601358 WDR97A6NE52 1622 aa37.21■■■■□ 3.55
TIMM50-216ENST00000601358 CHD1O14646 1710 aa37.2■■■■□ 3.55
TIMM50-216ENST00000601358 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.14■■■■□ 3.54
TIMM50-216ENST00000601358 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.13■■■■□ 3.53
TIMM50-216ENST00000601358 GRIN2BQ13224 1484 aa37.11■■■■□ 3.53
TIMM50-216ENST00000601358 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
TIMM50-216ENST00000601358 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.07■■■■□ 3.52
TIMM50-216ENST00000601358 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.07■■■■□ 3.52
TIMM50-216ENST00000601358 TOP2BQ02880 1626 aa37.05■■■■□ 3.52
TIMM50-216ENST00000601358 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
TIMM50-216ENST00000601358 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.02■■■■□ 3.52
TIMM50-216ENST00000601358 SYNJ1O43426 1573 aa37.02■■■■□ 3.52
TIMM50-216ENST00000601358 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.02■■■■□ 3.52
TIMM50-216ENST00000601358 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.02■■■■□ 3.52
TIMM50-216ENST00000601358 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.02■■■■□ 3.52
TIMM50-216ENST00000601358 PBRM1Q86U86 1689 aa36.97■■■■□ 3.51
TIMM50-216ENST00000601358 ARHGEF11O15085 1522 aa36.96■■■■□ 3.51
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TIMM50-216ENST00000601358 SYNJ2O15056 1496 aa36.92■■■■□ 3.5
TIMM50-216ENST00000601358 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.8■■■■□ 3.48
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TIMM50-216ENST00000601358 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.62■■■■□ 3.45
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TIMM50-216ENST00000601358 NUP160Q12769 1436 aa36.44■■■■□ 3.42
TIMM50-216ENST00000601358 CEP170Q5SW79 1584 aa36.44■■■■□ 3.42
TIMM50-216ENST00000601358 KIF27Q86VH2 1401 aa36.42■■■■□ 3.42
TIMM50-216ENST00000601358 IGF1RP08069 1367 aa36.33■■■■□ 3.41
TIMM50-216ENST00000601358 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
TIMM50-216ENST00000601358 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.23■■■■□ 3.39
TIMM50-216ENST00000601358 JPH4Q96JJ6 628 aa36.21■■■■□ 3.39
TIMM50-216ENST00000601358 SHROOM2Q13796 1616 aa36.2■■■■□ 3.39
TIMM50-216ENST00000601358 CUL7Q14999 1698 aa36.2■■■■□ 3.38
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