RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598125.5

TIMM50-211, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 3

Gene TIMM50, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-211ENST00000598125 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.02■■■□□ 2.72
TIMM50-211ENST00000598125 CHIC1Q5VXU3 224 aa32■■■□□ 2.71
TIMM50-211ENST00000598125 EEA1Q15075 1411 aa31.96■■■□□ 2.71
TIMM50-211ENST00000598125 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.95■■■□□ 2.71
TIMM50-211ENST00000598125 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.95■■■□□ 2.7
TIMM50-211ENST00000598125 PRXQ9BXM0 1461 aa31.93■■■□□ 2.7
TIMM50-211ENST00000598125 IQGAP2Q13576 1575 aa31.93■■■□□ 2.7
TIMM50-211ENST00000598125 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.91■■■□□ 2.7
TIMM50-211ENST00000598125 JPH4Q96JJ6 628 aa31.9■■■□□ 2.7
TIMM50-211ENST00000598125 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.81■■■□□ 2.68
TIMM50-211ENST00000598125 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.72■■■□□ 2.67
TIMM50-211ENST00000598125 KIF21BO75037 1637 aa31.71■■■□□ 2.67
TIMM50-211ENST00000598125 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
TIMM50-211ENST00000598125 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.67■■■□□ 2.66
TIMM50-211ENST00000598125 DISP1Q96F81 1524 aa31.65■■■□□ 2.66
TIMM50-211ENST00000598125 KIAA0556O60303 1618 aa31.64■■■□□ 2.65
TIMM50-211ENST00000598125 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.56■■■□□ 2.64
TIMM50-211ENST00000598125 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.54■■■□□ 2.64
TIMM50-211ENST00000598125 GOLGA3Q08378 1498 aa31.52■■■□□ 2.64
TIMM50-211ENST00000598125 PTPRGP23470 1445 aa31.5■■■□□ 2.63
TIMM50-211ENST00000598125 SAMD9Q5K651 1589 aa31.44■■■□□ 2.62
TIMM50-211ENST00000598125 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
TIMM50-211ENST00000598125 ABCC2Q92887 1545 aa31.34■■■□□ 2.61
TIMM50-211ENST00000598125 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.34■■■□□ 2.61
TIMM50-211ENST00000598125 UACAQ9BZF9 1416 aa31.33■■■□□ 2.61
TIMM50-211ENST00000598125 MAPKBP1O60336 1514 aa31.33■■■□□ 2.61
TIMM50-211ENST00000598125 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
TIMM50-211ENST00000598125 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.28■■■□□ 2.6
TIMM50-211ENST00000598125 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.28■■■□□ 2.6
TIMM50-211ENST00000598125 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.28■■■□□ 2.6
TIMM50-211ENST00000598125 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.26■■■□□ 2.59
TIMM50-211ENST00000598125 ABCA8O94911 1581 aa31.26■■■□□ 2.59
TIMM50-211ENST00000598125 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
TIMM50-211ENST00000598125 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.22■■■□□ 2.59
TIMM50-211ENST00000598125 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
TIMM50-211ENST00000598125 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.19■■■□□ 2.58
TIMM50-211ENST00000598125 P3H3Q8IVL6 736 aa31.18■■■□□ 2.58
TIMM50-211ENST00000598125 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
TIMM50-211ENST00000598125 DIP2BQ9P265 1576 aa31.16■■■□□ 2.58
TIMM50-211ENST00000598125 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.14■■■□□ 2.58
TIMM50-211ENST00000598125 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.13■■■□□ 2.57
TIMM50-211ENST00000598125 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.13■■■□□ 2.57
TIMM50-211ENST00000598125 ASXL2Q76L83 1435 aa31.07■■■□□ 2.56
TIMM50-211ENST00000598125 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.05■■■□□ 2.56
TIMM50-211ENST00000598125 GLI2P10070 1586 aa30.96■■■□□ 2.55
TIMM50-211ENST00000598125 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.96■■■□□ 2.55
TIMM50-211ENST00000598125 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.95■■■□□ 2.54
TIMM50-211ENST00000598125 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
TIMM50-211ENST00000598125 TSPOAP1O95153 1857 aa30.93■■■□□ 2.54
TIMM50-211ENST00000598125 ATP10BO94823 1461 aa30.92■■■□□ 2.54
TIMM50-211ENST00000598125 FMN1Q68DA7 1419 aa30.91■■■□□ 2.54
TIMM50-211ENST00000598125 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
TIMM50-211ENST00000598125 HECW1Q76N89 1606 aa30.87■■■□□ 2.53
TIMM50-211ENST00000598125 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.87■■■□□ 2.53
TIMM50-211ENST00000598125 CLIP1P30622 1438 aa30.84■■■□□ 2.53
TIMM50-211ENST00000598125 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
TIMM50-211ENST00000598125 ARID3CA6NKF2 412 aa30.83■■■□□ 2.53
TIMM50-211ENST00000598125 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.82■■■□□ 2.52
TIMM50-211ENST00000598125 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.78■■■□□ 2.52
TIMM50-211ENST00000598125 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.52
TIMM50-211ENST00000598125 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
TIMM50-211ENST00000598125 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
TIMM50-211ENST00000598125 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
TIMM50-211ENST00000598125 CEP162Q5TB80 1403 aa30.72■■■□□ 2.51
TIMM50-211ENST00000598125 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.7■■■□□ 2.51
TIMM50-211ENST00000598125 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.67■■■□□ 2.5
TIMM50-211ENST00000598125 KCNH8Q96L42 1107 aa30.67■■■□□ 2.5
TIMM50-211ENST00000598125 KDM6BO15054 1643 aa30.66■■■□□ 2.5
TIMM50-211ENST00000598125 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.65■■■□□ 2.5
TIMM50-211ENST00000598125 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.64■■■□□ 2.5
TIMM50-211ENST00000598125 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.64■■■□□ 2.5
TIMM50-211ENST00000598125 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
TIMM50-211ENST00000598125 CD109Q6YHK3 1445 aa30.61■■■□□ 2.49
TIMM50-211ENST00000598125 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.6■■■□□ 2.49
TIMM50-211ENST00000598125 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.6■■■□□ 2.49
TIMM50-211ENST00000598125 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.59■■■□□ 2.49
TIMM50-211ENST00000598125 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.52■■■□□ 2.48
TIMM50-211ENST00000598125 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.52■■■□□ 2.48
TIMM50-211ENST00000598125 KIF14Q15058 1648 aa30.5■■■□□ 2.47
TIMM50-211ENST00000598125 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
TIMM50-211ENST00000598125 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
TIMM50-211ENST00000598125 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.44■■■□□ 2.46
TIMM50-211ENST00000598125 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.42■■■□□ 2.46
TIMM50-211ENST00000598125 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
TIMM50-211ENST00000598125 NEO1Q92859 1461 aa30.38■■■□□ 2.45
TIMM50-211ENST00000598125 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.36■■■□□ 2.45
TIMM50-211ENST00000598125 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.34■■■□□ 2.45
TIMM50-211ENST00000598125 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.32■■■□□ 2.44
TIMM50-211ENST00000598125 FANCAO15360 1455 aa30.3■■■□□ 2.44
TIMM50-211ENST00000598125 PREX2Q70Z35 1606 aa30.28■■■□□ 2.44
TIMM50-211ENST00000598125 PLCH2O75038 1416 aa30.28■■■□□ 2.44
TIMM50-211ENST00000598125 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.27■■■□□ 2.44
TIMM50-211ENST00000598125 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.27■■■□□ 2.44
TIMM50-211ENST00000598125 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.26■■■□□ 2.43
TIMM50-211ENST00000598125 TIAM1Q13009 1591 aa30.25■■■□□ 2.43
TIMM50-211ENST00000598125 RICTORQ6R327 1708 aa30.22■■■□□ 2.43
TIMM50-211ENST00000598125 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.22■■■□□ 2.43
TIMM50-211ENST00000598125 AKNAQ7Z591 1439 aa30.22■■■□□ 2.43
TIMM50-211ENST00000598125 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.2■■■□□ 2.43
TIMM50-211ENST00000598125 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms