RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597663.2

PGPEP1-207, Transcript of pyroglutamyl-peptidase I, humanhuman

TSL 3

Gene PGPEP1, Length 363 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1-207ENST00000597663 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.37■■□□□ 1.81
PGPEP1-207ENST00000597663 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
PGPEP1-207ENST00000597663 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.33■■□□□ 1.81
PGPEP1-207ENST00000597663 JPH4Q96JJ6 628 aa26.29■■□□□ 1.8
PGPEP1-207ENST00000597663 IQGAP2Q13576 1575 aa26.29■■□□□ 1.8
PGPEP1-207ENST00000597663 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.26■■□□□ 1.79
PGPEP1-207ENST00000597663 PRXQ9BXM0 1461 aa26.18■■□□□ 1.78
PGPEP1-207ENST00000597663 EEA1Q15075 1411 aa26.15■■□□□ 1.78
PGPEP1-207ENST00000597663 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.1■■□□□ 1.77
PGPEP1-207ENST00000597663 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.09■■□□□ 1.77
PGPEP1-207ENST00000597663 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.07■■□□□ 1.76
PGPEP1-207ENST00000597663 DISP1Q96F81 1524 aa26.05■■□□□ 1.76
PGPEP1-207ENST00000597663 KIAA0556O60303 1618 aa26.05■■□□□ 1.76
PGPEP1-207ENST00000597663 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.05■■□□□ 1.76
PGPEP1-207ENST00000597663 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.04■■□□□ 1.76
PGPEP1-207ENST00000597663 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
PGPEP1-207ENST00000597663 TNIKQ9UKE5 1360 aa26■■□□□ 1.75
PGPEP1-207ENST00000597663 PTPRGP23470 1445 aa25.97■■□□□ 1.75
PGPEP1-207ENST00000597663 KIF21BO75037 1637 aa25.97■■□□□ 1.75
PGPEP1-207ENST00000597663 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PGPEP1-207ENST00000597663 GOLGA3Q08378 1498 aa25.93■■□□□ 1.74
PGPEP1-207ENST00000597663 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PGPEP1-207ENST00000597663 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.9■■□□□ 1.74
PGPEP1-207ENST00000597663 MAPKBP1O60336 1514 aa25.89■■□□□ 1.74
PGPEP1-207ENST00000597663 ABCC2Q92887 1545 aa25.84■■□□□ 1.73
PGPEP1-207ENST00000597663 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
PGPEP1-207ENST00000597663 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.84■■□□□ 1.73
PGPEP1-207ENST00000597663 UACAQ9BZF9 1416 aa25.83■■□□□ 1.73
PGPEP1-207ENST00000597663 SAMD9Q5K651 1589 aa25.82■■□□□ 1.72
PGPEP1-207ENST00000597663 DIP2BQ9P265 1576 aa25.78■■□□□ 1.72
PGPEP1-207ENST00000597663 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PGPEP1-207ENST00000597663 ABCA8O94911 1581 aa25.73■■□□□ 1.71
PGPEP1-207ENST00000597663 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.73■■□□□ 1.71
PGPEP1-207ENST00000597663 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.72■■□□□ 1.71
PGPEP1-207ENST00000597663 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.72■■□□□ 1.71
PGPEP1-207ENST00000597663 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.68■■□□□ 1.7
PGPEP1-207ENST00000597663 ASXL2Q76L83 1435 aa25.66■■□□□ 1.7
PGPEP1-207ENST00000597663 P3H3Q8IVL6 736 aa25.63■■□□□ 1.69
PGPEP1-207ENST00000597663 TSPOAP1O95153 1857 aa25.62■■□□□ 1.69
PGPEP1-207ENST00000597663 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.62■■□□□ 1.69
PGPEP1-207ENST00000597663 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
PGPEP1-207ENST00000597663 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.61■■□□□ 1.69
PGPEP1-207ENST00000597663 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.61■■□□□ 1.69
PGPEP1-207ENST00000597663 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.6■■□□□ 1.69
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PGPEP1-207ENST00000597663 GLI2P10070 1586 aa25.56■■□□□ 1.68
PGPEP1-207ENST00000597663 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.53■■□□□ 1.68
PGPEP1-207ENST00000597663 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
PGPEP1-207ENST00000597663 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.5■■□□□ 1.67
PGPEP1-207ENST00000597663 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PGPEP1-207ENST00000597663 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.46■■□□□ 1.67
PGPEP1-207ENST00000597663 ATP10BO94823 1461 aa25.45■■□□□ 1.66
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PGPEP1-207ENST00000597663 ARID3CA6NKF2 412 aa25.41■■□□□ 1.66
PGPEP1-207ENST00000597663 KDM6BO15054 1643 aa25.41■■□□□ 1.66
PGPEP1-207ENST00000597663 FMN1Q68DA7 1419 aa25.37■■□□□ 1.65
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PGPEP1-207ENST00000597663 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.34■■□□□ 1.65
PGPEP1-207ENST00000597663 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.3■■□□□ 1.64
PGPEP1-207ENST00000597663 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PGPEP1-207ENST00000597663 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PGPEP1-207ENST00000597663 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PGPEP1-207ENST00000597663 KCNH8Q96L42 1107 aa25.29■■□□□ 1.64
PGPEP1-207ENST00000597663 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.26■■□□□ 1.63
PGPEP1-207ENST00000597663 CD109Q6YHK3 1445 aa25.26■■□□□ 1.63
PGPEP1-207ENST00000597663 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.26■■□□□ 1.63
PGPEP1-207ENST00000597663 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PGPEP1-207ENST00000597663 CLIP1P30622 1438 aa25.25■■□□□ 1.63
PGPEP1-207ENST00000597663 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PGPEP1-207ENST00000597663 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.16■■□□□ 1.62
PGPEP1-207ENST00000597663 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.15■■□□□ 1.62
PGPEP1-207ENST00000597663 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.15■■□□□ 1.62
PGPEP1-207ENST00000597663 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.14■■□□□ 1.62
PGPEP1-207ENST00000597663 CEP162Q5TB80 1403 aa25.12■■□□□ 1.61
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PGPEP1-207ENST00000597663 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.12■■□□□ 1.61
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PGPEP1-207ENST00000597663 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.06■■□□□ 1.6
PGPEP1-207ENST00000597663 NEO1Q92859 1461 aa25.05■■□□□ 1.6
PGPEP1-207ENST00000597663 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.04■■□□□ 1.6
PGPEP1-207ENST00000597663 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
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PGPEP1-207ENST00000597663 FANCAO15360 1455 aa24.98■■□□□ 1.59
PGPEP1-207ENST00000597663 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.97■■□□□ 1.59
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PGPEP1-207ENST00000597663 RICTORQ6R327 1708 aa24.93■■□□□ 1.58
PGPEP1-207ENST00000597663 PREX2Q70Z35 1606 aa24.91■■□□□ 1.58
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PGPEP1-207ENST00000597663 AKNAQ7Z591 1439 aa24.9■■□□□ 1.58
PGPEP1-207ENST00000597663 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.89■■□□□ 1.58
PGPEP1-207ENST00000597663 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.88■■□□□ 1.57
PGPEP1-207ENST00000597663 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.86■■□□□ 1.57
PGPEP1-207ENST00000597663 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PGPEP1-207ENST00000597663 ADGRL1O94910 1474 aa24.85■■□□□ 1.57
PGPEP1-207ENST00000597663 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.83■■□□□ 1.57
PGPEP1-207ENST00000597663 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.82■■□□□ 1.56
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