RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594387.1

IRF3-208, Transcript of interferon regulatory factor 3, human

TSL 3

Gene IRF3, Length 800 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF3-208	ENST00000594387	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		29.38	■■■□□ 2.29
IRF3-208	ENST00000594387	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	29.37	■■■□□ 2.29
IRF3-208	ENST00000594387	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		29.35	■■■□□ 2.29
IRF3-208	ENST00000594387	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	29.32	■■■□□ 2.28
IRF3-208	ENST00000594387	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		29.26	■■■□□ 2.27
IRF3-208	ENST00000594387	IQGAP2	Q13576	1575 aa		29.18	■■■□□ 2.26
IRF3-208	ENST00000594387	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		29.13	■■■□□ 2.25
IRF3-208	ENST00000594387	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		29.09	■■■□□ 2.25
IRF3-208	ENST00000594387	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	29.09	■■■□□ 2.25
IRF3-208	ENST00000594387	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		29.02	■■■□□ 2.24
IRF3-208	ENST00000594387	EEA1	Q15075	1411 aa		29.02	■■■□□ 2.24
IRF3-208	ENST00000594387	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
IRF3-208	ENST00000594387	PTPRG	P23470	1445 aa		29.01	■■■□□ 2.23
IRF3-208	ENST00000594387	PRX	Q9BXM0	1461 aa		29	■■■□□ 2.23
IRF3-208	ENST00000594387	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		28.99	■■■□□ 2.23
IRF3-208	ENST00000594387	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		28.95	■■■□□ 2.23
IRF3-208	ENST00000594387	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		28.93	■■■□□ 2.22
IRF3-208	ENST00000594387	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		28.9	■■■□□ 2.22
IRF3-208	ENST00000594387	DISP1	Q96F81	1524 aa		28.89	■■■□□ 2.22
IRF3-208	ENST00000594387	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
IRF3-208	ENST00000594387	GOLGA3	Q08378	1498 aa		28.88	■■■□□ 2.21
IRF3-208	ENST00000594387	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.87	■■■□□ 2.21
IRF3-208	ENST00000594387	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		28.83	■■■□□ 2.21
IRF3-208	ENST00000594387	MAPKBP1	O60336	1514 aa		28.81	■■■□□ 2.2
IRF3-208	ENST00000594387	UACA	Q9BZF9	1416 aa		28.78	■■■□□ 2.2
IRF3-208	ENST00000594387	ABCC2	Q92887	1545 aa		28.74	■■■□□ 2.19
IRF3-208	ENST00000594387	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		28.74	■■■□□ 2.19
IRF3-208	ENST00000594387	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		28.73	■■■□□ 2.19
IRF3-208	ENST00000594387	KIF21B	O75037	1637 aa		28.71	■■■□□ 2.19
IRF3-208	ENST00000594387	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		28.71	■■■□□ 2.19
IRF3-208	ENST00000594387	DIP2B	Q9P265	1576 aa		28.66	■■■□□ 2.18
IRF3-208	ENST00000594387	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.63	■■■□□ 2.17
IRF3-208	ENST00000594387	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		28.62	■■■□□ 2.17
IRF3-208	ENST00000594387	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
IRF3-208	ENST00000594387	TSPOAP1	O95153	1857 aa		28.61	■■■□□ 2.17
IRF3-208	ENST00000594387	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
IRF3-208	ENST00000594387	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		28.6	■■■□□ 2.17
IRF3-208	ENST00000594387	ASXL2	Q76L83	1435 aa		28.59	■■■□□ 2.17
IRF3-208	ENST00000594387	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
IRF3-208	ENST00000594387	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.58	■■■□□ 2.17
IRF3-208	ENST00000594387	ABCA8	O94911	1581 aa		28.55	■■■□□ 2.16
IRF3-208	ENST00000594387	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		28.55	■■■□□ 2.16
IRF3-208	ENST00000594387	GLI2	P10070	1586 aa		28.47	■■■□□ 2.15
IRF3-208	ENST00000594387	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.45	■■■□□ 2.15
IRF3-208	ENST00000594387	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		28.43	■■■□□ 2.14
IRF3-208	ENST00000594387	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
IRF3-208	ENST00000594387	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		28.4	■■■□□ 2.14
IRF3-208	ENST00000594387	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.38	■■■□□ 2.13
IRF3-208	ENST00000594387	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
IRF3-208	ENST00000594387	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
IRF3-208	ENST00000594387	KDM6B	O15054	1643 aa		28.36	■■■□□ 2.13
IRF3-208	ENST00000594387	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28.36	■■■□□ 2.13
IRF3-208	ENST00000594387	KCNH8	Q96L42	1107 aa		28.36	■■■□□ 2.13
IRF3-208	ENST00000594387	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		28.34	■■■□□ 2.13
IRF3-208	ENST00000594387	ATP10B	O94823	1461 aa		28.31	■■■□□ 2.12
IRF3-208	ENST00000594387	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
IRF3-208	ENST00000594387	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.29	■■■□□ 2.12
IRF3-208	ENST00000594387	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		28.29	■■■□□ 2.12
IRF3-208	ENST00000594387	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
IRF3-208	ENST00000594387	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.21	■■■□□ 2.11
IRF3-208	ENST00000594387	CD109	Q6YHK3	1445 aa		28.21	■■■□□ 2.11
IRF3-208	ENST00000594387	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.19	■■■□□ 2.1
IRF3-208	ENST00000594387	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.19	■■■□□ 2.1
IRF3-208	ENST00000594387	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		28.18	■■■□□ 2.1
IRF3-208	ENST00000594387	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.13	■■■□□ 2.09
IRF3-208	ENST00000594387	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.12	■■■□□ 2.09
IRF3-208	ENST00000594387	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		28.11	■■■□□ 2.09
IRF3-208	ENST00000594387	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28.11	■■■□□ 2.09
IRF3-208	ENST00000594387	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
IRF3-208	ENST00000594387	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
IRF3-208	ENST00000594387	CLIP1	P30622	1438 aa		28	■■■□□ 2.07
IRF3-208	ENST00000594387	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		27.98	■■■□□ 2.07
IRF3-208	ENST00000594387	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
IRF3-208	ENST00000594387	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		27.92	■■■□□ 2.06
IRF3-208	ENST00000594387	NEO1	Q92859	1461 aa		27.91	■■■□□ 2.06
IRF3-208	ENST00000594387	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		27.91	■■■□□ 2.06
IRF3-208	ENST00000594387	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	27.9	■■■□□ 2.06	3e-7	■□□□□ 11.1
IRF3-208	ENST00000594387	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		27.9	■■■□□ 2.06
IRF3-208	ENST00000594387	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
IRF3-208	ENST00000594387	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		27.9	■■■□□ 2.06
IRF3-208	ENST00000594387	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		27.89	■■■□□ 2.05
IRF3-208	ENST00000594387	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		27.86	■■■□□ 2.05
IRF3-208	ENST00000594387	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		27.84	■■■□□ 2.05
IRF3-208	ENST00000594387	KIF14	Q15058	1648 aa		27.84	■■■□□ 2.05
IRF3-208	ENST00000594387	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		27.83	■■■□□ 2.05
IRF3-208	ENST00000594387	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
IRF3-208	ENST00000594387	FANCA	O15360	1455 aa		27.81	■■■□□ 2.04
IRF3-208	ENST00000594387	CEP162	Q5TB80	1403 aa		27.77	■■■□□ 2.04
IRF3-208	ENST00000594387	AKNA	Q7Z591	1439 aa		27.77	■■■□□ 2.04
IRF3-208	ENST00000594387	PLCH2	O75038	1416 aa		27.75	■■■□□ 2.03
IRF3-208	ENST00000594387	RAPGEF3	O95398	923 aa		27.75	■■■□□ 2.03
IRF3-208	ENST00000594387	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
IRF3-208	ENST00000594387	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		27.73	■■■□□ 2.03
IRF3-208	ENST00000594387	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		27.73	■■■□□ 2.03
IRF3-208	ENST00000594387	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		27.71	■■■□□ 2.03
IRF3-208	ENST00000594387	RICTOR	Q6R327	1708 aa		27.68	■■■□□ 2.02
IRF3-208	ENST00000594387	ADGRL1	O94910	1474 aa		27.68	■■■□□ 2.02
IRF3-208	ENST00000594387	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		27.67	■■■□□ 2.02
IRF3-208	ENST00000594387	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		27.64	■■■□□ 2.01
IRF3-208	ENST00000594387	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		27.63	■■■□□ 2.01

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