RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592857.5

SLC25A39-216, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 3

Gene SLC25A39, Length 837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-216ENST00000592857 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
SLC25A39-216ENST00000592857 JPH4Q96JJ6 628 aa36.48■■■■□ 3.43
SLC25A39-216ENST00000592857 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.4■■■■□ 3.42
SLC25A39-216ENST00000592857 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.4■■■■□ 3.42
SLC25A39-216ENST00000592857 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.11■■■■□ 3.37
SLC25A39-216ENST00000592857 IQGAP2Q13576 1575 aa36.1■■■■□ 3.37
SLC25A39-216ENST00000592857 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.06■■■■□ 3.36
SLC25A39-216ENST00000592857 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.98■■■■□ 3.35
SLC25A39-216ENST00000592857 PTPRGP23470 1445 aa35.96■■■■□ 3.35
SLC25A39-216ENST00000592857 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.95■■■■□ 3.35
SLC25A39-216ENST00000592857 MAPKBP1O60336 1514 aa35.94■■■■□ 3.34
SLC25A39-216ENST00000592857 DISP1Q96F81 1524 aa35.94■■■■□ 3.34
SLC25A39-216ENST00000592857 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.94■■■■□ 3.34
SLC25A39-216ENST00000592857 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.92■■■■□ 3.34
SLC25A39-216ENST00000592857 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.89■■■■□ 3.34
SLC25A39-216ENST00000592857 PRXQ9BXM0 1461 aa35.88■■■■□ 3.33
SLC25A39-216ENST00000592857 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.86■■■■□ 3.33
SLC25A39-216ENST00000592857 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
SLC25A39-216ENST00000592857 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.8■■■■□ 3.32
SLC25A39-216ENST00000592857 DIP2BQ9P265 1576 aa35.8■■■■□ 3.32
SLC25A39-216ENST00000592857 KIAA0556O60303 1618 aa35.79■■■■□ 3.32
SLC25A39-216ENST00000592857 ABCC2Q92887 1545 aa35.76■■■■□ 3.31
SLC25A39-216ENST00000592857 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.75■■■■□ 3.31
SLC25A39-216ENST00000592857 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.75■■■■□ 3.31
SLC25A39-216ENST00000592857 UACAQ9BZF9 1416 aa35.72■■■■□ 3.31
SLC25A39-216ENST00000592857 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.63■■■■□ 3.29
SLC25A39-216ENST00000592857 GOLGA3Q08378 1498 aa35.6■■■■□ 3.29
SLC25A39-216ENST00000592857 ASXL2Q76L83 1435 aa35.58■■■■□ 3.29
SLC25A39-216ENST00000592857 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.58■■■■□ 3.29
SLC25A39-216ENST00000592857 EEA1Q15075 1411 aa35.57■■■■□ 3.28
SLC25A39-216ENST00000592857 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.55■■■■□ 3.28
SLC25A39-216ENST00000592857 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
SLC25A39-216ENST00000592857 GLI2P10070 1586 aa35.47■■■■□ 3.27
SLC25A39-216ENST00000592857 ABCA8O94911 1581 aa35.45■■■■□ 3.27
SLC25A39-216ENST00000592857 TSPOAP1O95153 1857 aa35.45■■■■□ 3.27
SLC25A39-216ENST00000592857 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
SLC25A39-216ENST00000592857 SAMD9Q5K651 1589 aa35.36■■■■□ 3.25
SLC25A39-216ENST00000592857 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
SLC25A39-216ENST00000592857 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
SLC25A39-216ENST00000592857 KDM6BO15054 1643 aa35.34■■■■□ 3.25
SLC25A39-216ENST00000592857 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.32■■■■□ 3.24
SLC25A39-216ENST00000592857 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.31■■■■□ 3.24
SLC25A39-216ENST00000592857 KIF21BO75037 1637 aa35.29■■■■□ 3.24
SLC25A39-216ENST00000592857 P3H3Q8IVL6 736 aa35.29■■■■□ 3.24
SLC25A39-216ENST00000592857 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.28■■■■□ 3.24
SLC25A39-216ENST00000592857 ATP10BO94823 1461 aa35.14■■■■□ 3.22
SLC25A39-216ENST00000592857 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
SLC25A39-216ENST00000592857 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.11■■■■□ 3.21
SLC25A39-216ENST00000592857 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.11■■■■□ 3.21
SLC25A39-216ENST00000592857 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.11■■■■□ 3.21
SLC25A39-216ENST00000592857 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
SLC25A39-216ENST00000592857 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
SLC25A39-216ENST00000592857 ARID3CA6NKF2 412 aa35.08■■■■□ 3.21
SLC25A39-216ENST00000592857 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.06■■■■□ 3.2
SLC25A39-216ENST00000592857 KCNH8Q96L42 1107 aa35.05■■■■□ 3.2
SLC25A39-216ENST00000592857 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.05■■■■□ 3.2
SLC25A39-216ENST00000592857 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.02■■■■□ 3.2
SLC25A39-216ENST00000592857 CD109Q6YHK3 1445 aa35.02■■■■□ 3.2
SLC25A39-216ENST00000592857 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
SLC25A39-216ENST00000592857 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.93■■■■□ 3.18
SLC25A39-216ENST00000592857 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
SLC25A39-216ENST00000592857 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.88■■■■□ 3.17
SLC25A39-216ENST00000592857 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.84■■■■□ 3.17
SLC25A39-216ENST00000592857 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
SLC25A39-216ENST00000592857 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
SLC25A39-216ENST00000592857 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.81■■■■□ 3.16
SLC25A39-216ENST00000592857 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.73■■■■□ 3.15
SLC25A39-216ENST00000592857 FMN1Q68DA7 1419 aa34.7■■■■□ 3.15
SLC25A39-216ENST00000592857 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.14
SLC25A39-216ENST00000592857 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.69■■■■□ 3.14
SLC25A39-216ENST00000592857 ADGRL1O94910 1474 aa34.66■■■■□ 3.14
SLC25A39-216ENST00000592857 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.66■■■■□ 3.14
SLC25A39-216ENST00000592857 NEO1Q92859 1461 aa34.65■■■■□ 3.14
SLC25A39-216ENST00000592857 HECW1Q76N89 1606 aa34.63■■■■□ 3.13
SLC25A39-216ENST00000592857 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.61■■■■□ 3.134e-7■■■□□ 16.9
SLC25A39-216ENST00000592857 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.57■■■■□ 3.13
SLC25A39-216ENST00000592857 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.51■■■■□ 3.12
SLC25A39-216ENST00000592857 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
SLC25A39-216ENST00000592857 RAPGEF3O95398 923 aa34.49■■■■□ 3.11
SLC25A39-216ENST00000592857 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.47■■■■□ 3.11
SLC25A39-216ENST00000592857 FANCAO15360 1455 aa34.46■■■■□ 3.11
SLC25A39-216ENST00000592857 AKNAQ7Z591 1439 aa34.44■■■■□ 3.1
SLC25A39-216ENST00000592857 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.44■■■■□ 3.1
SLC25A39-216ENST00000592857 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
SLC25A39-216ENST00000592857 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.4■■■■□ 3.1
SLC25A39-216ENST00000592857 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
SLC25A39-216ENST00000592857 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
SLC25A39-216ENST00000592857 PLCH2O75038 1416 aa34.38■■■■□ 3.09
SLC25A39-216ENST00000592857 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
SLC25A39-216ENST00000592857 KIF14Q15058 1648 aa34.38■■■■□ 3.09
SLC25A39-216ENST00000592857 RICTORQ6R327 1708 aa34.38■■■■□ 3.09
SLC25A39-216ENST00000592857 CLIP1P30622 1438 aa34.36■■■■□ 3.09
SLC25A39-216ENST00000592857 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.3■■■■□ 3.08
SLC25A39-216ENST00000592857 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.3■■■■□ 3.08
SLC25A39-216ENST00000592857 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.29■■■■□ 3.08
SLC25A39-216ENST00000592857 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.28■■■■□ 3.08
SLC25A39-216ENST00000592857 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.28■■■■□ 3.08
SLC25A39-216ENST00000592857 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.22■■■■□ 3.07
SLC25A39-216ENST00000592857 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.21■■■■□ 3.07
SLC25A39-216ENST00000592857 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.2■■■■□ 3.07
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