RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591964.5

PQLC1-213, Transcript of PQ loop repeat containing 1, human

TSL 3

Gene PQLC1, Length 856 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PQLC1-213	ENST00000591964	JPH4	Q96JJ6	628 aa		43.83	■■■■■ 4.61
PQLC1-213	ENST00000591964	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	43.81	■■■■■ 4.6
PQLC1-213	ENST00000591964	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		43.69	■■■■■ 4.59
PQLC1-213	ENST00000591964	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		43.67	■■■■■ 4.58
PQLC1-213	ENST00000591964	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		43.35	■■■■■ 4.53
PQLC1-213	ENST00000591964	IQGAP2	Q13576	1575 aa		43.33	■■■■■ 4.53
PQLC1-213	ENST00000591964	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		43.25	■■■■■ 4.51
PQLC1-213	ENST00000591964	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		43.24	■■■■■ 4.51
PQLC1-213	ENST00000591964	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	43.24	■■■■■ 4.51
PQLC1-213	ENST00000591964	PTPRG	P23470	1445 aa		43.19	■■■■■ 4.5
PQLC1-213	ENST00000591964	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		43.15	■■■■■ 4.5
PQLC1-213	ENST00000591964	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		43.15	■■■■■ 4.5
PQLC1-213	ENST00000591964	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	43.12	■■■■■ 4.49
PQLC1-213	ENST00000591964	MAPKBP1	O60336	1514 aa		43.1	■■■■■ 4.49
PQLC1-213	ENST00000591964	DISP1	Q96F81	1524 aa		43.07	■■■■■ 4.48
PQLC1-213	ENST00000591964	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		43.06	■■■■■ 4.48
PQLC1-213	ENST00000591964	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		43.02	■■■■■ 4.48
PQLC1-213	ENST00000591964	PRX	Q9BXM0	1461 aa		43	■■■■■ 4.47
PQLC1-213	ENST00000591964	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		43	■■■■■ 4.47
PQLC1-213	ENST00000591964	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		42.96	■■■■■ 4.47
PQLC1-213	ENST00000591964	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.93	■■■■■ 4.46
PQLC1-213	ENST00000591964	DIP2B	Q9P265	1576 aa		42.91	■■■■■ 4.46
PQLC1-213	ENST00000591964	ABCC2	Q92887	1545 aa		42.89	■■■■■ 4.46
PQLC1-213	ENST00000591964	UACA	Q9BZF9	1416 aa		42.87	■■■■■ 4.45
PQLC1-213	ENST00000591964	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		42.87	■■■■■ 4.45
PQLC1-213	ENST00000591964	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		42.81	■■■■■ 4.44
PQLC1-213	ENST00000591964	GOLGA3	Q08378	1498 aa		42.77	■■■■■ 4.44
PQLC1-213	ENST00000591964	EEA1	Q15075	1411 aa		42.71	■■■■■ 4.43
PQLC1-213	ENST00000591964	ASXL2	Q76L83	1435 aa		42.7	■■■■■ 4.43
PQLC1-213	ENST00000591964	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		42.68	■■■■■ 4.42
PQLC1-213	ENST00000591964	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		42.66	■■■■■ 4.42
PQLC1-213	ENST00000591964	TSPOAP1	O95153	1857 aa		42.66	■■■■■ 4.42
PQLC1-213	ENST00000591964	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	42.6	■■■■■ 4.41
PQLC1-213	ENST00000591964	GLI2	P10070	1586 aa		42.53	■■■■■ 4.4
PQLC1-213	ENST00000591964	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.52	■■■■■ 4.4
PQLC1-213	ENST00000591964	ABCA8	O94911	1581 aa		42.5	■■■■■ 4.39
PQLC1-213	ENST00000591964	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	42.44	■■■■■ 4.38
PQLC1-213	ENST00000591964	KDM6B	O15054	1643 aa		42.43	■■■■■ 4.38
PQLC1-213	ENST00000591964	P3H3	Q8IVL6	736 aa		42.43	■■■■■ 4.38
PQLC1-213	ENST00000591964	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		42.4	■■■■■ 4.38
PQLC1-213	ENST00000591964	SAMD9	Q5K651	1589 aa		42.39	■■■■■ 4.38
PQLC1-213	ENST00000591964	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	42.37	■■■■■ 4.37
PQLC1-213	ENST00000591964	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		42.36	■■■■■ 4.37
PQLC1-213	ENST00000591964	KIF21B	O75037	1637 aa		42.35	■■■■■ 4.37
PQLC1-213	ENST00000591964	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		42.33	■■■■■ 4.37
PQLC1-213	ENST00000591964	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	42.31	■■■■■ 4.36
PQLC1-213	ENST00000591964	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	42.25	■■■■■ 4.35
PQLC1-213	ENST00000591964	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		42.18	■■■■■ 4.34
PQLC1-213	ENST00000591964	KCNH8	Q96L42	1107 aa		42.17	■■■■■ 4.34
PQLC1-213	ENST00000591964	ARID3C	A6NKF2	412 aa		42.16	■■■■■ 4.34
PQLC1-213	ENST00000591964	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		42.16	■■■■■ 4.34
PQLC1-213	ENST00000591964	ATP10B	O94823	1461 aa		42.15	■■■■■ 4.34
PQLC1-213	ENST00000591964	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		42.11	■■■■■ 4.33
PQLC1-213	ENST00000591964	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		42.1	■■■■■ 4.33
PQLC1-213	ENST00000591964	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		42.07	■■■■■ 4.33
PQLC1-213	ENST00000591964	CD109	Q6YHK3	1445 aa		42.06	■■■■■ 4.32
PQLC1-213	ENST00000591964	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		42.05	■■■■■ 4.32
PQLC1-213	ENST00000591964	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	42.03	■■■■■ 4.32
PQLC1-213	ENST00000591964	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.01	■■■■■ 4.32
PQLC1-213	ENST00000591964	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42	■■■■■ 4.31
PQLC1-213	ENST00000591964	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	41.98	■■■■■ 4.31
PQLC1-213	ENST00000591964	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	41.96	■■■■■ 4.31
PQLC1-213	ENST00000591964	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.96	■■■■■ 4.31
PQLC1-213	ENST00000591964	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		41.85	■■■■■ 4.29
PQLC1-213	ENST00000591964	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		41.78	■■■■■ 4.28
PQLC1-213	ENST00000591964	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		41.74	■■■■■ 4.27
PQLC1-213	ENST00000591964	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		41.74	■■■■■ 4.27
PQLC1-213	ENST00000591964	FMN1	Q68DA7	1419 aa		41.69	■■■■■ 4.27
PQLC1-213	ENST00000591964	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		41.66	■■■■■ 4.26
PQLC1-213	ENST00000591964	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		41.63	■■■■■ 4.26
PQLC1-213	ENST00000591964	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	41.61	■■■■■ 4.25
PQLC1-213	ENST00000591964	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	41.59	■■■■■ 4.25
PQLC1-213	ENST00000591964	NEO1	Q92859	1461 aa		41.59	■■■■■ 4.25
PQLC1-213	ENST00000591964	HECW1	Q76N89	1606 aa		41.58	■■■■■ 4.25
PQLC1-213	ENST00000591964	ADGRL1	O94910	1474 aa		41.58	■■■■■ 4.25
PQLC1-213	ENST00000591964	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	41.52	■■■■■ 4.24
PQLC1-213	ENST00000591964	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		41.46	■■■■■ 4.23
PQLC1-213	ENST00000591964	RAPGEF3	O95398	923 aa		41.43	■■■■■ 4.22
PQLC1-213	ENST00000591964	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	41.4	■■■■■ 4.22
PQLC1-213	ENST00000591964	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		41.4	■■■■■ 4.22
PQLC1-213	ENST00000591964	FANCA	O15360	1455 aa		41.38	■■■■■ 4.21
PQLC1-213	ENST00000591964	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		41.35	■■■■■ 4.21
PQLC1-213	ENST00000591964	AKNA	Q7Z591	1439 aa		41.35	■■■■■ 4.21
PQLC1-213	ENST00000591964	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		41.34	■■■■■ 4.21
PQLC1-213	ENST00000591964	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	41.29	■■■■■ 4.2
PQLC1-213	ENST00000591964	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		41.28	■■■■■ 4.2
PQLC1-213	ENST00000591964	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	41.28	■■■■■ 4.2
PQLC1-213	ENST00000591964	CLIP1	P30622	1438 aa		41.27	■■■■■ 4.2
PQLC1-213	ENST00000591964	RICTOR	Q6R327	1708 aa		41.26	■■■■■ 4.2
PQLC1-213	ENST00000591964	PLCH2	O75038	1416 aa		41.26	■■■■■ 4.19
PQLC1-213	ENST00000591964	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	41.26	■■■■■ 4.19
PQLC1-213	ENST00000591964	KIF14	Q15058	1648 aa		41.24	■■■■■ 4.19
PQLC1-213	ENST00000591964	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		41.23	■■■■■ 4.19
PQLC1-213	ENST00000591964	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		41.21	■■■■■ 4.19
PQLC1-213	ENST00000591964	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		41.15	■■■■■ 4.18
PQLC1-213	ENST00000591964	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		41.12	■■■■■ 4.17
PQLC1-213	ENST00000591964	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		41.11	■■■■■ 4.17
PQLC1-213	ENST00000591964	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		41.09	■■■■■ 4.17
PQLC1-213	ENST00000591964	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		41.09	■■■■■ 4.17
PQLC1-213	ENST00000591964	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	41.04	■■■■■ 4.16

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