RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591762.1

SPHK1-209, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPHK1, Length 2,502 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-209ENST00000591762 CUL7Q14999 1698 aa26.44■■□□□ 1.82
SPHK1-209ENST00000591762 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SPHK1-209ENST00000591762 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.42■■□□□ 1.82
SPHK1-209ENST00000591762 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.41■■□□□ 1.82
SPHK1-209ENST00000591762 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
SPHK1-209ENST00000591762 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.37■■□□□ 1.81
SPHK1-209ENST00000591762 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SPHK1-209ENST00000591762 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.36■■□□□ 1.81
SPHK1-209ENST00000591762 MYT1Q01538 1121 aa26.35■■□□□ 1.81
SPHK1-209ENST00000591762 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
SPHK1-209ENST00000591762 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.812e-14■■■■■ 57.5
SPHK1-209ENST00000591762 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.28■■□□□ 1.8
SPHK1-209ENST00000591762 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.28■■□□□ 1.8
SPHK1-209ENST00000591762 TIAM1Q13009 1591 aa26.24■■□□□ 1.79
SPHK1-209ENST00000591762 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SPHK1-209ENST00000591762 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.21■■□□□ 1.79
SPHK1-209ENST00000591762 ITGAEP38570 1179 aa26.21■■□□□ 1.79
SPHK1-209ENST00000591762 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
SPHK1-209ENST00000591762 ERCC6Q03468 1493 aa26.2■■□□□ 1.78
SPHK1-209ENST00000591762 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
SPHK1-209ENST00000591762 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
SPHK1-209ENST00000591762 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.18■■□□□ 1.78
SPHK1-209ENST00000591762 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.18■■□□□ 1.78
SPHK1-209ENST00000591762 MAP3K1Q13233 1512 aa26.17■■□□□ 1.78
SPHK1-209ENST00000591762 PBRM1Q86U86 1689 aa26.16■■□□□ 1.78
SPHK1-209ENST00000591762 WDR62O43379 1518 aa26.15■■□□□ 1.78
SPHK1-209ENST00000591762 IFT140Q96RY7 1462 aa26.12■■□□□ 1.77
SPHK1-209ENST00000591762 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.11■■□□□ 1.77
SPHK1-209ENST00000591762 GRIN2BQ13224 1484 aa26.11■■□□□ 1.77
SPHK1-209ENST00000591762 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.1■■□□□ 1.77
SPHK1-209ENST00000591762 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.09■■□□□ 1.77
SPHK1-209ENST00000591762 FMN1Q68DA7 1419 aa26.09■■□□□ 1.77
SPHK1-209ENST00000591762 MIER1Q8N108 512 aa26.07■■□□□ 1.76
SPHK1-209ENST00000591762 ADAMTS12P58397 1594 aa26.06■■□□□ 1.76
SPHK1-209ENST00000591762 SAMD9Q5K651 1589 aa26.06■■□□□ 1.76
SPHK1-209ENST00000591762 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.05■■□□□ 1.76
SPHK1-209ENST00000591762 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
SPHK1-209ENST00000591762 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.02■■□□□ 1.76
SPHK1-209ENST00000591762 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SPHK1-209ENST00000591762 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
SPHK1-209ENST00000591762 IQGAP2Q13576 1575 aa25.94■■□□□ 1.74
SPHK1-209ENST00000591762 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SPHK1-209ENST00000591762 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.93■■□□□ 1.74
SPHK1-209ENST00000591762 FBLN2P98095 1184 aa25.89■■□□□ 1.73
SPHK1-209ENST00000591762 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.88■■□□□ 1.73
SPHK1-209ENST00000591762 ARID3CA6NKF2 412 aa25.87■■□□□ 1.73
SPHK1-209ENST00000591762 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
SPHK1-209ENST00000591762 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.84■■□□□ 1.73
SPHK1-209ENST00000591762 GRIN2AQ12879 1464 aa25.83■■□□□ 1.73
SPHK1-209ENST00000591762 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.8■■□□□ 1.72
SPHK1-209ENST00000591762 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.79■■□□□ 1.72
SPHK1-209ENST00000591762 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.77■■□□□ 1.72
SPHK1-209ENST00000591762 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.77■■□□□ 1.72
SPHK1-209ENST00000591762 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.76■■□□□ 1.71
SPHK1-209ENST00000591762 NCOA2Q15596 1464 aa25.75■■□□□ 1.71
SPHK1-209ENST00000591762 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SPHK1-209ENST00000591762 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.73■■□□□ 1.71
SPHK1-209ENST00000591762 DISP1Q96F81 1524 aa25.72■■□□□ 1.71
SPHK1-209ENST00000591762 SYNJ2O15056 1496 aa25.71■■□□□ 1.71
SPHK1-209ENST00000591762 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
SPHK1-209ENST00000591762 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
SPHK1-209ENST00000591762 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.7■■□□□ 1.7
SPHK1-209ENST00000591762 HECW1Q76N89 1606 aa25.69■■□□□ 1.7
SPHK1-209ENST00000591762 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.68■■□□□ 1.7
SPHK1-209ENST00000591762 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.73e-6■■□□□ 11.8
SPHK1-209ENST00000591762 KIAA0556O60303 1618 aa25.67■■□□□ 1.7
SPHK1-209ENST00000591762 CEP170Q5SW79 1584 aa25.67■■□□□ 1.7
SPHK1-209ENST00000591762 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.66■■□□□ 1.7
SPHK1-209ENST00000591762 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
SPHK1-209ENST00000591762 PTPRKQ15262 1439 aa25.62■■□□□ 1.69
SPHK1-209ENST00000591762 JPH4Q96JJ6 628 aa25.61■■□□□ 1.69
SPHK1-209ENST00000591762 MAPKBP1O60336 1514 aa25.58■■□□□ 1.69
SPHK1-209ENST00000591762 ARHGEF11O15085 1522 aa25.56■■□□□ 1.68
SPHK1-209ENST00000591762 NUP160Q12769 1436 aa25.55■■□□□ 1.68
SPHK1-209ENST00000591762 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
SPHK1-209ENST00000591762 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.53■■□□□ 1.68
SPHK1-209ENST00000591762 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.53■■□□□ 1.68
SPHK1-209ENST00000591762 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.52■■□□□ 1.68
SPHK1-209ENST00000591762 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.5■■□□□ 1.67
SPHK1-209ENST00000591762 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.5■■□□□ 1.67
SPHK1-209ENST00000591762 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.48■■□□□ 1.67
SPHK1-209ENST00000591762 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.47■■□□□ 1.67
SPHK1-209ENST00000591762 HFM1A2PYH4 1435 aa25.45■■□□□ 1.66
SPHK1-209ENST00000591762 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SPHK1-209ENST00000591762 NAIPQ13075 1403 aa25.43■■□□□ 1.66
SPHK1-209ENST00000591762 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SPHK1-209ENST00000591762 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SPHK1-209ENST00000591762 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
SPHK1-209ENST00000591762 MIA2Q96PC5 1412 aa25.38■■□□□ 1.65
SPHK1-209ENST00000591762 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SPHK1-209ENST00000591762 UACAQ9BZF9 1416 aa25.32■■□□□ 1.64
SPHK1-209ENST00000591762 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SPHK1-209ENST00000591762 TRIM52Q96A61 297 aa25.28■■□□□ 1.64
SPHK1-209ENST00000591762 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SPHK1-209ENST00000591762 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SPHK1-209ENST00000591762 CHD1O14646 1710 aa25.26■■□□□ 1.63
SPHK1-209ENST00000591762 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.25■■□□□ 1.63
SPHK1-209ENST00000591762 PTPRGP23470 1445 aa25.24■■□□□ 1.63
SPHK1-209ENST00000591762 DAPK1P53355 1430 aa25.23■■□□□ 1.63
SPHK1-209ENST00000591762 KIF14Q15058 1648 aa25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms