RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591387.5

CTIF-209, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-209ENST00000591387 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.99■■■□□ 2.55
CTIF-209ENST00000591387 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
CTIF-209ENST00000591387 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.94■■■□□ 2.54
CTIF-209ENST00000591387 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.93■■■□□ 2.54
CTIF-209ENST00000591387 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.7■■■□□ 2.51
CTIF-209ENST00000591387 IQGAP2Q13576 1575 aa30.66■■■□□ 2.5
CTIF-209ENST00000591387 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.63■■■□□ 2.49
CTIF-209ENST00000591387 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.61■■■□□ 2.49
CTIF-209ENST00000591387 PTPRGP23470 1445 aa30.56■■■□□ 2.48
CTIF-209ENST00000591387 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.55■■■□□ 2.48
CTIF-209ENST00000591387 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.54■■■□□ 2.48
CTIF-209ENST00000591387 MAPKBP1O60336 1514 aa30.5■■■□□ 2.47
CTIF-209ENST00000591387 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.49■■■□□ 2.47
CTIF-209ENST00000591387 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.48■■■□□ 2.47
CTIF-209ENST00000591387 PRXQ9BXM0 1461 aa30.47■■■□□ 2.47
CTIF-209ENST00000591387 DISP1Q96F81 1524 aa30.47■■■□□ 2.47
CTIF-209ENST00000591387 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.44■■■□□ 2.46
CTIF-209ENST00000591387 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.42■■■□□ 2.46
CTIF-209ENST00000591387 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
CTIF-209ENST00000591387 KIAA0556O60303 1618 aa30.36■■■□□ 2.45
CTIF-209ENST00000591387 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.36■■■□□ 2.45
CTIF-209ENST00000591387 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.36■■■□□ 2.45
CTIF-209ENST00000591387 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.35■■■□□ 2.45
CTIF-209ENST00000591387 ABCC2Q92887 1545 aa30.35■■■□□ 2.45
CTIF-209ENST00000591387 UACAQ9BZF9 1416 aa30.34■■■□□ 2.45
CTIF-209ENST00000591387 DIP2BQ9P265 1576 aa30.32■■■□□ 2.45
CTIF-209ENST00000591387 EEA1Q15075 1411 aa30.32■■■□□ 2.44
CTIF-209ENST00000591387 GOLGA3Q08378 1498 aa30.31■■■□□ 2.44
CTIF-209ENST00000591387 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.22■■■□□ 2.43
CTIF-209ENST00000591387 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.21■■■□□ 2.43
CTIF-209ENST00000591387 ASXL2Q76L83 1435 aa30.19■■■□□ 2.42
CTIF-209ENST00000591387 GLI2P10070 1586 aa30.11■■■□□ 2.41
CTIF-209ENST00000591387 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
CTIF-209ENST00000591387 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
CTIF-209ENST00000591387 TSPOAP1O95153 1857 aa30.1■■■□□ 2.41
CTIF-209ENST00000591387 ABCA8O94911 1581 aa30.07■■■□□ 2.4
CTIF-209ENST00000591387 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.06■■■□□ 2.4
CTIF-209ENST00000591387 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
CTIF-209ENST00000591387 SAMD9Q5K651 1589 aa30.01■■■□□ 2.39
CTIF-209ENST00000591387 KIF21BO75037 1637 aa30■■■□□ 2.39
CTIF-209ENST00000591387 KDM6BO15054 1643 aa29.98■■■□□ 2.39
CTIF-209ENST00000591387 P3H3Q8IVL6 736 aa29.97■■■□□ 2.39
CTIF-209ENST00000591387 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.96■■■□□ 2.39
CTIF-209ENST00000591387 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
CTIF-209ENST00000591387 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.93■■■□□ 2.38
CTIF-209ENST00000591387 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.86■■■□□ 2.37
CTIF-209ENST00000591387 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
CTIF-209ENST00000591387 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.82■■■□□ 2.36
CTIF-209ENST00000591387 ATP10BO94823 1461 aa29.82■■■□□ 2.36
CTIF-209ENST00000591387 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.81■■■□□ 2.36
CTIF-209ENST00000591387 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
CTIF-209ENST00000591387 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.79■■■□□ 2.36
CTIF-209ENST00000591387 KCNH8Q96L42 1107 aa29.79■■■□□ 2.36
CTIF-209ENST00000591387 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.77■■■□□ 2.36
CTIF-209ENST00000591387 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
CTIF-209ENST00000591387 CD109Q6YHK3 1445 aa29.75■■■□□ 2.35
CTIF-209ENST00000591387 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.74■■■□□ 2.35
CTIF-209ENST00000591387 ARID3CA6NKF2 412 aa29.73■■■□□ 2.35
CTIF-209ENST00000591387 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
CTIF-209ENST00000591387 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
CTIF-209ENST00000591387 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
CTIF-209ENST00000591387 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
CTIF-209ENST00000591387 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.63■■■□□ 2.33
CTIF-209ENST00000591387 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.61■■■□□ 2.33
CTIF-209ENST00000591387 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.57■■■□□ 2.32
CTIF-209ENST00000591387 FMN1Q68DA7 1419 aa29.55■■■□□ 2.32
CTIF-209ENST00000591387 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.55■■■□□ 2.32
CTIF-209ENST00000591387 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.54■■■□□ 2.32
CTIF-209ENST00000591387 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.5■■■□□ 2.31
CTIF-209ENST00000591387 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.49■■■□□ 2.31
CTIF-209ENST00000591387 NEO1Q92859 1461 aa29.45■■■□□ 2.31
CTIF-209ENST00000591387 HECW1Q76N89 1606 aa29.44■■■□□ 2.3
CTIF-209ENST00000591387 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
CTIF-209ENST00000591387 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
CTIF-209ENST00000591387 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.36■■■□□ 2.291e-7■■■■■ 28.6
CTIF-209ENST00000591387 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
CTIF-209ENST00000591387 ADGRL1O94910 1474 aa29.35■■■□□ 2.29
CTIF-209ENST00000591387 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.3■■■□□ 2.28
CTIF-209ENST00000591387 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.29■■■□□ 2.28
CTIF-209ENST00000591387 RAPGEF3O95398 923 aa29.27■■■□□ 2.28
CTIF-209ENST00000591387 FANCAO15360 1455 aa29.27■■■□□ 2.28
CTIF-209ENST00000591387 AKNAQ7Z591 1439 aa29.26■■■□□ 2.27
CTIF-209ENST00000591387 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.25■■■□□ 2.27
CTIF-209ENST00000591387 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.23■■■□□ 2.27
CTIF-209ENST00000591387 PLCH2O75038 1416 aa29.22■■■□□ 2.27
CTIF-209ENST00000591387 CLIP1P30622 1438 aa29.22■■■□□ 2.27
CTIF-209ENST00000591387 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CTIF-209ENST00000591387 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CTIF-209ENST00000591387 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.2■■■□□ 2.26
CTIF-209ENST00000591387 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.2■■■□□ 2.26
CTIF-209ENST00000591387 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
CTIF-209ENST00000591387 KIF14Q15058 1648 aa29.18■■■□□ 2.26
CTIF-209ENST00000591387 RICTORQ6R327 1708 aa29.17■■■□□ 2.26
CTIF-209ENST00000591387 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.17■■■□□ 2.26
CTIF-209ENST00000591387 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.15■■■□□ 2.26
CTIF-209ENST00000591387 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.13■■■□□ 2.25
CTIF-209ENST00000591387 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.08■■■□□ 2.25
CTIF-209ENST00000591387 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.07■■■□□ 2.24
CTIF-209ENST00000591387 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.06■■■□□ 2.24
CTIF-209ENST00000591387 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.06■■■□□ 2.24
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