RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591387.5

CTIF-209, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-209ENST00000591387 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.51■■■■■ 4.72
CTIF-209ENST00000591387 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.82■■■■□ 3.96
CTIF-209ENST00000591387 ABCC9O60706 1549 aa39.32■■■■□ 3.89
CTIF-209ENST00000591387 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.69■■■■□ 3.62
CTIF-209ENST00000591387 NACADO15069 1562 aa37.55■■■■□ 3.6
CTIF-209ENST00000591387 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.35■■■■□ 3.57
CTIF-209ENST00000591387 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.2■■■■□ 3.55
CTIF-209ENST00000591387 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
CTIF-209ENST00000591387 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.85■■■■□ 3.49
CTIF-209ENST00000591387 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.81■■■■□ 3.48
CTIF-209ENST00000591387 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.65■■■■□ 3.46
CTIF-209ENST00000591387 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.52■■■■□ 3.44
CTIF-209ENST00000591387 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.51■■■■□ 3.44
CTIF-209ENST00000591387 SCRIBQ14160 1630 aa36.19■■■■□ 3.38
CTIF-209ENST00000591387 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.19■■■■□ 3.38
CTIF-209ENST00000591387 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
CTIF-209ENST00000591387 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.57■■■■□ 3.29
CTIF-209ENST00000591387 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.41■■■■□ 3.26
CTIF-209ENST00000591387 NCAPD3P42695 1498 aa34.65■■■■□ 3.14
CTIF-209ENST00000591387 SMARCA4P51532 1647 aa34.63■■■■□ 3.13
CTIF-209ENST00000591387 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.56■■■■□ 3.12
CTIF-209ENST00000591387 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
CTIF-209ENST00000591387 SMARCA2P51531 1590 aa34.53■■■■□ 3.12
CTIF-209ENST00000591387 HMGXB3Q12766 1538 aa34.42■■■■□ 3.1
CTIF-209ENST00000591387 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.33■■■■□ 3.09
CTIF-209ENST00000591387 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.26■■■■□ 3.07
CTIF-209ENST00000591387 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
CTIF-209ENST00000591387 ERCC6Q03468 1493 aa33.96■■■■□ 3.03
CTIF-209ENST00000591387 NESP48681 1621 aa33.87■■■■□ 3.01
CTIF-209ENST00000591387 WIZO95785 1651 aa33.87■■■■□ 3.01
CTIF-209ENST00000591387 CUX2O14529 1486 aa33.82■■■■□ 3
CTIF-209ENST00000591387 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.81■■■■□ 3
CTIF-209ENST00000591387 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
CTIF-209ENST00000591387 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.61■■■□□ 2.97
CTIF-209ENST00000591387 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.6■■■□□ 2.97
CTIF-209ENST00000591387 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
CTIF-209ENST00000591387 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
CTIF-209ENST00000591387 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.49■■■□□ 2.95
CTIF-209ENST00000591387 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.33■■■□□ 2.93
CTIF-209ENST00000591387 CFTRP13569 1480 aa33.3■■■□□ 2.92
CTIF-209ENST00000591387 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.25■■■□□ 2.91
CTIF-209ENST00000591387 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.2■■■□□ 2.91
CTIF-209ENST00000591387 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.18■■■□□ 2.9
CTIF-209ENST00000591387 WDR62O43379 1518 aa33.16■■■□□ 2.9
CTIF-209ENST00000591387 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.11■■■□□ 2.89
CTIF-209ENST00000591387 PRDM2Q13029 1718 aa33.04■■■□□ 2.88
CTIF-209ENST00000591387 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.87■■■□□ 2.85
CTIF-209ENST00000591387 ABCC8Q09428 1581 aa32.66■■■□□ 2.82
CTIF-209ENST00000591387 TOPBP1Q92547 1522 aa32.61■■■□□ 2.81
CTIF-209ENST00000591387 IFT140Q96RY7 1462 aa32.54■■■□□ 2.8
CTIF-209ENST00000591387 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.54■■■□□ 2.8
CTIF-209ENST00000591387 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
CTIF-209ENST00000591387 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
CTIF-209ENST00000591387 OSCARQ8IYS5 282 aa32.34■■■□□ 2.77
CTIF-209ENST00000591387 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
CTIF-209ENST00000591387 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
CTIF-209ENST00000591387 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
CTIF-209ENST00000591387 SOGA1O94964 1423 aa32.17■■■□□ 2.74
CTIF-209ENST00000591387 CUX1P39880 1505 aa32.16■■■□□ 2.74
CTIF-209ENST00000591387 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.15■■■□□ 2.74
CTIF-209ENST00000591387 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.14■■■□□ 2.74
CTIF-209ENST00000591387 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.13■■■□□ 2.73
CTIF-209ENST00000591387 WDR97A6NE52 1622 aa32.08■■■□□ 2.73
CTIF-209ENST00000591387 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
CTIF-209ENST00000591387 TRIM41Q8WV44 630 aa31.95■■■□□ 2.71
CTIF-209ENST00000591387 CHD1O14646 1710 aa31.95■■■□□ 2.7
CTIF-209ENST00000591387 FBLN2P98095 1184 aa31.87■■■□□ 2.69
CTIF-209ENST00000591387 GRIN2BQ13224 1484 aa31.86■■■□□ 2.69
CTIF-209ENST00000591387 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.85■■■□□ 2.69
CTIF-209ENST00000591387 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.84■■■□□ 2.69
CTIF-209ENST00000591387 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
CTIF-209ENST00000591387 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.82■■■□□ 2.689e-6■■■■■ 50.1
CTIF-209ENST00000591387 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.82■■■□□ 2.68
CTIF-209ENST00000591387 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.82■■■□□ 2.68
CTIF-209ENST00000591387 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.82■■■□□ 2.68
CTIF-209ENST00000591387 TOP2BQ02880 1626 aa31.8■■■□□ 2.68
CTIF-209ENST00000591387 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.8■■■□□ 2.68
CTIF-209ENST00000591387 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.79■■■□□ 2.68
CTIF-209ENST00000591387 ARHGEF11O15085 1522 aa31.76■■■□□ 2.68
CTIF-209ENST00000591387 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
CTIF-209ENST00000591387 PBRM1Q86U86 1689 aa31.74■■■□□ 2.67
CTIF-209ENST00000591387 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.74■■■□□ 2.67
CTIF-209ENST00000591387 SYNJ1O43426 1573 aa31.72■■■□□ 2.67
CTIF-209ENST00000591387 SYNJ2O15056 1496 aa31.71■■■□□ 2.67
CTIF-209ENST00000591387 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.59■■■□□ 2.65
CTIF-209ENST00000591387 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.51■■■□□ 2.63
CTIF-209ENST00000591387 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.46■■■□□ 2.63
CTIF-209ENST00000591387 ARAP1Q96P48 1450 aa31.46■■■□□ 2.63
CTIF-209ENST00000591387 ADAMTS12P58397 1594 aa31.45■■■□□ 2.63
CTIF-209ENST00000591387 GRIN2AQ12879 1464 aa31.43■■■□□ 2.62
CTIF-209ENST00000591387 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.42■■■□□ 2.62
CTIF-209ENST00000591387 NUP160Q12769 1436 aa31.32■■■□□ 2.61
CTIF-209ENST00000591387 CEP170Q5SW79 1584 aa31.27■■■□□ 2.6
CTIF-209ENST00000591387 KIF27Q86VH2 1401 aa31.21■■■□□ 2.59
CTIF-209ENST00000591387 SHROOM2Q13796 1616 aa31.15■■■□□ 2.58
CTIF-209ENST00000591387 IGF1RP08069 1367 aa31.13■■■□□ 2.57
CTIF-209ENST00000591387 CUL7Q14999 1698 aa31.09■■■□□ 2.57
CTIF-209ENST00000591387 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.07■■■□□ 2.56
CTIF-209ENST00000591387 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
CTIF-209ENST00000591387 JPH4Q96JJ6 628 aa31.02■■■□□ 2.56
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