RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590720.5

PSME3-210, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME3, Length 998 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-210ENST00000590720 IGF1RP08069 1367 aa35.38■■■■□ 3.25
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PSME3-210ENST00000590720 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.14■■■■□ 3.22
PSME3-210ENST00000590720 ADCY10Q96PN6 1610 aa35■■■■□ 3.19
PSME3-210ENST00000590720 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.99■■■■□ 3.19
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PSME3-210ENST00000590720 MAPKBP1O60336 1514 aa34.91■■■■□ 3.18
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PSME3-210ENST00000590720 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.86■■■■□ 3.17
PSME3-210ENST00000590720 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.84■■■■□ 3.17
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PSME3-210ENST00000590720 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.82■■■■□ 3.16
PSME3-210ENST00000590720 DIP2BQ9P265 1576 aa34.8■■■■□ 3.16
PSME3-210ENST00000590720 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.76■■■■□ 3.16
PSME3-210ENST00000590720 DISP1Q96F81 1524 aa34.76■■■■□ 3.15
PSME3-210ENST00000590720 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
PSME3-210ENST00000590720 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.72■■■■□ 3.15
PSME3-210ENST00000590720 ABCC2Q92887 1545 aa34.67■■■■□ 3.14
PSME3-210ENST00000590720 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.64■■■■□ 3.14
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PSME3-210ENST00000590720 TSPOAP1O95153 1857 aa34.51■■■■□ 3.12
PSME3-210ENST00000590720 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.5■■■■□ 3.11
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PSME3-210ENST00000590720 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
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PSME3-210ENST00000590720 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.29■■■■□ 3.08
PSME3-210ENST00000590720 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.26■■■■□ 3.08
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PSME3-210ENST00000590720 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.23■■■■□ 3.07
PSME3-210ENST00000590720 SAMD9Q5K651 1589 aa34.15■■■■□ 3.06
PSME3-210ENST00000590720 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.13■■■■□ 3.05
PSME3-210ENST00000590720 P3H3Q8IVL6 736 aa34.1■■■■□ 3.05
PSME3-210ENST00000590720 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
PSME3-210ENST00000590720 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.04■■■■□ 3.04
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PSME3-210ENST00000590720 KCNH8Q96L42 1107 aa33.98■■■■□ 3.03
PSME3-210ENST00000590720 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.97■■■■□ 3.03
PSME3-210ENST00000590720 CD109Q6YHK3 1445 aa33.97■■■■□ 3.03
PSME3-210ENST00000590720 ATP10BO94823 1461 aa33.97■■■■□ 3.03
PSME3-210ENST00000590720 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.97■■■■□ 3.03
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PSME3-210ENST00000590720 ARID3CA6NKF2 412 aa33.95■■■■□ 3.03
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PSME3-210ENST00000590720 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
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PSME3-210ENST00000590720 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
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PSME3-210ENST00000590720 NEO1Q92859 1461 aa33.59■■■□□ 2.97
PSME3-210ENST00000590720 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.56■■■□□ 2.96
PSME3-210ENST00000590720 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.54■■■□□ 2.96
PSME3-210ENST00000590720 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
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PSME3-210ENST00000590720 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.49■■■□□ 2.95
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PSME3-210ENST00000590720 PLCH2O75038 1416 aa33.26■■■□□ 2.91
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PSME3-210ENST00000590720 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
PSME3-210ENST00000590720 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.91
PSME3-210ENST00000590720 CLIP1P30622 1438 aa33.16■■■□□ 2.9
PSME3-210ENST00000590720 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.16■■■□□ 2.9
PSME3-210ENST00000590720 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.14■■■□□ 2.9
PSME3-210ENST00000590720 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.14■■■□□ 2.9
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