RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590720.5

PSME3-210, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME3, Length 998 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-210ENST00000590720 IGF1RP08069 1367 aa35.38■■■■□ 3.25
PSME3-210ENST00000590720 JPH4Q96JJ6 628 aa35.34■■■■□ 3.25
PSME3-210ENST00000590720 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.22■■■■□ 3.23
PSME3-210ENST00000590720 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.14■■■■□ 3.22
PSME3-210ENST00000590720 ADCY10Q96PN6 1610 aa35■■■■□ 3.19
PSME3-210ENST00000590720 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.99■■■■□ 3.19
PSME3-210ENST00000590720 IQGAP2Q13576 1575 aa34.94■■■■□ 3.18
PSME3-210ENST00000590720 MAPKBP1O60336 1514 aa34.91■■■■□ 3.18
PSME3-210ENST00000590720 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.9■■■■□ 3.18
PSME3-210ENST00000590720 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.88■■■■□ 3.17
PSME3-210ENST00000590720 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.86■■■■□ 3.17
PSME3-210ENST00000590720 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.84■■■■□ 3.17
PSME3-210ENST00000590720 PTPRGP23470 1445 aa34.84■■■■□ 3.17
PSME3-210ENST00000590720 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.82■■■■□ 3.16
PSME3-210ENST00000590720 DIP2BQ9P265 1576 aa34.8■■■■□ 3.16
PSME3-210ENST00000590720 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.76■■■■□ 3.16
PSME3-210ENST00000590720 DISP1Q96F81 1524 aa34.76■■■■□ 3.15
PSME3-210ENST00000590720 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
PSME3-210ENST00000590720 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.72■■■■□ 3.15
PSME3-210ENST00000590720 ABCC2Q92887 1545 aa34.67■■■■□ 3.14
PSME3-210ENST00000590720 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.64■■■■□ 3.14
PSME3-210ENST00000590720 KIAA0556O60303 1618 aa34.64■■■■□ 3.14
PSME3-210ENST00000590720 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.63■■■■□ 3.13
PSME3-210ENST00000590720 UACAQ9BZF9 1416 aa34.6■■■■□ 3.13
PSME3-210ENST00000590720 PRXQ9BXM0 1461 aa34.58■■■■□ 3.13
PSME3-210ENST00000590720 ASXL2Q76L83 1435 aa34.52■■■■□ 3.12
PSME3-210ENST00000590720 TSPOAP1O95153 1857 aa34.51■■■■□ 3.12
PSME3-210ENST00000590720 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.5■■■■□ 3.11
PSME3-210ENST00000590720 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.47■■■■□ 3.11
PSME3-210ENST00000590720 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
PSME3-210ENST00000590720 KDM6BO15054 1643 aa34.44■■■■□ 3.1
PSME3-210ENST00000590720 GOLGA3Q08378 1498 aa34.44■■■■□ 3.1
PSME3-210ENST00000590720 GLI2P10070 1586 aa34.43■■■■□ 3.1
PSME3-210ENST00000590720 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
PSME3-210ENST00000590720 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
PSME3-210ENST00000590720 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
PSME3-210ENST00000590720 ABCA8O94911 1581 aa34.3■■■■□ 3.08
PSME3-210ENST00000590720 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.29■■■■□ 3.08
PSME3-210ENST00000590720 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.26■■■■□ 3.08
PSME3-210ENST00000590720 EEA1Q15075 1411 aa34.23■■■■□ 3.07
PSME3-210ENST00000590720 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.23■■■■□ 3.07
PSME3-210ENST00000590720 SAMD9Q5K651 1589 aa34.15■■■■□ 3.06
PSME3-210ENST00000590720 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.13■■■■□ 3.05
PSME3-210ENST00000590720 P3H3Q8IVL6 736 aa34.1■■■■□ 3.05
PSME3-210ENST00000590720 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
PSME3-210ENST00000590720 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.04■■■■□ 3.04
PSME3-210ENST00000590720 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
PSME3-210ENST00000590720 KIF21BO75037 1637 aa33.99■■■■□ 3.03
PSME3-210ENST00000590720 KCNH8Q96L42 1107 aa33.98■■■■□ 3.03
PSME3-210ENST00000590720 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.97■■■■□ 3.03
PSME3-210ENST00000590720 CD109Q6YHK3 1445 aa33.97■■■■□ 3.03
PSME3-210ENST00000590720 ATP10BO94823 1461 aa33.97■■■■□ 3.03
PSME3-210ENST00000590720 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.97■■■■□ 3.03
PSME3-210ENST00000590720 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.95■■■■□ 3.03
PSME3-210ENST00000590720 ARID3CA6NKF2 412 aa33.95■■■■□ 3.03
PSME3-210ENST00000590720 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.89■■■■□ 3.02
PSME3-210ENST00000590720 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
PSME3-210ENST00000590720 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.84■■■■□ 3.01
PSME3-210ENST00000590720 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
PSME3-210ENST00000590720 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.81■■■■□ 3
PSME3-210ENST00000590720 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.81■■■■□ 3
PSME3-210ENST00000590720 ADGRL1O94910 1474 aa33.78■■■■□ 3
PSME3-210ENST00000590720 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
PSME3-210ENST00000590720 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
PSME3-210ENST00000590720 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.69■■■□□ 2.98
PSME3-210ENST00000590720 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.65■■■□□ 2.98
PSME3-210ENST00000590720 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
PSME3-210ENST00000590720 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.6■■■□□ 2.97
PSME3-210ENST00000590720 NEO1Q92859 1461 aa33.59■■■□□ 2.97
PSME3-210ENST00000590720 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.56■■■□□ 2.96
PSME3-210ENST00000590720 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.54■■■□□ 2.96
PSME3-210ENST00000590720 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
PSME3-210ENST00000590720 FMN1Q68DA7 1419 aa33.5■■■□□ 2.95
PSME3-210ENST00000590720 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.49■■■□□ 2.95
PSME3-210ENST00000590720 HECW1Q76N89 1606 aa33.48■■■□□ 2.95
PSME3-210ENST00000590720 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.47■■■□□ 2.95
PSME3-210ENST00000590720 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.47■■■□□ 2.95
PSME3-210ENST00000590720 RAPGEF3O95398 923 aa33.45■■■□□ 2.95
PSME3-210ENST00000590720 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.43■■■□□ 2.94
PSME3-210ENST00000590720 FANCAO15360 1455 aa33.4■■■□□ 2.94
PSME3-210ENST00000590720 AKNAQ7Z591 1439 aa33.36■■■□□ 2.93
PSME3-210ENST00000590720 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
PSME3-210ENST00000590720 RICTORQ6R327 1708 aa33.35■■■□□ 2.93
PSME3-210ENST00000590720 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.34■■■□□ 2.93
PSME3-210ENST00000590720 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa33.28■■■□□ 2.92
PSME3-210ENST00000590720 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.28■■■□□ 2.92
PSME3-210ENST00000590720 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.27■■■□□ 2.92
PSME3-210ENST00000590720 PLCH2O75038 1416 aa33.26■■■□□ 2.91
PSME3-210ENST00000590720 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.25■■■□□ 2.91
PSME3-210ENST00000590720 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.24■■■□□ 2.91
PSME3-210ENST00000590720 KIF14Q15058 1648 aa33.24■■■□□ 2.91
PSME3-210ENST00000590720 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.23■■■□□ 2.91
PSME3-210ENST00000590720 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa33.23■■■□□ 2.91
PSME3-210ENST00000590720 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.21■■■□□ 2.91
PSME3-210ENST00000590720 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
PSME3-210ENST00000590720 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.91
PSME3-210ENST00000590720 CLIP1P30622 1438 aa33.16■■■□□ 2.9
PSME3-210ENST00000590720 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.16■■■□□ 2.9
PSME3-210ENST00000590720 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.14■■■□□ 2.9
PSME3-210ENST00000590720 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms