RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.03■■■□□ 2.24
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PTPRS-208ENST00000590509 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.96■■■□□ 2.23
PTPRS-208ENST00000590509 DIP2BQ9P265 1576 aa28.96■■■□□ 2.23
PTPRS-208ENST00000590509 MAPKBP1O60336 1514 aa28.92■■■□□ 2.22
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PTPRS-208ENST00000590509 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.81■■■□□ 2.2
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PTPRS-208ENST00000590509 ABCC2Q92887 1545 aa28.52■■■□□ 2.16
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PTPRS-208ENST00000590509 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
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PTPRS-208ENST00000590509 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.39■■■□□ 2.14
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PTPRS-208ENST00000590509 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
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PTPRS-208ENST00000590509 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
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PTPRS-208ENST00000590509 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
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PTPRS-208ENST00000590509 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.36■■□□□ 1.97
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PTPRS-208ENST00000590509 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.15■■□□□ 1.94
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