RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589851.1

PTPRS-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRS, Length 1,270 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-207ENST00000589851 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.64■■□□□ 1.85
PTPRS-207ENST00000589851 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRS-207ENST00000589851 JPH4Q96JJ6 628 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRS-207ENST00000589851 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRS-207ENST00000589851 EEA1Q15075 1411 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRS-207ENST00000589851 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PTPRS-207ENST00000589851 PRXQ9BXM0 1461 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRS-207ENST00000589851 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRS-207ENST00000589851 IQGAP2Q13576 1575 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRS-207ENST00000589851 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRS-207ENST00000589851 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
PTPRS-207ENST00000589851 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRS-207ENST00000589851 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRS-207ENST00000589851 DISP1Q96F81 1524 aa26.29■■□□□ 1.8
PTPRS-207ENST00000589851 KIF21BO75037 1637 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRS-207ENST00000589851 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRS-207ENST00000589851 PTPRGP23470 1445 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRS-207ENST00000589851 KIAA0556O60303 1618 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRS-207ENST00000589851 GOLGA3Q08378 1498 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRS-207ENST00000589851 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRS-207ENST00000589851 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PTPRS-207ENST00000589851 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
PTPRS-207ENST00000589851 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
PTPRS-207ENST00000589851 UACAQ9BZF9 1416 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRS-207ENST00000589851 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRS-207ENST00000589851 SAMD9Q5K651 1589 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRS-207ENST00000589851 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PTPRS-207ENST00000589851 ABCC2Q92887 1545 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRS-207ENST00000589851 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRS-207ENST00000589851 MAPKBP1O60336 1514 aa26■■□□□ 1.75
PTPRS-207ENST00000589851 P3H3Q8IVL6 736 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRS-207ENST00000589851 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PTPRS-207ENST00000589851 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRS-207ENST00000589851 ABCA8O94911 1581 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRS-207ENST00000589851 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRS-207ENST00000589851 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRS-207ENST00000589851 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRS-207ENST00000589851 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRS-207ENST00000589851 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PTPRS-207ENST00000589851 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRS-207ENST00000589851 ASXL2Q76L83 1435 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRS-207ENST00000589851 DIP2BQ9P265 1576 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRS-207ENST00000589851 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRS-207ENST00000589851 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRS-207ENST00000589851 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRS-207ENST00000589851 ATP10BO94823 1461 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRS-207ENST00000589851 GLI2P10070 1586 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRS-207ENST00000589851 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRS-207ENST00000589851 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
PTPRS-207ENST00000589851 FMN1Q68DA7 1419 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRS-207ENST00000589851 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PTPRS-207ENST00000589851 ARID3CA6NKF2 412 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRS-207ENST00000589851 CLIP1P30622 1438 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRS-207ENST00000589851 TSPOAP1O95153 1857 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRS-207ENST00000589851 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
PTPRS-207ENST00000589851 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
PTPRS-207ENST00000589851 KCNH8Q96L42 1107 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRS-207ENST00000589851 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRS-207ENST00000589851 HECW1Q76N89 1606 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRS-207ENST00000589851 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRS-207ENST00000589851 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PTPRS-207ENST00000589851 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRS-207ENST00000589851 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRS-207ENST00000589851 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PTPRS-207ENST00000589851 CEP162Q5TB80 1403 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRS-207ENST00000589851 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PTPRS-207ENST00000589851 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRS-207ENST00000589851 CD109Q6YHK3 1445 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRS-207ENST00000589851 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PTPRS-207ENST00000589851 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRS-207ENST00000589851 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.45■■□□□ 1.67
PTPRS-207ENST00000589851 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRS-207ENST00000589851 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRS-207ENST00000589851 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRS-207ENST00000589851 KDM6BO15054 1643 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRS-207ENST00000589851 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PTPRS-207ENST00000589851 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.39■■□□□ 1.65
PTPRS-207ENST00000589851 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.65
PTPRS-207ENST00000589851 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PTPRS-207ENST00000589851 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PTPRS-207ENST00000589851 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRS-207ENST00000589851 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRS-207ENST00000589851 KIF14Q15058 1648 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRS-207ENST00000589851 NEO1Q92859 1461 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRS-207ENST00000589851 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRS-207ENST00000589851 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRS-207ENST00000589851 PLCH2O75038 1416 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRS-207ENST00000589851 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRS-207ENST00000589851 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRS-207ENST00000589851 FANCAO15360 1455 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRS-207ENST00000589851 AKNAQ7Z591 1439 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRS-207ENST00000589851 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRS-207ENST00000589851 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRS-207ENST00000589851 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRS-207ENST00000589851 RAPGEF3O95398 923 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRS-207ENST00000589851 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRS-207ENST00000589851 TIAM1Q13009 1591 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRS-207ENST00000589851 PREX2Q70Z35 1606 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRS-207ENST00000589851 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PTPRS-207ENST00000589851 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.06■■□□□ 1.6
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