RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589528.1

ACTN4-211, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ACTN4, Length 441 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-211ENST00000589528 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.04■■□□□ 1.92
ACTN4-211ENST00000589528 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.02■■□□□ 1.92
ACTN4-211ENST00000589528 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.96■■□□□ 1.91
ACTN4-211ENST00000589528 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.92■■□□□ 1.9
ACTN4-211ENST00000589528 MAPKBP1O60336 1514 aa26.9■■□□□ 1.9
ACTN4-211ENST00000589528 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.89■■□□□ 1.9
ACTN4-211ENST00000589528 CUL7Q14999 1698 aa26.86■■□□□ 1.89
ACTN4-211ENST00000589528 DIP2BQ9P265 1576 aa26.86■■□□□ 1.89
ACTN4-211ENST00000589528 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.85■■□□□ 1.89
ACTN4-211ENST00000589528 KIF27Q86VH2 1401 aa26.82■■□□□ 1.88
ACTN4-211ENST00000589528 TSPOAP1O95153 1857 aa26.81■■□□□ 1.88
ACTN4-211ENST00000589528 IGF1RP08069 1367 aa26.8■■□□□ 1.88
ACTN4-211ENST00000589528 KDM6BO15054 1643 aa26.76■■□□□ 1.87
ACTN4-211ENST00000589528 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
ACTN4-211ENST00000589528 PTPRGP23470 1445 aa26.7■■□□□ 1.86
ACTN4-211ENST00000589528 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.66■■□□□ 1.86
ACTN4-211ENST00000589528 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.66■■□□□ 1.86
ACTN4-211ENST00000589528 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.62■■□□□ 1.85
ACTN4-211ENST00000589528 IQGAP2Q13576 1575 aa26.6■■□□□ 1.85
ACTN4-211ENST00000589528 ABCC2Q92887 1545 aa26.59■■□□□ 1.85
ACTN4-211ENST00000589528 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.54■■□□□ 1.84
ACTN4-211ENST00000589528 ASXL2Q76L83 1435 aa26.54■■□□□ 1.84
ACTN4-211ENST00000589528 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.54■■□□□ 1.84
ACTN4-211ENST00000589528 UACAQ9BZF9 1416 aa26.48■■□□□ 1.83
ACTN4-211ENST00000589528 GLI2P10070 1586 aa26.47■■□□□ 1.83
ACTN4-211ENST00000589528 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.47■■□□□ 1.83
ACTN4-211ENST00000589528 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
ACTN4-211ENST00000589528 DISP1Q96F81 1524 aa26.43■■□□□ 1.82
ACTN4-211ENST00000589528 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.4■■□□□ 1.82
ACTN4-211ENST00000589528 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
ACTN4-211ENST00000589528 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
ACTN4-211ENST00000589528 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.36■■□□□ 1.81
ACTN4-211ENST00000589528 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.36■■□□□ 1.81
ACTN4-211ENST00000589528 KIAA0556O60303 1618 aa26.35■■□□□ 1.81
ACTN4-211ENST00000589528 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.35■■□□□ 1.81
ACTN4-211ENST00000589528 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.34■■□□□ 1.81
ACTN4-211ENST00000589528 ADGRL1O94910 1474 aa26.31■■□□□ 1.8
ACTN4-211ENST00000589528 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.27■■□□□ 1.8
ACTN4-211ENST00000589528 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
ACTN4-211ENST00000589528 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.23■■□□□ 1.79
ACTN4-211ENST00000589528 GOLGA3Q08378 1498 aa26.18■■□□□ 1.78
ACTN4-211ENST00000589528 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.14■■□□□ 1.78
ACTN4-211ENST00000589528 KCNH8Q96L42 1107 aa26.13■■□□□ 1.77
ACTN4-211ENST00000589528 CD109Q6YHK3 1445 aa26.12■■□□□ 1.77
ACTN4-211ENST00000589528 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
ACTN4-211ENST00000589528 ABCA8O94911 1581 aa26.09■■□□□ 1.77
ACTN4-211ENST00000589528 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.07■■□□□ 1.76
ACTN4-211ENST00000589528 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
ACTN4-211ENST00000589528 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.07■■□□□ 1.76
ACTN4-211ENST00000589528 PRXQ9BXM0 1461 aa25.98■■□□□ 1.75
ACTN4-211ENST00000589528 ARID3CA6NKF2 412 aa25.96■■□□□ 1.75
ACTN4-211ENST00000589528 KIF21BO75037 1637 aa25.96■■□□□ 1.75
ACTN4-211ENST00000589528 P3H3Q8IVL6 736 aa25.92■■□□□ 1.74
ACTN4-211ENST00000589528 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.88■■□□□ 1.73
ACTN4-211ENST00000589528 ATP10BO94823 1461 aa25.86■■□□□ 1.73
ACTN4-211ENST00000589528 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.84■■□□□ 1.73
ACTN4-211ENST00000589528 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
ACTN4-211ENST00000589528 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
ACTN4-211ENST00000589528 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.82■■□□□ 1.72
ACTN4-211ENST00000589528 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.81■■□□□ 1.72
ACTN4-211ENST00000589528 SAMD9Q5K651 1589 aa25.78■■□□□ 1.72
ACTN4-211ENST00000589528 RAPGEF3O95398 923 aa25.74■■□□□ 1.71
ACTN4-211ENST00000589528 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.74■■□□□ 1.71
ACTN4-211ENST00000589528 NEO1Q92859 1461 aa25.73■■□□□ 1.71
ACTN4-211ENST00000589528 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
ACTN4-211ENST00000589528 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.71■■□□□ 1.71
ACTN4-211ENST00000589528 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
ACTN4-211ENST00000589528 PTPRMP28827 1452 aa25.7■■□□□ 1.7
ACTN4-211ENST00000589528 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.66■■□□□ 1.7
ACTN4-211ENST00000589528 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
ACTN4-211ENST00000589528 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.64■■□□□ 1.69
ACTN4-211ENST00000589528 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.63■■□□□ 1.69
ACTN4-211ENST00000589528 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.61■■□□□ 1.69
ACTN4-211ENST00000589528 MADDQ8WXG6 1647 aa25.61■■□□□ 1.69
ACTN4-211ENST00000589528 EEA1Q15075 1411 aa25.59■■□□□ 1.69
ACTN4-211ENST00000589528 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.59■■□□□ 1.69
ACTN4-211ENST00000589528 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.58■■□□□ 1.68
ACTN4-211ENST00000589528 FBXO41Q8TF61 875 aa25.57■■□□□ 1.68
ACTN4-211ENST00000589528 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
ACTN4-211ENST00000589528 RICTORQ6R327 1708 aa25.56■■□□□ 1.68
ACTN4-211ENST00000589528 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
ACTN4-211ENST00000589528 FANCAO15360 1455 aa25.54■■□□□ 1.68
ACTN4-211ENST00000589528 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
ACTN4-211ENST00000589528 AKNAQ7Z591 1439 aa25.54■■□□□ 1.68
ACTN4-211ENST00000589528 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.671e-6■■□□□ 13.8
ACTN4-211ENST00000589528 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.5■■□□□ 1.67
ACTN4-211ENST00000589528 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTN4-211ENST00000589528 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTN4-211ENST00000589528 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.47■■□□□ 1.67
ACTN4-211ENST00000589528 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.47■■□□□ 1.67
ACTN4-211ENST00000589528 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.44■■□□□ 1.66
ACTN4-211ENST00000589528 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.43■■□□□ 1.66
ACTN4-211ENST00000589528 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
ACTN4-211ENST00000589528 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
ACTN4-211ENST00000589528 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTN4-211ENST00000589528 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTN4-211ENST00000589528 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.37■■□□□ 1.65
ACTN4-211ENST00000589528 MLECQ14165 292 aa25.37■■□□□ 1.65
ACTN4-211ENST00000589528 HECW1Q76N89 1606 aa25.37■■□□□ 1.65
ACTN4-211ENST00000589528 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.35■■□□□ 1.65
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