RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589452.1

PQLC1-210, Transcript of PQ loop repeat containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PQLC1, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC1-210ENST00000589452 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.7■■■■■ 5.55
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PQLC1-210ENST00000589452 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.51■■■■■ 5.52
PQLC1-210ENST00000589452 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa49.17■■■■■ 5.46
PQLC1-210ENST00000589452 IQGAP2Q13576 1575 aa49.11■■■■■ 5.45
PQLC1-210ENST00000589452 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP49.04■■■■■ 5.44
PQLC1-210ENST00000589452 ADCY10Q96PN6 1610 aa49.03■■■■■ 5.44
PQLC1-210ENST00000589452 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP49.01■■■■■ 5.44
PQLC1-210ENST00000589452 PTPRGP23470 1445 aa49■■■■■ 5.43
PQLC1-210ENST00000589452 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa49■■■■■ 5.43
PQLC1-210ENST00000589452 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.93■■■■■ 5.42
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PQLC1-210ENST00000589452 UGGT2Q9NYU1 1516 aa48.82■■■■■ 5.41
PQLC1-210ENST00000589452 MAPKBP1O60336 1514 aa48.8■■■■■ 5.4
PQLC1-210ENST00000589452 PRXQ9BXM0 1461 aa48.8■■■■■ 5.4
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PQLC1-210ENST00000589452 ABCC10Q5T3U5 1492 aa48.74■■■■■ 5.39
PQLC1-210ENST00000589452 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.72■■■■■ 5.39
PQLC1-210ENST00000589452 KIAA0556O60303 1618 aa48.66■■■■■ 5.38
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PQLC1-210ENST00000589452 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.62■■■■■ 5.37
PQLC1-210ENST00000589452 UACAQ9BZF9 1416 aa48.62■■■■■ 5.37
PQLC1-210ENST00000589452 ABCC2Q92887 1545 aa48.62■■■■■ 5.37
PQLC1-210ENST00000589452 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa48.57■■■■■ 5.37
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PQLC1-210ENST00000589452 ASXL2Q76L83 1435 aa48.43■■■■■ 5.34
PQLC1-210ENST00000589452 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP48.42■■■■■ 5.34
PQLC1-210ENST00000589452 EEA1Q15075 1411 aa48.4■■■■■ 5.34
PQLC1-210ENST00000589452 KDM5BQ9UGL1 1544 aa48.37■■■■■ 5.33
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PQLC1-210ENST00000589452 TSPOAP1O95153 1857 aa48.35■■■■■ 5.33
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PQLC1-210ENST00000589452 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.25■■■■■ 5.31
PQLC1-210ENST00000589452 ABCA8O94911 1581 aa48.2■■■■■ 5.31
PQLC1-210ENST00000589452 GLI2P10070 1586 aa48.17■■■■■ 5.3
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PQLC1-210ENST00000589452 KDM6BO15054 1643 aa48.07■■■■■ 5.29
PQLC1-210ENST00000589452 SAMD9Q5K651 1589 aa48.05■■■■■ 5.28
PQLC1-210ENST00000589452 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP48.04■■■■■ 5.28
PQLC1-210ENST00000589452 WDR7Q9Y4E6 1490 aa48.01■■■■■ 5.28
PQLC1-210ENST00000589452 KIF21BO75037 1637 aa48■■■■■ 5.27
PQLC1-210ENST00000589452 ARID3CA6NKF2 412 aa47.97■■■■■ 5.27
PQLC1-210ENST00000589452 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP47.95■■■■■ 5.27
PQLC1-210ENST00000589452 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa47.95■■■■■ 5.27
PQLC1-210ENST00000589452 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.93■■■■■ 5.26
PQLC1-210ENST00000589452 KCNH8Q96L42 1107 aa47.91■■■■■ 5.26
PQLC1-210ENST00000589452 ATP10BO94823 1461 aa47.84■■■■■ 5.25
PQLC1-210ENST00000589452 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.83■■■■■ 5.25
PQLC1-210ENST00000589452 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.78■■■■■ 5.24
PQLC1-210ENST00000589452 TEX14Q8IWB6 1497 aa47.75■■■■■ 5.23
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PQLC1-210ENST00000589452 CD109Q6YHK3 1445 aa47.7■■■■■ 5.23
PQLC1-210ENST00000589452 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.67■■■■■ 5.22
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PQLC1-210ENST00000589452 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.4■■■■■ 5.18
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PQLC1-210ENST00000589452 ADGRL1O94910 1474 aa47.14■■■■■ 5.14
PQLC1-210ENST00000589452 PHLDB1Q86UU1 1377 aa47.13■■■■■ 5.14
PQLC1-210ENST00000589452 HECW1Q76N89 1606 aa47.12■■■■■ 5.13
PQLC1-210ENST00000589452 NEO1Q92859 1461 aa47.1■■■■■ 5.13
PQLC1-210ENST00000589452 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP47.1■■■■■ 5.13
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PQLC1-210ENST00000589452 TTC37Q6PGP7 1564 aa47.03■■■■■ 5.12
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PQLC1-210ENST00000589452 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP46.82■■■■■ 5.09
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PQLC1-210ENST00000589452 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.67■■■■■ 5.06
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PQLC1-210ENST00000589452 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.63■■■■■ 5.06
PQLC1-210ENST00000589452 FYCO1Q9BQS8 1478 aa46.63■■■■■ 5.05
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PQLC1-210ENST00000589452 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa46.54■■■■■ 5.04
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