RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589452.1

PQLC1-210, Transcript of PQ loop repeat containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PQLC1, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC1-210ENST00000589452 NISCHQ9Y2I1 1504 aa71.31■■■■■ 9.01
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PQLC1-210ENST00000589452 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60.33■■■■■ 7.25
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PQLC1-210ENST00000589452 NACADO15069 1562 aa60.06■■■■■ 7.2
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PQLC1-210ENST00000589452 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP59.2■■■■■ 7.07
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PQLC1-210ENST00000589452 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa58.85■■■■■ 7.01
PQLC1-210ENST00000589452 DNAJC5BQ9UF47 199 aa58.84■■■■■ 7.01
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PQLC1-210ENST00000589452 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa57.09■■■■■ 6.73
PQLC1-210ENST00000589452 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP57.09■■■■■ 6.73
PQLC1-210ENST00000589452 CECR2Q9BXF3 1484 aa56.83■■■■■ 6.69
PQLC1-210ENST00000589452 SMARCA4P51532 1647 aa55.5■■■■■ 6.47
PQLC1-210ENST00000589452 NCAPD3P42695 1498 aa55.46■■■■■ 6.47
PQLC1-210ENST00000589452 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa55.41■■■■■ 6.46
PQLC1-210ENST00000589452 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP55.27■■■■■ 6.44
PQLC1-210ENST00000589452 SMARCA2P51531 1590 aa55.23■■■■■ 6.43
PQLC1-210ENST00000589452 HMGXB3Q12766 1538 aa55.06■■■■■ 6.41
PQLC1-210ENST00000589452 MROH2BQ7Z745 1585 aa55.01■■■■■ 6.4
PQLC1-210ENST00000589452 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP54.89■■■■■ 6.38
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PQLC1-210ENST00000589452 NESP48681 1621 aa54.5■■■■■ 6.31
PQLC1-210ENST00000589452 ERCC6Q03468 1493 aa54.49■■■■■ 6.31
PQLC1-210ENST00000589452 WIZO95785 1651 aa54.38■■■■■ 6.3
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PQLC1-210ENST00000589452 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa54.08■■■■■ 6.25
PQLC1-210ENST00000589452 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP54.07■■■■■ 6.25
PQLC1-210ENST00000589452 CADPSQ9ULU8 1353 aa53.84■■■■■ 6.21
PQLC1-210ENST00000589452 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.78■■■■■ 6.2
PQLC1-210ENST00000589452 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.76■■■■■ 6.2
PQLC1-210ENST00000589452 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53.73■■■■■ 6.19
PQLC1-210ENST00000589452 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP53.67■■■■■ 6.18
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PQLC1-210ENST00000589452 CFTRP13569 1480 aa53.33■■■■■ 6.13
PQLC1-210ENST00000589452 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.3■■■■■ 6.12
PQLC1-210ENST00000589452 FANCD2Q9BXW9 1451 aa53.23■■■■■ 6.11
PQLC1-210ENST00000589452 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.2■■■■■ 6.11
PQLC1-210ENST00000589452 CCDC88BA6NC98 1476 aa53.12■■■■■ 6.09
PQLC1-210ENST00000589452 WDR62O43379 1518 aa53.12■■■■■ 6.09
PQLC1-210ENST00000589452 PRDM2Q13029 1718 aa52.8■■■■■ 6.04
PQLC1-210ENST00000589452 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP52.77■■■■■ 6.04
PQLC1-210ENST00000589452 TOPBP1Q92547 1522 aa52.3■■■■■ 5.96
PQLC1-210ENST00000589452 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP52.25■■■■■ 5.95
PQLC1-210ENST00000589452 ABCC8Q09428 1581 aa52.14■■■■■ 5.94
PQLC1-210ENST00000589452 DNMBPQ6XZF7 1577 aa52.13■■■■■ 5.93
PQLC1-210ENST00000589452 IFT140Q96RY7 1462 aa52.12■■■■■ 5.93
PQLC1-210ENST00000589452 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP52.05■■■■■ 5.92
PQLC1-210ENST00000589452 OSCARQ8IYS5 282 aa51.85■■■■■ 5.89
PQLC1-210ENST00000589452 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP51.8■■■■■ 5.88
PQLC1-210ENST00000589452 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP51.76■■■■■ 5.88
PQLC1-210ENST00000589452 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP51.72■■■■■ 5.87
PQLC1-210ENST00000589452 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP51.67■■■■■ 5.866e-6■■■■□ 23.2
PQLC1-210ENST00000589452 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa51.66■■■■■ 5.86
PQLC1-210ENST00000589452 CUX1P39880 1505 aa51.63■■■■■ 5.86
PQLC1-210ENST00000589452 SOGA1O94964 1423 aa51.6■■■■■ 5.85
PQLC1-210ENST00000589452 FGD5Q6ZNL6 1462 aa51.57■■■■■ 5.85
PQLC1-210ENST00000589452 TRIM41Q8WV44 630 aa51.49■■■■■ 5.83
PQLC1-210ENST00000589452 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP51.45■■■■■ 5.83
PQLC1-210ENST00000589452 CHD1O14646 1710 aa51.26■■■■■ 5.8
PQLC1-210ENST00000589452 FBLN2P98095 1184 aa51.24■■■■■ 5.79
PQLC1-210ENST00000589452 WDR97A6NE52 1622 aa51.17■■■■■ 5.78
PQLC1-210ENST00000589452 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa51.11■■■■■ 5.77
PQLC1-210ENST00000589452 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa51.09■■■■■ 5.77
PQLC1-210ENST00000589452 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa51.09■■■■■ 5.77
PQLC1-210ENST00000589452 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa51.09■■■■■ 5.77
PQLC1-210ENST00000589452 GRIN2BQ13224 1484 aa51.03■■■■■ 5.76
PQLC1-210ENST00000589452 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.98■■■■■ 5.75
PQLC1-210ENST00000589452 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP50.98■■■■■ 5.75
PQLC1-210ENST00000589452 ARHGEF11O15085 1522 aa50.97■■■■■ 5.75
PQLC1-210ENST00000589452 GAPVD1Q14C86 1478 aa50.96■■■■■ 5.75
PQLC1-210ENST00000589452 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP50.95■■■■■ 5.75
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PQLC1-210ENST00000589452 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP50.92■■■■■ 5.74
PQLC1-210ENST00000589452 TOP2BQ02880 1626 aa50.91■■■■■ 5.74
PQLC1-210ENST00000589452 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.91■■■■■ 5.74
PQLC1-210ENST00000589452 PBRM1Q86U86 1689 aa50.88■■■■■ 5.74
PQLC1-210ENST00000589452 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.84■■■■■ 5.73
PQLC1-210ENST00000589452 SYNJ2O15056 1496 aa50.78■■■■■ 5.72
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PQLC1-210ENST00000589452 CEP170Q5SW79 1584 aa50.2■■■■■ 5.63
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PQLC1-210ENST00000589452 KIF27Q86VH2 1401 aa49.95■■■■■ 5.59
PQLC1-210ENST00000589452 IGF1RP08069 1367 aa49.92■■■■■ 5.58
PQLC1-210ENST00000589452 TRHP20396 242 aaPredicted RBP49.89■■■■■ 5.58
PQLC1-210ENST00000589452 SHROOM2Q13796 1616 aa49.88■■■■■ 5.58
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PQLC1-210ENST00000589452 CUL7Q14999 1698 aa49.71■■■■■ 5.55
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