RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589217.1

TNRC6C-AS1-201, TNRC6C antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNRC6C-AS1, Length 3,192 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.56□□□□□ -0.08
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.55□□□□□ -0.08
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.53□□□□□ -0.08
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CLIP1P30622 1438 aa14.52□□□□□ -0.09
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 NEUROD1Q13562 356 aa14.5□□□□□ -0.09
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.5□□□□□ -0.09
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 SYNJ2O15056 1496 aa14.46□□□□□ -0.09
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.46□□□□□ -0.09
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 GRIN2AQ12879 1464 aa14.45□□□□□ -0.1
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ARAP1Q96P48 1450 aa14.44□□□□□ -0.1
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.44□□□□□ -0.1
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 SAMD9Q5K651 1589 aa14.43□□□□□ -0.1
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.42□□□□□ -0.1
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 IQGAP2Q13576 1575 aa14.42□□□□□ -0.1
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CHD1O14646 1710 aa14.38□□□□□ -0.11
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CEP170Q5SW79 1584 aa14.38□□□□□ -0.11
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.37□□□□□ -0.11
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 NUP160Q12769 1436 aa14.37□□□□□ -0.11
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.37□□□□□ -0.11
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 MAP3K1Q13233 1512 aa14.29□□□□□ -0.12
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 KIAA0556O60303 1618 aa14.29□□□□□ -0.12
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.27□□□□□ -0.13
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 SHROOM2Q13796 1616 aa14.26□□□□□ -0.13
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 FMN1Q68DA7 1419 aa14.26□□□□□ -0.13
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.26□□□□□ -0.13
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 DISP1Q96F81 1524 aa14.25□□□□□ -0.13
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.25□□□□□ -0.13
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.23□□□□□ -0.13
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.22□□□□□ -0.13
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 TIAM1Q13009 1591 aa14.22□□□□□ -0.13
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.21□□□□□ -0.13
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 FBLN2P98095 1184 aa14.18□□□□□ -0.14
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 HECW1Q76N89 1606 aa14.18□□□□□ -0.14
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.16□□□□□ -0.14
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.14□□□□□ -0.15
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 APLP2Q06481 763 aa14.14□□□□□ -0.15
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 P3H3Q8IVL6 736 aa14.14□□□□□ -0.15
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 JPH4Q96JJ6 628 aa14.13□□□□□ -0.15
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.13□□□□□ -0.15
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.11□□□□□ -0.15
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ABCA8O94911 1581 aa14.09□□□□□ -0.15
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.15
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.05□□□□□ -0.16
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.05□□□□□ -0.16
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ERICH6Q7L0X2 663 aa14.05□□□□□ -0.16
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.02□□□□□ -0.16
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ARHGEF11O15085 1522 aa14.01□□□□□ -0.17
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14□□□□□ -0.17
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 PLB1Q6P1J6 1458 aa14□□□□□ -0.17
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ADCY10Q96PN6 1610 aa13.99□□□□□ -0.17
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 PTPRGP23470 1445 aa13.98□□□□□ -0.17
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa13.96□□□□□ -0.17
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ABCC2Q92887 1545 aa13.96□□□□□ -0.18
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 OSCARQ8IYS5 282 aa13.95□□□□□ -0.18
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 UACAQ9BZF9 1416 aa13.94□□□□□ -0.18
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 MTUS2Q5JR59 1369 aa13.94□□□□□ -0.18
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 NCOA2Q15596 1464 aa13.93□□□□□ -0.18
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ATP10BO94823 1461 aa13.92□□□□□ -0.18
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 PHLDB1Q86UU1 1377 aa13.92□□□□□ -0.18
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP13.92□□□□□ -0.18
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CCNB3Q8WWL7 1395 aa13.89□□□□□ -0.19
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ITSN2Q9NZM3 1697 aa13.89□□□□□ -0.19
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 MYOM3Q5VTT5 1437 aa13.88□□□□□ -0.19
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 KDM5BQ9UGL1 1544 aa13.88□□□□□ -0.19
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 KIF14Q15058 1648 aa13.87□□□□□ -0.19
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 FGD6Q6ZV73 1430 aa13.86□□□□□ -0.19
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 PTPN23Q9H3S7 1636 aa13.85□□□□□ -0.19
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 MIA2Q96PC5 1412 aa13.84□□□□□ -0.19
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa13.83□□□□□ -0.2
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ABCC10Q5T3U5 1492 aa13.82□□□□□ -0.2
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 PREX2Q70Z35 1606 aa13.78□□□□□ -0.2
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 PLEKHD1A6NEE1 506 aa13.78□□□□□ -0.2
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa13.78□□□□□ -0.2
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa13.78□□□□□ -0.2
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa13.78□□□□□ -0.2
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ARID3CA6NKF2 412 aa13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms