RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588230.5

CIRBP-217, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CIRBP, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-217ENST00000588230 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.7■■■□□ 2.82
CIRBP-217ENST00000588230 JPH4Q96JJ6 628 aa32.69■■■□□ 2.82
CIRBP-217ENST00000588230 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.67■■■□□ 2.82
CIRBP-217ENST00000588230 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
CIRBP-217ENST00000588230 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.46■■■□□ 2.79
CIRBP-217ENST00000588230 IQGAP2Q13576 1575 aa32.42■■■□□ 2.78
CIRBP-217ENST00000588230 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.33■■■□□ 2.77
CIRBP-217ENST00000588230 PRXQ9BXM0 1461 aa32.32■■■□□ 2.76
CIRBP-217ENST00000588230 DISP1Q96F81 1524 aa32.28■■■□□ 2.76
CIRBP-217ENST00000588230 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.27■■■□□ 2.76
CIRBP-217ENST00000588230 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.25■■■□□ 2.75
CIRBP-217ENST00000588230 PTPRGP23470 1445 aa32.23■■■□□ 2.75
CIRBP-217ENST00000588230 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.22■■■□□ 2.75
CIRBP-217ENST00000588230 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.21■■■□□ 2.75
CIRBP-217ENST00000588230 MAPKBP1O60336 1514 aa32.2■■■□□ 2.74
CIRBP-217ENST00000588230 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.19■■■□□ 2.74
CIRBP-217ENST00000588230 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.16■■■□□ 2.74
CIRBP-217ENST00000588230 KIAA0556O60303 1618 aa32.15■■■□□ 2.74
CIRBP-217ENST00000588230 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.13■■■□□ 2.73
CIRBP-217ENST00000588230 EEA1Q15075 1411 aa32.09■■■□□ 2.73
CIRBP-217ENST00000588230 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.09■■■□□ 2.73
CIRBP-217ENST00000588230 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.07■■■□□ 2.72
CIRBP-217ENST00000588230 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.07■■■□□ 2.72
CIRBP-217ENST00000588230 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
CIRBP-217ENST00000588230 ABCC2Q92887 1545 aa32.05■■■□□ 2.72
CIRBP-217ENST00000588230 DIP2BQ9P265 1576 aa32.05■■■□□ 2.72
CIRBP-217ENST00000588230 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
CIRBP-217ENST00000588230 UACAQ9BZF9 1416 aa32.02■■■□□ 2.72
CIRBP-217ENST00000588230 GOLGA3Q08378 1498 aa31.96■■■□□ 2.71
CIRBP-217ENST00000588230 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.94■■■□□ 2.7
CIRBP-217ENST00000588230 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.92■■■□□ 2.7
CIRBP-217ENST00000588230 ASXL2Q76L83 1435 aa31.88■■■□□ 2.69
CIRBP-217ENST00000588230 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.87■■■□□ 2.69
CIRBP-217ENST00000588230 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
CIRBP-217ENST00000588230 ABCA8O94911 1581 aa31.84■■■□□ 2.69
CIRBP-217ENST00000588230 KIF21BO75037 1637 aa31.82■■■□□ 2.68
CIRBP-217ENST00000588230 SAMD9Q5K651 1589 aa31.81■■■□□ 2.68
CIRBP-217ENST00000588230 GLI2P10070 1586 aa31.77■■■□□ 2.68
CIRBP-217ENST00000588230 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
CIRBP-217ENST00000588230 TSPOAP1O95153 1857 aa31.7■■■□□ 2.67
CIRBP-217ENST00000588230 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
CIRBP-217ENST00000588230 P3H3Q8IVL6 736 aa31.68■■■□□ 2.66
CIRBP-217ENST00000588230 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.65■■■□□ 2.66
CIRBP-217ENST00000588230 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.64■■■□□ 2.66
CIRBP-217ENST00000588230 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.62■■■□□ 2.65
CIRBP-217ENST00000588230 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
CIRBP-217ENST00000588230 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
CIRBP-217ENST00000588230 KDM6BO15054 1643 aa31.58■■■□□ 2.65
CIRBP-217ENST00000588230 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.57■■■□□ 2.64
CIRBP-217ENST00000588230 ATP10BO94823 1461 aa31.55■■■□□ 2.64
CIRBP-217ENST00000588230 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.54■■■□□ 2.64
CIRBP-217ENST00000588230 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.54■■■□□ 2.64
CIRBP-217ENST00000588230 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
CIRBP-217ENST00000588230 ARID3CA6NKF2 412 aa31.45■■■□□ 2.63
CIRBP-217ENST00000588230 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.42■■■□□ 2.62
CIRBP-217ENST00000588230 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
CIRBP-217ENST00000588230 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.41■■■□□ 2.62
CIRBP-217ENST00000588230 KCNH8Q96L42 1107 aa31.38■■■□□ 2.61
CIRBP-217ENST00000588230 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.38■■■□□ 2.61
CIRBP-217ENST00000588230 CD109Q6YHK3 1445 aa31.37■■■□□ 2.61
CIRBP-217ENST00000588230 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.36■■■□□ 2.61
CIRBP-217ENST00000588230 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.3■■■□□ 2.6
CIRBP-217ENST00000588230 FMN1Q68DA7 1419 aa31.21■■■□□ 2.59
CIRBP-217ENST00000588230 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
CIRBP-217ENST00000588230 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
CIRBP-217ENST00000588230 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
CIRBP-217ENST00000588230 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
CIRBP-217ENST00000588230 HECW1Q76N89 1606 aa31.13■■■□□ 2.57
CIRBP-217ENST00000588230 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.13■■■□□ 2.57
CIRBP-217ENST00000588230 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.1■■■□□ 2.57
CIRBP-217ENST00000588230 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.09■■■□□ 2.57
CIRBP-217ENST00000588230 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.08■■■□□ 2.57
CIRBP-217ENST00000588230 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
CIRBP-217ENST00000588230 NEO1Q92859 1461 aa31.06■■■□□ 2.56
CIRBP-217ENST00000588230 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.05■■■□□ 2.56
CIRBP-217ENST00000588230 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.04■■■□□ 2.56
CIRBP-217ENST00000588230 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.04■■■□□ 2.56
CIRBP-217ENST00000588230 CLIP1P30622 1438 aa31.03■■■□□ 2.56
CIRBP-217ENST00000588230 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
CIRBP-217ENST00000588230 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.97■■■□□ 2.55
CIRBP-217ENST00000588230 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.96■■■□□ 2.55
CIRBP-217ENST00000588230 ADGRL1O94910 1474 aa30.95■■■□□ 2.55
CIRBP-217ENST00000588230 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.92■■■□□ 2.54
CIRBP-217ENST00000588230 FANCAO15360 1455 aa30.91■■■□□ 2.54
CIRBP-217ENST00000588230 KIF14Q15058 1648 aa30.91■■■□□ 2.54
CIRBP-217ENST00000588230 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
CIRBP-217ENST00000588230 RAPGEF3O95398 923 aa30.9■■■□□ 2.54
CIRBP-217ENST00000588230 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.88■■■□□ 2.53
CIRBP-217ENST00000588230 AKNAQ7Z591 1439 aa30.88■■■□□ 2.53
CIRBP-217ENST00000588230 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.87■■■□□ 2.53
CIRBP-217ENST00000588230 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
CIRBP-217ENST00000588230 PLCH2O75038 1416 aa30.86■■■□□ 2.53
CIRBP-217ENST00000588230 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.85■■■□□ 2.53
CIRBP-217ENST00000588230 CEP162Q5TB80 1403 aa30.84■■■□□ 2.53
CIRBP-217ENST00000588230 RICTORQ6R327 1708 aa30.84■■■□□ 2.53
CIRBP-217ENST00000588230 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
CIRBP-217ENST00000588230 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.79■■■□□ 2.52
CIRBP-217ENST00000588230 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.74■■■□□ 2.51
CIRBP-217ENST00000588230 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.73■■■□□ 2.51
CIRBP-217ENST00000588230 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.3 ms