RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587465.6

TNNT1-208, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNNT1, Length 1,065 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNT1-208	ENST00000587465	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.9	■■■■□ 3.02
TNNT1-208	ENST00000587465	CUL7	Q14999	1698 aa		33.88	■■■■□ 3.01
TNNT1-208	ENST00000587465	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.75	■■■□□ 2.99
TNNT1-208	ENST00000587465	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		33.72	■■■□□ 2.99
TNNT1-208	ENST00000587465	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		33.66	■■■□□ 2.98
TNNT1-208	ENST00000587465	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.64	■■■□□ 2.98
TNNT1-208	ENST00000587465	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.51	■■■□□ 2.96
TNNT1-208	ENST00000587465	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
TNNT1-208	ENST00000587465	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.44	■■■□□ 2.94
TNNT1-208	ENST00000587465	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.43	■■■□□ 2.94
TNNT1-208	ENST00000587465	DIP2B	Q9P265	1576 aa		33.4	■■■□□ 2.94
TNNT1-208	ENST00000587465	PTPRG	P23470	1445 aa		33.4	■■■□□ 2.94
TNNT1-208	ENST00000587465	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.39	■■■□□ 2.94
TNNT1-208	ENST00000587465	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.39	■■■□□ 2.94
TNNT1-208	ENST00000587465	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.35	■■■□□ 2.93
TNNT1-208	ENST00000587465	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TNNT1-208	ENST00000587465	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TNNT1-208	ENST00000587465	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.33	■■■□□ 2.93
TNNT1-208	ENST00000587465	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.29	■■■□□ 2.92
TNNT1-208	ENST00000587465	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.26	■■■□□ 2.92
TNNT1-208	ENST00000587465	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TNNT1-208	ENST00000587465	TSPOAP1	O95153	1857 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TNNT1-208	ENST00000587465	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.23	■■■□□ 2.91
TNNT1-208	ENST00000587465	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TNNT1-208	ENST00000587465	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TNNT1-208	ENST00000587465	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TNNT1-208	ENST00000587465	ASXL2	Q76L83	1435 aa		33.12	■■■□□ 2.89
TNNT1-208	ENST00000587465	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
TNNT1-208	ENST00000587465	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
TNNT1-208	ENST00000587465	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TNNT1-208	ENST00000587465	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TNNT1-208	ENST00000587465	KDM6B	O15054	1643 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TNNT1-208	ENST00000587465	GLI2	P10070	1586 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TNNT1-208	ENST00000587465	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
TNNT1-208	ENST00000587465	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
TNNT1-208	ENST00000587465	ABCA8	O94911	1581 aa		32.93	■■■□□ 2.86
TNNT1-208	ENST00000587465	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.93	■■■□□ 2.86
TNNT1-208	ENST00000587465	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.9	■■■□□ 2.86
TNNT1-208	ENST00000587465	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.88	■■■□□ 2.85
TNNT1-208	ENST00000587465	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.85	■■■□□ 2.85
TNNT1-208	ENST00000587465	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
TNNT1-208	ENST00000587465	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.81	■■■□□ 2.84
TNNT1-208	ENST00000587465	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
TNNT1-208	ENST00000587465	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.78	■■■□□ 2.84
TNNT1-208	ENST00000587465	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.76	■■■□□ 2.83
TNNT1-208	ENST00000587465	EEA1	Q15075	1411 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TNNT1-208	ENST00000587465	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
TNNT1-208	ENST00000587465	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TNNT1-208	ENST00000587465	ATP10B	O94823	1461 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TNNT1-208	ENST00000587465	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TNNT1-208	ENST00000587465	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TNNT1-208	ENST00000587465	KIF21B	O75037	1637 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TNNT1-208	ENST00000587465	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TNNT1-208	ENST00000587465	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TNNT1-208	ENST00000587465	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TNNT1-208	ENST00000587465	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TNNT1-208	ENST00000587465	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TNNT1-208	ENST00000587465	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TNNT1-208	ENST00000587465	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TNNT1-208	ENST00000587465	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
TNNT1-208	ENST00000587465	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TNNT1-208	ENST00000587465	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.42	■■■□□ 2.78
TNNT1-208	ENST00000587465	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TNNT1-208	ENST00000587465	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
TNNT1-208	ENST00000587465	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
TNNT1-208	ENST00000587465	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
TNNT1-208	ENST00000587465	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
TNNT1-208	ENST00000587465	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.26	■■■□□ 2.76
TNNT1-208	ENST00000587465	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TNNT1-208	ENST00000587465	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TNNT1-208	ENST00000587465	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TNNT1-208	ENST00000587465	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.17	■■■□□ 2.74	2e-6	■■□□□ 13.5
TNNT1-208	ENST00000587465	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TNNT1-208	ENST00000587465	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TNNT1-208	ENST00000587465	NEO1	Q92859	1461 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TNNT1-208	ENST00000587465	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TNNT1-208	ENST00000587465	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TNNT1-208	ENST00000587465	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
TNNT1-208	ENST00000587465	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.06	■■■□□ 2.72
TNNT1-208	ENST00000587465	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.04	■■■□□ 2.72
TNNT1-208	ENST00000587465	RICTOR	Q6R327	1708 aa		32.03	■■■□□ 2.72
TNNT1-208	ENST00000587465	FANCA	O15360	1455 aa		32.02	■■■□□ 2.72
TNNT1-208	ENST00000587465	KIF14	Q15058	1648 aa		32	■■■□□ 2.71
TNNT1-208	ENST00000587465	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32	■■■□□ 2.71
TNNT1-208	ENST00000587465	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.95	■■■□□ 2.71
TNNT1-208	ENST00000587465	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
TNNT1-208	ENST00000587465	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		31.94	■■■□□ 2.7
TNNT1-208	ENST00000587465	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
TNNT1-208	ENST00000587465	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		31.92	■■■□□ 2.7
TNNT1-208	ENST00000587465	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		31.92	■■■□□ 2.7
TNNT1-208	ENST00000587465	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		31.9	■■■□□ 2.7
TNNT1-208	ENST00000587465	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.89	■■■□□ 2.7
TNNT1-208	ENST00000587465	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		31.87	■■■□□ 2.69
TNNT1-208	ENST00000587465	PLCH2	O75038	1416 aa		31.87	■■■□□ 2.69
TNNT1-208	ENST00000587465	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		31.85	■■■□□ 2.69
TNNT1-208	ENST00000587465	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
TNNT1-208	ENST00000587465	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TNNT1-208	ENST00000587465	MADD	Q8WXG6	1647 aa		31.83	■■■□□ 2.69
TNNT1-208	ENST00000587465	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TNNT1-208	ENST00000587465	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		31.79	■■■□□ 2.68

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