RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587385.6

PDCD2L-204, Transcript of programmed cell death 2 like, humanhuman

TSL 5

Gene PDCD2L, Length 1,227 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2L-204ENST00000587385 ARHGEF11O15085 1522 aa43.7■■■■■ 4.59
PDCD2L-204ENST00000587385 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.67■■■■■ 4.58
PDCD2L-204ENST00000587385 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.67■■■■■ 4.58
PDCD2L-204ENST00000587385 KIF21BO75037 1637 aa43.67■■■■■ 4.58
PDCD2L-204ENST00000587385 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.67■■■■■ 4.58
PDCD2L-204ENST00000587385 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.62■■■■■ 4.57
PDCD2L-204ENST00000587385 IQGAP2Q13576 1575 aa43.58■■■■■ 4.57
PDCD2L-204ENST00000587385 JPH4Q96JJ6 628 aa43.58■■■■■ 4.57
PDCD2L-204ENST00000587385 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.45■■■■■ 4.55
PDCD2L-204ENST00000587385 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.4■■■■■ 4.54
PDCD2L-204ENST00000587385 GOLGA3Q08378 1498 aa43.39■■■■■ 4.54
PDCD2L-204ENST00000587385 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.38■■■■■ 4.53
PDCD2L-204ENST00000587385 ARAP1Q96P48 1450 aa43.36■■■■■ 4.53
PDCD2L-204ENST00000587385 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.28■■■■■ 4.52
PDCD2L-204ENST00000587385 DISP1Q96F81 1524 aa43.22■■■■■ 4.51
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PDCD2L-204ENST00000587385 SAMD9Q5K651 1589 aa43.03■■■■■ 4.48
PDCD2L-204ENST00000587385 PTPRGP23470 1445 aa43■■■■■ 4.47
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PDCD2L-204ENST00000587385 P3H3Q8IVL6 736 aa42.76■■■■■ 4.44
PDCD2L-204ENST00000587385 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.75■■■■■ 4.43
PDCD2L-204ENST00000587385 UACAQ9BZF9 1416 aa42.75■■■■■ 4.43
PDCD2L-204ENST00000587385 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.74■■■■■ 4.43
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PDCD2L-204ENST00000587385 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.68■■■■■ 4.42
PDCD2L-204ENST00000587385 ABCA8O94911 1581 aa42.66■■■■■ 4.42
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PDCD2L-204ENST00000587385 CLIP1P30622 1438 aa42.59■■■■■ 4.41
PDCD2L-204ENST00000587385 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.57■■■■■ 4.41
PDCD2L-204ENST00000587385 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.53■■■■■ 4.4
PDCD2L-204ENST00000587385 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.51■■■■■ 4.4
PDCD2L-204ENST00000587385 FMN1Q68DA7 1419 aa42.51■■■■■ 4.4
PDCD2L-204ENST00000587385 CEP162Q5TB80 1403 aa42.5■■■■■ 4.39
PDCD2L-204ENST00000587385 MAPKBP1O60336 1514 aa42.46■■■■■ 4.39
PDCD2L-204ENST00000587385 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.42■■■■■ 4.38
PDCD2L-204ENST00000587385 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
PDCD2L-204ENST00000587385 ATP10BO94823 1461 aa42.28■■■■■ 4.36
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PDCD2L-204ENST00000587385 ASXL2Q76L83 1435 aa42.24■■■■■ 4.35
PDCD2L-204ENST00000587385 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.2■■■■■ 4.35
PDCD2L-204ENST00000587385 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
PDCD2L-204ENST00000587385 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.17■■■■■ 4.34
PDCD2L-204ENST00000587385 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.16■■■■■ 4.34
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PDCD2L-204ENST00000587385 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.15■■■■■ 4.34
PDCD2L-204ENST00000587385 DIP2BQ9P265 1576 aa42.13■■■■■ 4.33
PDCD2L-204ENST00000587385 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.12■■■■■ 4.33
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PDCD2L-204ENST00000587385 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.09■■■■■ 4.33
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PDCD2L-204ENST00000587385 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.03■■■■■ 4.32
PDCD2L-204ENST00000587385 VPS8Q8N3P4 1428 aa42■■■■■ 4.31
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PDCD2L-204ENST00000587385 CD109Q6YHK3 1445 aa41.68■■■■■ 4.26
PDCD2L-204ENST00000587385 MAP3K1Q13233 1512 aa41.67■■■■■ 4.26
PDCD2L-204ENST00000587385 KIF14Q15058 1648 aa41.66■■■■■ 4.26
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PDCD2L-204ENST00000587385 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.36■■■■■ 4.21
PDCD2L-204ENST00000587385 PREX2Q70Z35 1606 aa41.34■■■■■ 4.21
PDCD2L-204ENST00000587385 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.34■■■■■ 4.21
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PDCD2L-204ENST00000587385 FANCAO15360 1455 aa41.32■■■■■ 4.2
PDCD2L-204ENST00000587385 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
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