RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587385.6

PDCD2L-204, Transcript of programmed cell death 2 like, humanhuman

TSL 5

Gene PDCD2L, Length 1,227 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2L-204ENST00000587385 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.38■■■■■ 7.74
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PDCD2L-204ENST00000587385 NACADO15069 1562 aa52.74■■■■■ 6.03
PDCD2L-204ENST00000587385 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.67■■■■■ 6.02
PDCD2L-204ENST00000587385 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.63■■■■■ 6.02
PDCD2L-204ENST00000587385 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.58■■■■■ 6.01
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PDCD2L-204ENST00000587385 SCRIBQ14160 1630 aa51.2■■■■■ 5.79
PDCD2L-204ENST00000587385 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.02■■■■■ 5.76
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PDCD2L-204ENST00000587385 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.31■■■■■ 5.48
PDCD2L-204ENST00000587385 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.25■■■■■ 5.47
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PDCD2L-204ENST00000587385 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.8■■■■■ 5.4
PDCD2L-204ENST00000587385 SMARCA2P51531 1590 aa48.7■■■■■ 5.39
PDCD2L-204ENST00000587385 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.68■■■■■ 5.38
PDCD2L-204ENST00000587385 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.68■■■■■ 5.38
PDCD2L-204ENST00000587385 NCAPD3P42695 1498 aa48.62■■■■■ 5.37
PDCD2L-204ENST00000587385 HMGXB3Q12766 1538 aa48.46■■■■■ 5.35
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PDCD2L-204ENST00000587385 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.26■■■■■ 5.16
PDCD2L-204ENST00000587385 NESP48681 1621 aa47.21■■■■■ 5.15
PDCD2L-204ENST00000587385 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.2■■■■■ 5.15
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PDCD2L-204ENST00000587385 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.92■■■■■ 5.1
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PDCD2L-204ENST00000587385 PRDM2Q13029 1718 aa46.85■■■■■ 5.09
PDCD2L-204ENST00000587385 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.77■■■■■ 5.08
PDCD2L-204ENST00000587385 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.64■■■■■ 5.06
PDCD2L-204ENST00000587385 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.55■■■■■ 5.04
PDCD2L-204ENST00000587385 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
PDCD2L-204ENST00000587385 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.39■■■■■ 5.02
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PDCD2L-204ENST00000587385 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.97■■■■■ 4.95
PDCD2L-204ENST00000587385 TOPBP1Q92547 1522 aa45.96■■■■■ 4.95
PDCD2L-204ENST00000587385 CUX1P39880 1505 aa45.76■■■■■ 4.92
PDCD2L-204ENST00000587385 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.64■■■■■ 4.9
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PDCD2L-204ENST00000587385 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.53■■■■■ 4.88
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PDCD2L-204ENST00000587385 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.33■■■■■ 4.85
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PDCD2L-204ENST00000587385 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.66■■■■■ 4.74
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PDCD2L-204ENST00000587385 CHD1O14646 1710 aa44.54■■■■■ 4.72
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PDCD2L-204ENST00000587385 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.32■■■■■ 4.69
PDCD2L-204ENST00000587385 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.3■■■■■ 4.68
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PDCD2L-204ENST00000587385 NUP160Q12769 1436 aa44.07■■■■■ 4.64
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PDCD2L-204ENST00000587385 CEP170Q5SW79 1584 aa44.01■■■■■ 4.64
PDCD2L-204ENST00000587385 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.98■■■■■ 4.63
PDCD2L-204ENST00000587385 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.97■■■■■ 4.63
PDCD2L-204ENST00000587385 PRXQ9BXM0 1461 aa43.94■■■■■ 4.62
PDCD2L-204ENST00000587385 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.77■■■■■ 4.6
PDCD2L-204ENST00000587385 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.76■■■■■ 4.6
PDCD2L-204ENST00000587385 SHROOM2Q13796 1616 aa43.73■■■■■ 4.59
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