RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584250.1

TTC39C-209, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 39C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC39C, Length 1,048 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39C-209ENST00000584250 JPH4Q96JJ6 628 aa42.06■■■■■ 4.32
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TTC39C-209ENST00000584250 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
TTC39C-209ENST00000584250 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.99■■■■■ 4.31
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TTC39C-209ENST00000584250 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.77■■■■■ 4.28
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TTC39C-209ENST00000584250 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.61■■■■■ 4.25
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TTC39C-209ENST00000584250 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.52■■■■■ 4.24
TTC39C-209ENST00000584250 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
TTC39C-209ENST00000584250 PTPRGP23470 1445 aa41.45■■■■■ 4.23
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TTC39C-209ENST00000584250 KIF21BO75037 1637 aa41.35■■■■■ 4.21
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TTC39C-209ENST00000584250 UACAQ9BZF9 1416 aa41.16■■■■■ 4.18
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TTC39C-209ENST00000584250 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.08■■■■■ 4.17
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TTC39C-209ENST00000584250 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.95■■■■■ 4.15
TTC39C-209ENST00000584250 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.94■■■■■ 4.14
TTC39C-209ENST00000584250 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.91■■■■■ 4.14
TTC39C-209ENST00000584250 DIP2BQ9P265 1576 aa40.9■■■■■ 4.14
TTC39C-209ENST00000584250 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
TTC39C-209ENST00000584250 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.89■■■■■ 4.14
TTC39C-209ENST00000584250 ASXL2Q76L83 1435 aa40.88■■■■■ 4.13
TTC39C-209ENST00000584250 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.8■■■■■ 4.12
TTC39C-209ENST00000584250 ARID3CA6NKF2 412 aa40.77■■■■■ 4.12
TTC39C-209ENST00000584250 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.71■■■■■ 4.11
TTC39C-209ENST00000584250 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.71■■■■■ 4.11
TTC39C-209ENST00000584250 ATP10BO94823 1461 aa40.66■■■■■ 4.1
TTC39C-209ENST00000584250 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.1
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TTC39C-209ENST00000584250 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
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TTC39C-209ENST00000584250 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.27■■■■■ 4.04
TTC39C-209ENST00000584250 CD109Q6YHK3 1445 aa40.26■■■■■ 4.04
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TTC39C-209ENST00000584250 CEP162Q5TB80 1403 aa40.18■■■■■ 4.02
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TTC39C-209ENST00000584250 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.16■■■■■ 4.02
TTC39C-209ENST00000584250 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.16■■■■■ 4.02
TTC39C-209ENST00000584250 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.15■■■■■ 4.02
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TTC39C-209ENST00000584250 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.65■■■■□ 3.94
TTC39C-209ENST00000584250 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.6■■■■□ 3.93
TTC39C-209ENST00000584250 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
TTC39C-209ENST00000584250 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.58■■■■□ 3.93
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TTC39C-209ENST00000584250 ADGRL1O94910 1474 aa39.56■■■■□ 3.92
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