RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583486.1

GPS1-218, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPS1, Length 796 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-218ENST00000583486 MAPKBP1O60336 1514 aa26.7■■□□□ 1.87
GPS1-218ENST00000583486 TOP2BQ02880 1626 aa26.69■■□□□ 1.86
GPS1-218ENST00000583486 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.68■■□□□ 1.86
GPS1-218ENST00000583486 DIP2BQ9P265 1576 aa26.66■■□□□ 1.86
GPS1-218ENST00000583486 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.65■■□□□ 1.86
GPS1-218ENST00000583486 KDM6BO15054 1643 aa26.64■■□□□ 1.85
GPS1-218ENST00000583486 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.59■■□□□ 1.85
GPS1-218ENST00000583486 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
GPS1-218ENST00000583486 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.57■■□□□ 1.84
GPS1-218ENST00000583486 TSPOAP1O95153 1857 aa26.48■■□□□ 1.83
GPS1-218ENST00000583486 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
GPS1-218ENST00000583486 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.42■■□□□ 1.82
GPS1-218ENST00000583486 PTPRGP23470 1445 aa26.32■■□□□ 1.8
GPS1-218ENST00000583486 ADGRL1O94910 1474 aa26.3■■□□□ 1.8
GPS1-218ENST00000583486 ABCC2Q92887 1545 aa26.27■■□□□ 1.8
GPS1-218ENST00000583486 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.26■■□□□ 1.79
GPS1-218ENST00000583486 CUL7Q14999 1698 aa26.25■■□□□ 1.79
GPS1-218ENST00000583486 ASXL2Q76L83 1435 aa26.24■■□□□ 1.79
GPS1-218ENST00000583486 IGF1RP08069 1367 aa26.24■■□□□ 1.79
GPS1-218ENST00000583486 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
GPS1-218ENST00000583486 GLI2P10070 1586 aa26.24■■□□□ 1.79
GPS1-218ENST00000583486 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.22■■□□□ 1.79
GPS1-218ENST00000583486 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.2■■□□□ 1.79
GPS1-218ENST00000583486 KIF27Q86VH2 1401 aa26.2■■□□□ 1.78
GPS1-218ENST00000583486 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
GPS1-218ENST00000583486 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.16■■□□□ 1.78
GPS1-218ENST00000583486 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.13■■□□□ 1.77
GPS1-218ENST00000583486 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.11■■□□□ 1.77
GPS1-218ENST00000583486 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
GPS1-218ENST00000583486 UACAQ9BZF9 1416 aa26.08■■□□□ 1.77
GPS1-218ENST00000583486 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.07■■□□□ 1.76
GPS1-218ENST00000583486 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
GPS1-218ENST00000583486 IQGAP2Q13576 1575 aa26.06■■□□□ 1.76
GPS1-218ENST00000583486 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.05■■□□□ 1.76
GPS1-218ENST00000583486 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.01■■□□□ 1.75
GPS1-218ENST00000583486 DISP1Q96F81 1524 aa25.95■■□□□ 1.74
GPS1-218ENST00000583486 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
GPS1-218ENST00000583486 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.88■■□□□ 1.73
GPS1-218ENST00000583486 FBXO41Q8TF61 875 aa25.87■■□□□ 1.73
GPS1-218ENST00000583486 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.85■■□□□ 1.73
GPS1-218ENST00000583486 CD109Q6YHK3 1445 aa25.8■■□□□ 1.72
GPS1-218ENST00000583486 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.8■■□□□ 1.72
GPS1-218ENST00000583486 KIAA0556O60303 1618 aa25.8■■□□□ 1.72
GPS1-218ENST00000583486 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.77■■□□□ 1.72
GPS1-218ENST00000583486 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.75■■□□□ 1.71
GPS1-218ENST00000583486 KCNH8Q96L42 1107 aa25.73■■□□□ 1.71
GPS1-218ENST00000583486 KIF21BO75037 1637 aa25.7■■□□□ 1.71
GPS1-218ENST00000583486 GOLGA3Q08378 1498 aa25.64■■□□□ 1.69
GPS1-218ENST00000583486 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.63■■□□□ 1.69
GPS1-218ENST00000583486 ABCA8O94911 1581 aa25.61■■□□□ 1.69
GPS1-218ENST00000583486 PTPRMP28827 1452 aa25.6■■□□□ 1.69
GPS1-218ENST00000583486 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.56■■□□□ 1.68
GPS1-218ENST00000583486 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
GPS1-218ENST00000583486 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.55■■□□□ 1.68
GPS1-218ENST00000583486 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.54■■□□□ 1.68
GPS1-218ENST00000583486 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
GPS1-218ENST00000583486 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
GPS1-218ENST00000583486 RAPGEF3O95398 923 aa25.45■■□□□ 1.66
GPS1-218ENST00000583486 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.43■■□□□ 1.66
GPS1-218ENST00000583486 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.42■■□□□ 1.66
GPS1-218ENST00000583486 ARID3CA6NKF2 412 aa25.42■■□□□ 1.66
GPS1-218ENST00000583486 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.42■■□□□ 1.66
GPS1-218ENST00000583486 NEO1Q92859 1461 aa25.41■■□□□ 1.66
GPS1-218ENST00000583486 ATP10BO94823 1461 aa25.4■■□□□ 1.66
GPS1-218ENST00000583486 MADDQ8WXG6 1647 aa25.4■■□□□ 1.66
GPS1-218ENST00000583486 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.31■■□□□ 1.64
GPS1-218ENST00000583486 P3H3Q8IVL6 736 aa25.29■■□□□ 1.64
GPS1-218ENST00000583486 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
GPS1-218ENST00000583486 PRXQ9BXM0 1461 aa25.28■■□□□ 1.64
GPS1-218ENST00000583486 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
GPS1-218ENST00000583486 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
GPS1-218ENST00000583486 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.27■■□□□ 1.64
GPS1-218ENST00000583486 HSPA2P54652 639 aa25.27■■□□□ 1.64
GPS1-218ENST00000583486 CERKQ8TCT0 537 aa25.26■■□□□ 1.63
GPS1-218ENST00000583486 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.25■■□□□ 1.63
GPS1-218ENST00000583486 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
GPS1-218ENST00000583486 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.21■■□□□ 1.63
GPS1-218ENST00000583486 FANCAO15360 1455 aa25.21■■□□□ 1.63
GPS1-218ENST00000583486 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.2■■□□□ 1.62
GPS1-218ENST00000583486 AKNAQ7Z591 1439 aa25.19■■□□□ 1.62
GPS1-218ENST00000583486 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.17■■□□□ 1.62
GPS1-218ENST00000583486 RICTORQ6R327 1708 aa25.16■■□□□ 1.62
GPS1-218ENST00000583486 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.14■■□□□ 1.62
GPS1-218ENST00000583486 SAMD9Q5K651 1589 aa25.14■■□□□ 1.61
GPS1-218ENST00000583486 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.13■■□□□ 1.61
GPS1-218ENST00000583486 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.12■■□□□ 1.61
GPS1-218ENST00000583486 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
GPS1-218ENST00000583486 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.11■■□□□ 1.61
GPS1-218ENST00000583486 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.1■■□□□ 1.61
GPS1-218ENST00000583486 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.1■■□□□ 1.61
GPS1-218ENST00000583486 SOCS7O14512 581 aa25.09■■□□□ 1.61
GPS1-218ENST00000583486 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.09■■□□□ 1.61
GPS1-218ENST00000583486 MLECQ14165 292 aa25.06■■□□□ 1.6
GPS1-218ENST00000583486 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.05■■□□□ 1.6
GPS1-218ENST00000583486 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.05■■□□□ 1.6
GPS1-218ENST00000583486 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.04■■□□□ 1.6
GPS1-218ENST00000583486 ILDR2Q71H61 639 aa25.04■■□□□ 1.6
GPS1-218ENST00000583486 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.03■■□□□ 1.6
GPS1-218ENST00000583486 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
GPS1-218ENST00000583486 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms