RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582955.5

SMARCE1-218, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-218ENST00000582955 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.31■■□□□ 1
SMARCE1-218ENST00000582955 ARAP1Q96P48 1450 aa21.31■■□□□ 1
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SMARCE1-218ENST00000582955 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.21■□□□□ 0.99
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SMARCE1-218ENST00000582955 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.2■□□□□ 0.98
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SMARCE1-218ENST00000582955 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.99■□□□□ 0.95
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SMARCE1-218ENST00000582955 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.62■□□□□ 0.89
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SMARCE1-218ENST00000582955 DIP2BQ9P265 1576 aa20.61■□□□□ 0.89
SMARCE1-218ENST00000582955 ASXL2Q76L83 1435 aa20.61■□□□□ 0.89
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SMARCE1-218ENST00000582955 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
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SMARCE1-218ENST00000582955 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.38■□□□□ 0.85
SMARCE1-218ENST00000582955 HECW1Q76N89 1606 aa20.36■□□□□ 0.85
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SMARCE1-218ENST00000582955 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SMARCE1-218ENST00000582955 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1-218ENST00000582955 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1-218ENST00000582955 CD109Q6YHK3 1445 aa20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1-218ENST00000582955 KDM6BO15054 1643 aa20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1-218ENST00000582955 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1-218ENST00000582955 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1-218ENST00000582955 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SMARCE1-218ENST00000582955 CEP162Q5TB80 1403 aa20.28■□□□□ 0.84
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SMARCE1-218ENST00000582955 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.22■□□□□ 0.83
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SMARCE1-218ENST00000582955 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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SMARCE1-218ENST00000582955 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.15■□□□□ 0.82
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SMARCE1-218ENST00000582955 PLCH2O75038 1416 aa20.05■□□□□ 0.8
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SMARCE1-218ENST00000582955 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.03■□□□□ 0.8
SMARCE1-218ENST00000582955 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.01■□□□□ 0.79
SMARCE1-218ENST00000582955 RAPGEF3O95398 923 aa20■□□□□ 0.79
SMARCE1-218ENST00000582955 ARHGAP5Q13017 1502 aa20■□□□□ 0.79
SMARCE1-218ENST00000582955 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.99■□□□□ 0.79
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