RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579527.5

TSPOAP1-AS1-203, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,042 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.26■■■■□ 3.72
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.26■■■■□ 3.72
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.24■■■■□ 3.71
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.21■■■■□ 3.71
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.18■■■■□ 3.7
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP38.17■■■■□ 3.7
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38.17■■■■□ 3.7
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.13■■■■□ 3.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.13■■■■□ 3.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.13■■■■□ 3.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CLSPNQ9HAW4 1339 aa38.06■■■■□ 3.68
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.06■■■■□ 3.68
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.06■■■■□ 3.68
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 P3H3Q8IVL6 736 aa38.05■■■■□ 3.68
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SAMD9Q5K651 1589 aa38.05■■■■□ 3.68
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PBRM1Q86U86 1689 aa38.04■■■■□ 3.68
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FMN1Q68DA7 1419 aa37.99■■■■□ 3.67
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.91■■■■□ 3.66
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.9■■■■□ 3.66
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ADAMTS12P58397 1594 aa37.85■■■■□ 3.65
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 WDR62O43379 1518 aa37.83■■■■□ 3.65
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 IFT140Q96RY7 1462 aa37.77■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.76■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GRIN2BQ13224 1484 aa37.76■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ITGAEP38570 1179 aa37.73■■■■□ 3.63
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 IQGAP2Q13576 1575 aa37.69■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.69■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP37.69■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa37.67■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.64■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.6■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.57■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.54■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.54■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.52■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 HECW1Q76N89 1606 aa37.51■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.5■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MAPKBP1O60336 1514 aa37.49■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NEUROD1Q13562 356 aa37.48■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ERCC6Q03468 1493 aa37.47■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NCOA2Q15596 1464 aa37.46■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.4■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ARHGEF11O15085 1522 aa37.39■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.38■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.36■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GRIN2AQ12879 1464 aa37.35■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MIER1Q8N108 512 aa37.32■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KIAA0556O60303 1618 aa37.31■■■■□ 3.56
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.27■■■■□ 3.56
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DISP1Q96F81 1524 aa37.24■■■■□ 3.55
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 HFM1A2PYH4 1435 aa37.2■■■■□ 3.55
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PTPRKQ15262 1439 aa37.19■■■■□ 3.54
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SYNJ2O15056 1496 aa37.17■■■■□ 3.54
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CEP170Q5SW79 1584 aa37.12■■■■□ 3.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.11■■■■□ 3.53
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NAIPQ13075 1403 aa37.06■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa37.06■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MIA2Q96PC5 1412 aa37.06■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa37.05■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 UACAQ9BZF9 1416 aa37.03■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.01■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.98■■■■□ 3.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NUP160Q12769 1436 aa36.98■■■■□ 3.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 AKNAQ7Z591 1439 aa36.95■■■■□ 3.51
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ARID3CA6NKF2 412 aa36.88■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.85■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FBLN2P98095 1184 aa36.81■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.77■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.76■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 JPH4Q96JJ6 628 aa36.76■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.74■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.72■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.72■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DAPK1P53355 1430 aa36.71■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KDM6BO15054 1643 aa36.71■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TONSLQ96HA7 1378 aa36.69■■■■□ 3.46
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ROCK1Q13464 1354 aa36.69■■■■□ 3.46
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms