RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575783.5

CTDNEP1-211, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-211ENST00000575783 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.4■■■□□ 2.3
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CTDNEP1-211ENST00000575783 TOP2BQ02880 1626 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-211ENST00000575783 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.3■■■□□ 2.28
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAPKBP1O60336 1514 aa29.26■■■□□ 2.27
CTDNEP1-211ENST00000575783 DIP2BQ9P265 1576 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1-211ENST00000575783 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1-211ENST00000575783 KDM6BO15054 1643 aa29.19■■■□□ 2.26
CTDNEP1-211ENST00000575783 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.19■■■□□ 2.26
CTDNEP1-211ENST00000575783 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.18■■■□□ 2.26
CTDNEP1-211ENST00000575783 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
CTDNEP1-211ENST00000575783 TSPOAP1O95153 1857 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-211ENST00000575783 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDNEP1-211ENST00000575783 PTPRGP23470 1445 aa29.02■■■□□ 2.24
CTDNEP1-211ENST00000575783 IGF1RP08069 1367 aa29■■■□□ 2.23
CTDNEP1-211ENST00000575783 ASXL2Q76L83 1435 aa28.88■■■□□ 2.21
CTDNEP1-211ENST00000575783 KIF27Q86VH2 1401 aa28.87■■■□□ 2.21
CTDNEP1-211ENST00000575783 ADGRL1O94910 1474 aa28.87■■■□□ 2.21
CTDNEP1-211ENST00000575783 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.87■■■□□ 2.21
CTDNEP1-211ENST00000575783 ABCC2Q92887 1545 aa28.86■■■□□ 2.21
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.85■■■□□ 2.21
CTDNEP1-211ENST00000575783 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.84■■■□□ 2.21
CTDNEP1-211ENST00000575783 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-211ENST00000575783 CUL7Q14999 1698 aa28.78■■■□□ 2.2
CTDNEP1-211ENST00000575783 GLI2P10070 1586 aa28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1-211ENST00000575783 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
CTDNEP1-211ENST00000575783 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
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CTDNEP1-211ENST00000575783 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.7■■■□□ 2.18
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CTDNEP1-211ENST00000575783 IQGAP2Q13576 1575 aa28.62■■■□□ 2.17
CTDNEP1-211ENST00000575783 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.62■■■□□ 2.17
CTDNEP1-211ENST00000575783 DISP1Q96F81 1524 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-211ENST00000575783 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-211ENST00000575783 KCNH8Q96L42 1107 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-211ENST00000575783 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.45■■■□□ 2.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.43■■■□□ 2.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 CD109Q6YHK3 1445 aa28.42■■■□□ 2.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.39■■■□□ 2.13
CTDNEP1-211ENST00000575783 FBXO41Q8TF61 875 aa28.37■■■□□ 2.13
CTDNEP1-211ENST00000575783 KIAA0556O60303 1618 aa28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.33■■■□□ 2.13
CTDNEP1-211ENST00000575783 ARID3CA6NKF2 412 aa28.22■■■□□ 2.11
CTDNEP1-211ENST00000575783 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-211ENST00000575783 KIF21BO75037 1637 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-211ENST00000575783 GOLGA3Q08378 1498 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-211ENST00000575783 ABCA8O94911 1581 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-211ENST00000575783 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 PTPRMP28827 1452 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 RAPGEF3O95398 923 aa28.12■■■□□ 2.09
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
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CTDNEP1-211ENST00000575783 P3H3Q8IVL6 736 aa28.08■■■□□ 2.09
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CTDNEP1-211ENST00000575783 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ADAMTSL3P82987 1691 aa28■■■□□ 2.07
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CTDNEP1-211ENST00000575783 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.93■■■□□ 2.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 NEO1Q92859 1461 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 HSPA2P54652 639 aa27.9■■■□□ 2.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 PRXQ9BXM0 1461 aa27.89■■■□□ 2.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 MADDQ8WXG6 1647 aa27.88■■■□□ 2.05
CTDNEP1-211ENST00000575783 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.86■■■□□ 2.05
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CTDNEP1-211ENST00000575783 CERKQ8TCT0 537 aa27.79■■■□□ 2.04
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CTDNEP1-211ENST00000575783 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
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CTDNEP1-211ENST00000575783 MLECQ14165 292 aa27.73■■■□□ 2.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.71■■■□□ 2.03
CTDNEP1-211ENST00000575783 AKNAQ7Z591 1439 aa27.71■■■□□ 2.03
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CTDNEP1-211ENST00000575783 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.69■■■□□ 2.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 FANCAO15360 1455 aa27.65■■■□□ 2.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 SAMD9Q5K651 1589 aa27.65■■■□□ 2.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.64■■■□□ 2.02
CTDNEP1-211ENST00000575783 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.62■■■□□ 2.01
CTDNEP1-211ENST00000575783 RICTORQ6R327 1708 aa27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-211ENST00000575783 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-211ENST00000575783 ILDR2Q71H61 639 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-211ENST00000575783 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 23e-9■■□□□ 12.3
CTDNEP1-211ENST00000575783 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-211ENST00000575783 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.51■■■□□ 2
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.51■■■□□ 2
CTDNEP1-211ENST00000575783 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.51■■□□□ 1.99
CTDNEP1-211ENST00000575783 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.5■■□□□ 1.99
CTDNEP1-211ENST00000575783 SOCS7O14512 581 aa27.5■■□□□ 1.99
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