RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575106.5

DNAJA3-211, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A3, humanhuman

TSL 4

Gene DNAJA3, Length 837 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3-211ENST00000575106 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.74■■■■□ 3.31
DNAJA3-211ENST00000575106 CEP170Q5SW79 1584 aa35.72■■■■□ 3.31
DNAJA3-211ENST00000575106 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.71■■■■□ 3.31
DNAJA3-211ENST00000575106 NUP160Q12769 1436 aa35.68■■■■□ 3.3
DNAJA3-211ENST00000575106 PRXQ9BXM0 1461 aa35.67■■■■□ 3.3
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DNAJA3-211ENST00000575106 KIF21BO75037 1637 aa35.62■■■■□ 3.29
DNAJA3-211ENST00000575106 SHROOM2Q13796 1616 aa35.61■■■■□ 3.29
DNAJA3-211ENST00000575106 GOLGA3Q08378 1498 aa35.45■■■■□ 3.27
DNAJA3-211ENST00000575106 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.38■■■■□ 3.25
DNAJA3-211ENST00000575106 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.38■■■■□ 3.25
DNAJA3-211ENST00000575106 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
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DNAJA3-211ENST00000575106 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.24■■■■□ 3.23
DNAJA3-211ENST00000575106 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.23■■■■□ 3.23
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DNAJA3-211ENST00000575106 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.19■■■■□ 3.22
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DNAJA3-211ENST00000575106 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.01■■■■□ 3.19
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DNAJA3-211ENST00000575106 SAMD9Q5K651 1589 aa34.87■■■■□ 3.17
DNAJA3-211ENST00000575106 DIP2BQ9P265 1576 aa34.87■■■■□ 3.17
DNAJA3-211ENST00000575106 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.86■■■■□ 3.17
DNAJA3-211ENST00000575106 KIAA0556O60303 1618 aa34.86■■■■□ 3.17
DNAJA3-211ENST00000575106 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.85■■■■□ 3.17
DNAJA3-211ENST00000575106 DISP1Q96F81 1524 aa34.85■■■■□ 3.17
DNAJA3-211ENST00000575106 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.84■■■■□ 3.17
DNAJA3-211ENST00000575106 CEP162Q5TB80 1403 aa34.83■■■■□ 3.17
DNAJA3-211ENST00000575106 CLIP1P30622 1438 aa34.81■■■■□ 3.16
DNAJA3-211ENST00000575106 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.81■■■■□ 3.16
DNAJA3-211ENST00000575106 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.77■■■■□ 3.16
DNAJA3-211ENST00000575106 P3H3Q8IVL6 736 aa34.72■■■■□ 3.15
DNAJA3-211ENST00000575106 PTPRGP23470 1445 aa34.71■■■■□ 3.15
DNAJA3-211ENST00000575106 TSPOAP1O95153 1857 aa34.68■■■■□ 3.14
DNAJA3-211ENST00000575106 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.67■■■■□ 3.14
DNAJA3-211ENST00000575106 ABCC2Q92887 1545 aa34.59■■■■□ 3.13
DNAJA3-211ENST00000575106 KDM6BO15054 1643 aa34.58■■■■□ 3.13
DNAJA3-211ENST00000575106 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.13
DNAJA3-211ENST00000575106 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.53■■■■□ 3.12
DNAJA3-211ENST00000575106 FMN1Q68DA7 1419 aa34.5■■■■□ 3.11
DNAJA3-211ENST00000575106 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
DNAJA3-211ENST00000575106 ASXL2Q76L83 1435 aa34.47■■■■□ 3.11
DNAJA3-211ENST00000575106 UACAQ9BZF9 1416 aa34.47■■■■□ 3.11
DNAJA3-211ENST00000575106 GLI2P10070 1586 aa34.45■■■■□ 3.11
DNAJA3-211ENST00000575106 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.43■■■■□ 3.1
DNAJA3-211ENST00000575106 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.41■■■■□ 3.1
DNAJA3-211ENST00000575106 ABCA8O94911 1581 aa34.41■■■■□ 3.1
DNAJA3-211ENST00000575106 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.39■■■■□ 3.1
DNAJA3-211ENST00000575106 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.37■■■■□ 3.09
DNAJA3-211ENST00000575106 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
DNAJA3-211ENST00000575106 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
DNAJA3-211ENST00000575106 HECW1Q76N89 1606 aa34.31■■■■□ 3.08
DNAJA3-211ENST00000575106 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.3■■■■□ 3.08
DNAJA3-211ENST00000575106 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.3■■■■□ 3.08
DNAJA3-211ENST00000575106 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.28■■■■□ 3.08
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DNAJA3-211ENST00000575106 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.26■■■■□ 3.08
DNAJA3-211ENST00000575106 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
DNAJA3-211ENST00000575106 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
DNAJA3-211ENST00000575106 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.21■■■■□ 3.07
DNAJA3-211ENST00000575106 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
DNAJA3-211ENST00000575106 ARID3CA6NKF2 412 aa34.12■■■■□ 3.05
DNAJA3-211ENST00000575106 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.12■■■■□ 3.05
DNAJA3-211ENST00000575106 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.11■■■■□ 3.05
DNAJA3-211ENST00000575106 ATP10BO94823 1461 aa34.1■■■■□ 3.05
DNAJA3-211ENST00000575106 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
DNAJA3-211ENST00000575106 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.08■■■■□ 3.05
DNAJA3-211ENST00000575106 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.06■■■■□ 3.04
DNAJA3-211ENST00000575106 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
DNAJA3-211ENST00000575106 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
DNAJA3-211ENST00000575106 TIAM1Q13009 1591 aa34.01■■■■□ 3.03
DNAJA3-211ENST00000575106 APLP2Q06481 763 aa34■■■■□ 3.03
DNAJA3-211ENST00000575106 MAP3K1Q13233 1512 aa33.98■■■■□ 3.03
DNAJA3-211ENST00000575106 ADGRL1O94910 1474 aa33.96■■■■□ 3.03
DNAJA3-211ENST00000575106 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
DNAJA3-211ENST00000575106 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.93■■■■□ 3.02
DNAJA3-211ENST00000575106 CD109Q6YHK3 1445 aa33.9■■■■□ 3.02
DNAJA3-211ENST00000575106 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.88■■■■□ 3.01
DNAJA3-211ENST00000575106 KCNH8Q96L42 1107 aa33.87■■■■□ 3.01
DNAJA3-211ENST00000575106 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.83■■■■□ 3.01
DNAJA3-211ENST00000575106 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.83■■■■□ 3.01
DNAJA3-211ENST00000575106 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
DNAJA3-211ENST00000575106 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.81■■■■□ 3
DNAJA3-211ENST00000575106 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
DNAJA3-211ENST00000575106 KIF14Q15058 1648 aa33.74■■■□□ 2.99
DNAJA3-211ENST00000575106 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
DNAJA3-211ENST00000575106 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.71■■■□□ 2.99
DNAJA3-211ENST00000575106 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.68■■■□□ 2.98
DNAJA3-211ENST00000575106 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
DNAJA3-211ENST00000575106 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.61■■■□□ 2.972e-10■■■■□ 24.5
DNAJA3-211ENST00000575106 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.6■■■□□ 2.97
DNAJA3-211ENST00000575106 NCOA2Q15596 1464 aa33.59■■■□□ 2.97
DNAJA3-211ENST00000575106 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.58■■■□□ 2.97
DNAJA3-211ENST00000575106 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.56■■■□□ 2.96
DNAJA3-211ENST00000575106 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.53■■■□□ 2.96
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