RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574427.1

TBC1D16-208, Transcript of TBC1 domain family member 16, human

TSL 2

Gene TBC1D16, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D16-208	ENST00000574427	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		33.97	■■■■□ 3.03
TBC1D16-208	ENST00000574427	EEA1	Q15075	1411 aa		33.95	■■■■□ 3.02
TBC1D16-208	ENST00000574427	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.94	■■■■□ 3.02
TBC1D16-208	ENST00000574427	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.91	■■■■□ 3.02
TBC1D16-208	ENST00000574427	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.87	■■■■□ 3.01
TBC1D16-208	ENST00000574427	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.87	■■■■□ 3.01
TBC1D16-208	ENST00000574427	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.84	■■■■□ 3.01
TBC1D16-208	ENST00000574427	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		33.8	■■■■□ 3
TBC1D16-208	ENST00000574427	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.77	■■■■□ 3
TBC1D16-208	ENST00000574427	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.65	■■■□□ 2.98
TBC1D16-208	ENST00000574427	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.62	■■■□□ 2.97
TBC1D16-208	ENST00000574427	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TBC1D16-208	ENST00000574427	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.53	■■■□□ 2.96
TBC1D16-208	ENST00000574427	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.52	■■■□□ 2.96
TBC1D16-208	ENST00000574427	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.52	■■■□□ 2.96
TBC1D16-208	ENST00000574427	KIF21B	O75037	1637 aa		33.5	■■■□□ 2.95
TBC1D16-208	ENST00000574427	PTPRG	P23470	1445 aa		33.48	■■■□□ 2.95
TBC1D16-208	ENST00000574427	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.46	■■■□□ 2.95
TBC1D16-208	ENST00000574427	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.44	■■■□□ 2.94
TBC1D16-208	ENST00000574427	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.33	■■■□□ 2.93
TBC1D16-208	ENST00000574427	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.3	■■■□□ 2.92
TBC1D16-208	ENST00000574427	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TBC1D16-208	ENST00000574427	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
TBC1D16-208	ENST00000574427	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.28	■■■□□ 2.92
TBC1D16-208	ENST00000574427	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
TBC1D16-208	ENST00000574427	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.23	■■■□□ 2.91
TBC1D16-208	ENST00000574427	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TBC1D16-208	ENST00000574427	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TBC1D16-208	ENST00000574427	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
TBC1D16-208	ENST00000574427	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.12	■■■□□ 2.89
TBC1D16-208	ENST00000574427	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.1	■■■□□ 2.89
TBC1D16-208	ENST00000574427	ABCA8	O94911	1581 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TBC1D16-208	ENST00000574427	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.07	■■■□□ 2.88
TBC1D16-208	ENST00000574427	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.05	■■■□□ 2.88
TBC1D16-208	ENST00000574427	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TBC1D16-208	ENST00000574427	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.99	■■■□□ 2.87
TBC1D16-208	ENST00000574427	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TBC1D16-208	ENST00000574427	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
TBC1D16-208	ENST00000574427	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TBC1D16-208	ENST00000574427	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TBC1D16-208	ENST00000574427	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
TBC1D16-208	ENST00000574427	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.93	■■■□□ 2.86
TBC1D16-208	ENST00000574427	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.92	■■■□□ 2.86
TBC1D16-208	ENST00000574427	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.88	■■■□□ 2.85
TBC1D16-208	ENST00000574427	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.87	■■■□□ 2.85
TBC1D16-208	ENST00000574427	GLI2	P10070	1586 aa		32.83	■■■□□ 2.85
TBC1D16-208	ENST00000574427	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.82	■■■□□ 2.84
TBC1D16-208	ENST00000574427	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.82	■■■□□ 2.84
TBC1D16-208	ENST00000574427	ATP10B	O94823	1461 aa		32.8	■■■□□ 2.84
TBC1D16-208	ENST00000574427	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
TBC1D16-208	ENST00000574427	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
TBC1D16-208	ENST00000574427	CLIP1	P30622	1438 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TBC1D16-208	ENST00000574427	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TBC1D16-208	ENST00000574427	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TBC1D16-208	ENST00000574427	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TBC1D16-208	ENST00000574427	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
TBC1D16-208	ENST00000574427	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
TBC1D16-208	ENST00000574427	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TBC1D16-208	ENST00000574427	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TBC1D16-208	ENST00000574427	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TBC1D16-208	ENST00000574427	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TBC1D16-208	ENST00000574427	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.53	■■■□□ 2.8
TBC1D16-208	ENST00000574427	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.53	■■■□□ 2.8
TBC1D16-208	ENST00000574427	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
TBC1D16-208	ENST00000574427	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.51	■■■□□ 2.8
TBC1D16-208	ENST00000574427	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.51	■■■□□ 2.8
TBC1D16-208	ENST00000574427	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TBC1D16-208	ENST00000574427	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
TBC1D16-208	ENST00000574427	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
TBC1D16-208	ENST00000574427	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
TBC1D16-208	ENST00000574427	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TBC1D16-208	ENST00000574427	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TBC1D16-208	ENST00000574427	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78
TBC1D16-208	ENST00000574427	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TBC1D16-208	ENST00000574427	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TBC1D16-208	ENST00000574427	KDM6B	O15054	1643 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TBC1D16-208	ENST00000574427	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.32	■■■□□ 2.77
TBC1D16-208	ENST00000574427	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
TBC1D16-208	ENST00000574427	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TBC1D16-208	ENST00000574427	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.3	■■■□□ 2.76
TBC1D16-208	ENST00000574427	NEO1	Q92859	1461 aa		32.26	■■■□□ 2.75
TBC1D16-208	ENST00000574427	KIF14	Q15058	1648 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TBC1D16-208	ENST00000574427	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
TBC1D16-208	ENST00000574427	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.22	■■■□□ 2.75
TBC1D16-208	ENST00000574427	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TBC1D16-208	ENST00000574427	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.17	■■■□□ 2.74
TBC1D16-208	ENST00000574427	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TBC1D16-208	ENST00000574427	PLCH2	O75038	1416 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TBC1D16-208	ENST00000574427	FANCA	O15360	1455 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TBC1D16-208	ENST00000574427	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TBC1D16-208	ENST00000574427	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TBC1D16-208	ENST00000574427	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TBC1D16-208	ENST00000574427	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.03	■■■□□ 2.72
TBC1D16-208	ENST00000574427	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32	■■■□□ 2.71
TBC1D16-208	ENST00000574427	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
TBC1D16-208	ENST00000574427	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.96	■■■□□ 2.71
TBC1D16-208	ENST00000574427	MAP3K1	Q13233	1512 aa		31.96	■■■□□ 2.71
TBC1D16-208	ENST00000574427	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.95	■■■□□ 2.71
TBC1D16-208	ENST00000574427	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.95	■■■□□ 2.71
TBC1D16-208	ENST00000574427	ADGRL1	O94910	1474 aa		31.95	■■■□□ 2.7

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