RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa54.81■■■■■ 6.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa54.81■■■■■ 6.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 SHROOM2Q13796 1616 aa54.81■■■■■ 6.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa54.81■■■■■ 6.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIF21BO75037 1637 aa54.75■■■■■ 6.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 JPH4Q96JJ6 628 aa54.7■■■■■ 6.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 IQGAP2Q13576 1575 aa54.68■■■■■ 6.34
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa54.65■■■■■ 6.34
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ERCC6L2Q5T890 1561 aa54.52■■■■■ 6.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARAP1Q96P48 1450 aa54.46■■■■■ 6.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 GOLGA3Q08378 1498 aa54.45■■■■■ 6.31
CTDNEP1-209ENST00000574205 UGGT2Q9NYU1 1516 aa54.39■■■■■ 6.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa54.29■■■■■ 6.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYB5RLQ6IPT4 315 aa54.29■■■■■ 6.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 EHMT2Q96KQ7 1210 aa54.29■■■■■ 6.28
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBTFP17480 764 aaKnown RBP54.24■■■■■ 6.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 DISP1Q96F81 1524 aa54.23■■■■■ 6.27
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA0556O60303 1618 aa54.14■■■■■ 6.26
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNIKQ9UKE5 1360 aa54.06■■■■■ 6.24
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTPRGP23470 1445 aa53.98■■■■■ 6.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAMD9Q5K651 1589 aa53.97■■■■■ 6.23
CTDNEP1-209ENST00000574205 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP53.89■■■■■ 6.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 EFCAB5A4FU69 1503 aa53.84■■■■■ 6.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP53.84■■■■■ 6.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 P3H3Q8IVL6 736 aa53.78■■■■■ 6.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADCY10Q96PN6 1610 aa53.67■■■■■ 6.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 UACAQ9BZF9 1416 aa53.64■■■■■ 6.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 FHOD3Q2V2M9 1422 aa53.64■■■■■ 6.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa53.63■■■■■ 6.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa53.62■■■■■ 6.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa53.58■■■■■ 6.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCC2Q92887 1545 aa53.56■■■■■ 6.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLB1Q6P1J6 1458 aa53.54■■■■■ 6.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCA8O94911 1581 aa53.5■■■■■ 6.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLIP1P30622 1438 aa53.47■■■■■ 6.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP53.44■■■■■ 6.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEP162Q5TB80 1403 aa53.36■■■■■ 6.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa53.34■■■■■ 6.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 FMN1Q68DA7 1419 aa53.33■■■■■ 6.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 KDM5BQ9UGL1 1544 aa53.32■■■■■ 6.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAPKBP1O60336 1514 aa53.26■■■■■ 6.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP53.22■■■■■ 6.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP53.13■■■■■ 6.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP10BO94823 1461 aa53.06■■■■■ 6.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASXL2Q76L83 1435 aa53.04■■■■■ 6.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 HECW1Q76N89 1606 aa53.02■■■■■ 6.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARID3CA6NKF2 412 aa53.01■■■■■ 6.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRHP20396 242 aaPredicted RBP53.01■■■■■ 6.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP52.95■■■■■ 6.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa52.95■■■■■ 6.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCC10Q5T3U5 1492 aa52.92■■■■■ 6.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP52.91■■■■■ 6.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 FYCO1Q9BQS8 1478 aa52.87■■■■■ 6.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR7Q9Y4E6 1490 aa52.87■■■■■ 6.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 DIP2BQ9P265 1576 aa52.87■■■■■ 6.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP52.86■■■■■ 6.05
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KIF13AQ9H1H9 1805 aa52.85■■■■■ 6.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP52.8■■■■■ 6.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa52.77■■■■■ 6.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM69CQ0P6D2 419 aa52.76■■■■■ 6.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC18Q5T9S5 1454 aa52.71■■■■■ 6.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 VPS8Q8N3P4 1428 aa52.7■■■■■ 6.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLI2P10070 1586 aa52.68■■■■■ 6.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHD1A6NEE1 506 aa52.66■■■■■ 6.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNH8Q96L42 1107 aa52.6■■■■■ 6.01
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa52.47■■■■■ 5.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 CFAP43Q8NDM7 1665 aa52.42■■■■■ 5.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP52.41■■■■■ 5.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCA9Q8IUA7 1624 aa52.4■■■■■ 5.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPOAP1O95153 1857 aa52.4■■■■■ 5.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa52.33■■■■■ 5.97
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD109Q6YHK3 1445 aa52.32■■■■■ 5.97
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP52.28■■■■■ 5.96
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TIAM1Q13009 1591 aa52.25■■■■■ 5.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTC37Q6PGP7 1564 aa52.2■■■■■ 5.95
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP3K1Q13233 1512 aa52.2■■■■■ 5.95
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CTDNEP1-209ENST00000574205 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa52.14■■■■■ 5.94
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MYO5CQ9NQX4 1742 aa52.01■■■■■ 5.92
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PHLDB1Q86UU1 1377 aa51.86■■■■■ 5.89
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa51.81■■■■■ 5.88
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