RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 NISCHQ9Y2I1 1504 aa79.49■■■■■ 10.32
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP66.34■■■■■ 8.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCAF8L2P0C7V8 631 aa66.13■■■■■ 8.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 NACADO15069 1562 aa66.1■■■■■ 8.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa66.04■■■■■ 8.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYO15BQ96JP2 1530 aa65.92■■■■■ 8.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa65.83■■■■■ 8.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 UNC13AQ9UPW8 1703 aa64.56■■■■■ 7.93
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCRIBQ14160 1630 aa64.29■■■■■ 7.88
CTDNEP1-209ENST00000574205 BICRAQ9NZM4 1560 aa64■■■■■ 7.84
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa63.43■■■■■ 7.74
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJC5BQ9UF47 199 aa62.18■■■■■ 7.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa61.88■■■■■ 7.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 CECR2Q9BXF3 1484 aa61.83■■■■■ 7.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP61.6■■■■■ 7.45
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MROH2BQ7Z745 1585 aa61.25■■■■■ 7.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa61.08■■■■■ 7.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMARCA2P51531 1590 aa61.06■■■■■ 7.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 PEG3Q9GZU2 1588 aa60.99■■■■■ 7.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCAPD3P42695 1498 aa60.97■■■■■ 7.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP60.76■■■■■ 7.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 HMGXB3Q12766 1538 aa60.75■■■■■ 7.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 WIZO95785 1651 aa60.64■■■■■ 7.3
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC88BA6NC98 1476 aa59.3■■■■■ 7.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa59.3■■■■■ 7.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 CADPSQ9ULU8 1353 aa59.22■■■■■ 7.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 CFTRP13569 1480 aa59■■■■■ 7.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERCC6Q03468 1493 aa58.89■■■■■ 7.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDS5BQ9NTI5 1447 aa58.86■■■■■ 7.01
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa58.66■■■■■ 6.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRDM2Q13029 1718 aa58.65■■■■■ 6.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 FANCD2Q9BXW9 1451 aa58.55■■■■■ 6.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEP164Q9UPV0 1460 aa58.43■■■■■ 6.94
CTDNEP1-209ENST00000574205 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP58.33■■■■■ 6.93
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRC2Q9UBG0 1479 aa58.21■■■■■ 6.91
CTDNEP1-209ENST00000574205 CUX2O14529 1486 aa58.08■■■■■ 6.89
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR62O43379 1518 aa58.02■■■■■ 6.88
CTDNEP1-209ENST00000574205 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP57.91■■■■■ 6.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCC8Q09428 1581 aa57.73■■■■■ 6.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 TOPBP1Q92547 1522 aa57.68■■■■■ 6.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNMBPQ6XZF7 1577 aa57.66■■■■■ 6.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 CUX1P39880 1505 aa57.44■■■■■ 6.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP57.29■■■■■ 6.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP57.22■■■■■ 6.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFT140Q96RY7 1462 aa57.17■■■■■ 6.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 FGD5Q6ZNL6 1462 aa57.16■■■■■ 6.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TOP2BQ02880 1626 aa57.12■■■■■ 6.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa57.11■■■■■ 6.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYNJ1O43426 1573 aa57.11■■■■■ 6.73
CTDNEP1-209ENST00000574205 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP57.01■■■■■ 6.72
CTDNEP1-209ENST00000574205 SOGA1O94964 1423 aa56.99■■■■■ 6.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa56.94■■■■■ 6.71
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP56.84■■■■■ 6.69
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR97A6NE52 1622 aa56.69■■■■■ 6.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP56.68■■■■■ 6.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa56.65■■■■■ 6.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP56.59■■■■■ 6.652e-6■■■■■ 28.6
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa56.38■■■■■ 6.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAPVD1Q14C86 1478 aa56.35■■■■■ 6.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM41Q8WV44 630 aa56.3■■■■■ 6.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRIN2BQ13224 1484 aa56.27■■■■■ 6.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 PBRM1Q86U86 1689 aa56.22■■■■■ 6.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa56.1■■■■■ 6.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP56.07■■■■■ 6.57
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIF27Q86VH2 1401 aa56.05■■■■■ 6.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERICH3Q5RHP9 1530 aa56■■■■■ 6.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHIC1Q5VXU3 224 aa55.96■■■■■ 6.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHD1O14646 1710 aa55.86■■■■■ 6.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYNJ2O15056 1496 aa55.84■■■■■ 6.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBLN2P98095 1184 aa55.8■■■■■ 6.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAMTS12P58397 1594 aa55.8■■■■■ 6.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 OSCARQ8IYS5 282 aa55.76■■■■■ 6.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP55.75■■■■■ 6.52
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FHAD1B1AJZ9 1412 aa55.72■■■■■ 6.51
CTDNEP1-209ENST00000574205 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa55.67■■■■■ 6.5
CTDNEP1-209ENST00000574205 CUL7Q14999 1698 aa55.61■■■■■ 6.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa55.61■■■■■ 6.49
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRIN2AQ12879 1464 aa55.55■■■■■ 6.48
CTDNEP1-209ENST00000574205 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa55.42■■■■■ 6.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 EEA1Q15075 1411 aa55.36■■■■■ 6.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUP160Q12769 1436 aa55.28■■■■■ 6.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLASP1Q7Z460 1538 aa55.26■■■■■ 6.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEP170Q5SW79 1584 aa55.24■■■■■ 6.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSRNP3Q8WYN3 585 aa55.17■■■■■ 6.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa55.17■■■■■ 6.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRXQ9BXM0 1461 aa55.11■■■■■ 6.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP55.07■■■■■ 6.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa54.89■■■■■ 6.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGEF11O15085 1522 aa54.87■■■■■ 6.37
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