RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574095.1

NPLOC4-215, Transcript of NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor, human

TSL 3

Gene NPLOC4, Length 277 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPLOC4-215	ENST00000574095	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		44.78	■■■■■ 4.76
NPLOC4-215	ENST00000574095	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	44.75	■■■■■ 4.76
NPLOC4-215	ENST00000574095	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		44.71	■■■■■ 4.75
NPLOC4-215	ENST00000574095	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		44.62	■■■■■ 4.73
NPLOC4-215	ENST00000574095	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		44.35	■■■■■ 4.69
NPLOC4-215	ENST00000574095	IQGAP2	Q13576	1575 aa		44.28	■■■■■ 4.68
NPLOC4-215	ENST00000574095	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		44.16	■■■■■ 4.66
NPLOC4-215	ENST00000574095	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	44.16	■■■■■ 4.66
NPLOC4-215	ENST00000574095	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		44.16	■■■■■ 4.66
NPLOC4-215	ENST00000574095	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	44.14	■■■■■ 4.66
NPLOC4-215	ENST00000574095	PTPRG	P23470	1445 aa		44.13	■■■■■ 4.65
NPLOC4-215	ENST00000574095	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		44.08	■■■■■ 4.65
NPLOC4-215	ENST00000574095	DISP1	Q96F81	1524 aa		44.04	■■■■■ 4.64
NPLOC4-215	ENST00000574095	PRX	Q9BXM0	1461 aa		44.02	■■■■■ 4.64
NPLOC4-215	ENST00000574095	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		44.01	■■■■■ 4.64
NPLOC4-215	ENST00000574095	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		44.01	■■■■■ 4.64
NPLOC4-215	ENST00000574095	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		43.97	■■■■■ 4.63
NPLOC4-215	ENST00000574095	MAPKBP1	O60336	1514 aa		43.95	■■■■■ 4.63
NPLOC4-215	ENST00000574095	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		43.88	■■■■■ 4.62
NPLOC4-215	ENST00000574095	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		43.88	■■■■■ 4.61
NPLOC4-215	ENST00000574095	KIAA0556	O60303	1618 aa		43.88	■■■■■ 4.61
NPLOC4-215	ENST00000574095	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		43.87	■■■■■ 4.61
NPLOC4-215	ENST00000574095	UACA	Q9BZF9	1416 aa		43.8	■■■■■ 4.6
NPLOC4-215	ENST00000574095	ABCC2	Q92887	1545 aa		43.79	■■■■■ 4.6
NPLOC4-215	ENST00000574095	DIP2B	Q9P265	1576 aa		43.79	■■■■■ 4.6
NPLOC4-215	ENST00000574095	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		43.76	■■■■■ 4.6
NPLOC4-215	ENST00000574095	EEA1	Q15075	1411 aa		43.71	■■■■■ 4.59
NPLOC4-215	ENST00000574095	GOLGA3	Q08378	1498 aa		43.7	■■■■■ 4.59
NPLOC4-215	ENST00000574095	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	43.69	■■■■■ 4.58
NPLOC4-215	ENST00000574095	ASXL2	Q76L83	1435 aa		43.61	■■■■■ 4.57
NPLOC4-215	ENST00000574095	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		43.59	■■■■■ 4.57
NPLOC4-215	ENST00000574095	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		43.58	■■■■■ 4.57
NPLOC4-215	ENST00000574095	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		43.56	■■■■■ 4.56
NPLOC4-215	ENST00000574095	TSPOAP1	O95153	1857 aa		43.54	■■■■■ 4.56
NPLOC4-215	ENST00000574095	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	43.52	■■■■■ 4.56
NPLOC4-215	ENST00000574095	P3H3	Q8IVL6	736 aa		43.5	■■■■■ 4.55
NPLOC4-215	ENST00000574095	ABCA8	O94911	1581 aa		43.44	■■■■■ 4.54
NPLOC4-215	ENST00000574095	GLI2	P10070	1586 aa		43.4	■■■■■ 4.54
NPLOC4-215	ENST00000574095	SAMD9	Q5K651	1589 aa		43.36	■■■■■ 4.53
NPLOC4-215	ENST00000574095	KIF21B	O75037	1637 aa		43.35	■■■■■ 4.53
NPLOC4-215	ENST00000574095	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	43.35	■■■■■ 4.53
NPLOC4-215	ENST00000574095	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	43.34	■■■■■ 4.53
NPLOC4-215	ENST00000574095	KDM6B	O15054	1643 aa		43.27	■■■■■ 4.52
NPLOC4-215	ENST00000574095	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		43.25	■■■■■ 4.51
NPLOC4-215	ENST00000574095	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	43.25	■■■■■ 4.51
NPLOC4-215	ENST00000574095	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		43.23	■■■■■ 4.51
NPLOC4-215	ENST00000574095	ARID3C	A6NKF2	412 aa		43.2	■■■■■ 4.51
NPLOC4-215	ENST00000574095	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		43.19	■■■■■ 4.51
NPLOC4-215	ENST00000574095	KCNH8	Q96L42	1107 aa		43.15	■■■■■ 4.5
NPLOC4-215	ENST00000574095	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		43.13	■■■■■ 4.49
NPLOC4-215	ENST00000574095	ATP10B	O94823	1461 aa		43.11	■■■■■ 4.49
NPLOC4-215	ENST00000574095	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	43.1	■■■■■ 4.49
NPLOC4-215	ENST00000574095	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		43.1	■■■■■ 4.49
NPLOC4-215	ENST00000574095	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	43.07	■■■■■ 4.49
NPLOC4-215	ENST00000574095	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		43.01	■■■■■ 4.48
NPLOC4-215	ENST00000574095	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		43.01	■■■■■ 4.48
NPLOC4-215	ENST00000574095	CD109	Q6YHK3	1445 aa		42.97	■■■■■ 4.47
NPLOC4-215	ENST00000574095	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		42.96	■■■■■ 4.47
NPLOC4-215	ENST00000574095	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	42.95	■■■■■ 4.47
NPLOC4-215	ENST00000574095	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	42.95	■■■■■ 4.47
NPLOC4-215	ENST00000574095	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	42.94	■■■■■ 4.46
NPLOC4-215	ENST00000574095	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.94	■■■■■ 4.46
NPLOC4-215	ENST00000574095	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42.87	■■■■■ 4.45
NPLOC4-215	ENST00000574095	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		42.76	■■■■■ 4.44
NPLOC4-215	ENST00000574095	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		42.74	■■■■■ 4.43
NPLOC4-215	ENST00000574095	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		42.69	■■■■■ 4.42
NPLOC4-215	ENST00000574095	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.64	■■■■■ 4.42
NPLOC4-215	ENST00000574095	FMN1	Q68DA7	1419 aa		42.63	■■■■■ 4.42
NPLOC4-215	ENST00000574095	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	42.63	■■■■■ 4.41
NPLOC4-215	ENST00000574095	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	42.6	■■■■■ 4.41
NPLOC4-215	ENST00000574095	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		42.52	■■■■■ 4.4
NPLOC4-215	ENST00000574095	HECW1	Q76N89	1606 aa		42.52	■■■■■ 4.4
NPLOC4-215	ENST00000574095	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		42.47	■■■■■ 4.39
NPLOC4-215	ENST00000574095	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	42.45	■■■■■ 4.39	5e-8	■■■■■ 28.6
NPLOC4-215	ENST00000574095	NEO1	Q92859	1461 aa		42.44	■■■■■ 4.38
NPLOC4-215	ENST00000574095	ADGRL1	O94910	1474 aa		42.4	■■■■■ 4.38
NPLOC4-215	ENST00000574095	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		42.39	■■■■■ 4.38
NPLOC4-215	ENST00000574095	RAPGEF3	O95398	923 aa		42.37	■■■■■ 4.37
NPLOC4-215	ENST00000574095	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		42.34	■■■■■ 4.37
NPLOC4-215	ENST00000574095	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	42.33	■■■■■ 4.37
NPLOC4-215	ENST00000574095	FANCA	O15360	1455 aa		42.28	■■■■■ 4.36
NPLOC4-215	ENST00000574095	CLIP1	P30622	1438 aa		42.28	■■■■■ 4.36
NPLOC4-215	ENST00000574095	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
NPLOC4-215	ENST00000574095	AKNA	Q7Z591	1439 aa		42.26	■■■■■ 4.36
NPLOC4-215	ENST00000574095	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		42.25	■■■■■ 4.35
NPLOC4-215	ENST00000574095	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		42.22	■■■■■ 4.35
NPLOC4-215	ENST00000574095	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		42.22	■■■■■ 4.35
NPLOC4-215	ENST00000574095	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	42.2	■■■■■ 4.35
NPLOC4-215	ENST00000574095	KIF14	Q15058	1648 aa		42.19	■■■■■ 4.34
NPLOC4-215	ENST00000574095	PLCH2	O75038	1416 aa		42.19	■■■■■ 4.34
NPLOC4-215	ENST00000574095	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	42.17	■■■■■ 4.34
NPLOC4-215	ENST00000574095	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		42.13	■■■■■ 4.34
NPLOC4-215	ENST00000574095	RICTOR	Q6R327	1708 aa		42.12	■■■■■ 4.33
NPLOC4-215	ENST00000574095	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		42.12	■■■■■ 4.33
NPLOC4-215	ENST00000574095	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		42.09	■■■■■ 4.33
NPLOC4-215	ENST00000574095	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		42.05	■■■■■ 4.32
NPLOC4-215	ENST00000574095	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		42.02	■■■■■ 4.32
NPLOC4-215	ENST00000574095	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		41.95	■■■■■ 4.31
NPLOC4-215	ENST00000574095	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		41.94	■■■■■ 4.3
NPLOC4-215	ENST00000574095	CEP162	Q5TB80	1403 aa		41.94	■■■■■ 4.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms