RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574095.1

NPLOC4-215, Transcript of NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor, humanhuman

TSL 3

Gene NPLOC4, Length 277 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPLOC4-215ENST00000574095 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.29■■■■■ 7.88
NPLOC4-215ENST00000574095 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.39■■■■■ 6.78
NPLOC4-215ENST00000574095 ABCC9O60706 1549 aa56.88■■■■■ 6.7
NPLOC4-215ENST00000574095 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.35■■■■■ 6.29
NPLOC4-215ENST00000574095 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.14■■■■■ 6.26
NPLOC4-215ENST00000574095 NACADO15069 1562 aa54.12■■■■■ 6.25
NPLOC4-215ENST00000574095 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.52■■■■■ 6.16
NPLOC4-215ENST00000574095 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.39■■■■■ 6.14
NPLOC4-215ENST00000574095 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.19■■■■■ 6.11
NPLOC4-215ENST00000574095 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.1■■■■■ 6.09
NPLOC4-215ENST00000574095 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.08■■■■■ 6.09
NPLOC4-215ENST00000574095 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.85■■■■■ 6.05
NPLOC4-215ENST00000574095 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.77■■■■■ 6.04
NPLOC4-215ENST00000574095 SCRIBQ14160 1630 aa52.4■■■■■ 5.98
NPLOC4-215ENST00000574095 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52■■■■■ 5.92
NPLOC4-215ENST00000574095 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.42■■■■■ 5.82
NPLOC4-215ENST00000574095 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.39■■■■■ 5.82
NPLOC4-215ENST00000574095 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.14■■■■■ 5.78
NPLOC4-215ENST00000574095 SMARCA4P51532 1647 aa50.03■■■■■ 5.6
NPLOC4-215ENST00000574095 NCAPD3P42695 1498 aa49.96■■■■■ 5.59
NPLOC4-215ENST00000574095 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.92■■■■■ 5.58
NPLOC4-215ENST00000574095 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.84■■■■■ 5.57
NPLOC4-215ENST00000574095 SMARCA2P51531 1590 aa49.79■■■■■ 5.56
NPLOC4-215ENST00000574095 HMGXB3Q12766 1538 aa49.62■■■■■ 5.53
NPLOC4-215ENST00000574095 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.58■■■■■ 5.53
NPLOC4-215ENST00000574095 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.49■■■■■ 5.51
NPLOC4-215ENST00000574095 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.47■■■■■ 5.51
NPLOC4-215ENST00000574095 NESP48681 1621 aa49.05■■■■■ 5.44
NPLOC4-215ENST00000574095 ERCC6Q03468 1493 aa49.04■■■■■ 5.44
NPLOC4-215ENST00000574095 WIZO95785 1651 aa49.04■■■■■ 5.44
NPLOC4-215ENST00000574095 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.76■■■■■ 5.4
NPLOC4-215ENST00000574095 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.73■■■■■ 5.39
NPLOC4-215ENST00000574095 CUX2O14529 1486 aa48.69■■■■■ 5.39
NPLOC4-215ENST00000574095 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.5■■■■■ 5.35
NPLOC4-215ENST00000574095 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.44■■■■■ 5.35
NPLOC4-215ENST00000574095 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.43■■■■■ 5.34
NPLOC4-215ENST00000574095 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.39■■■■■ 5.34
NPLOC4-215ENST00000574095 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.37■■■■■ 5.33
NPLOC4-215ENST00000574095 CFTRP13569 1480 aa48.05■■■■■ 5.28
NPLOC4-215ENST00000574095 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.03■■■■■ 5.28
NPLOC4-215ENST00000574095 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.99■■■■■ 5.27
NPLOC4-215ENST00000574095 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.94■■■■■ 5.26
NPLOC4-215ENST00000574095 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.93■■■■■ 5.26
NPLOC4-215ENST00000574095 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.89■■■■■ 5.26
NPLOC4-215ENST00000574095 WDR62O43379 1518 aa47.84■■■■■ 5.25
NPLOC4-215ENST00000574095 PRDM2Q13029 1718 aa47.64■■■■■ 5.22
NPLOC4-215ENST00000574095 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.52■■■■■ 5.2
NPLOC4-215ENST00000574095 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.16■■■■■ 5.14
NPLOC4-215ENST00000574095 TOPBP1Q92547 1522 aa47.1■■■■■ 5.13
NPLOC4-215ENST00000574095 ABCC8Q09428 1581 aa47.02■■■■■ 5.12
NPLOC4-215ENST00000574095 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.98■■■■■ 5.11
NPLOC4-215ENST00000574095 IFT140Q96RY7 1462 aa46.94■■■■■ 5.1
NPLOC4-215ENST00000574095 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.84■■■■■ 5.09
NPLOC4-215ENST00000574095 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.66■■■■■ 5.06
NPLOC4-215ENST00000574095 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.65■■■■■ 5.06
NPLOC4-215ENST00000574095 OSCARQ8IYS5 282 aa46.64■■■■■ 5.06
NPLOC4-215ENST00000574095 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.6■■■■■ 5.05
NPLOC4-215ENST00000574095 CUX1P39880 1505 aa46.54■■■■■ 5.04
NPLOC4-215ENST00000574095 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.52■■■■■ 5.04
NPLOC4-215ENST00000574095 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.52■■■■■ 5.04
NPLOC4-215ENST00000574095 SOGA1O94964 1423 aa46.49■■■■■ 5.03
NPLOC4-215ENST00000574095 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.47■■■■■ 5.03
NPLOC4-215ENST00000574095 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.34■■■■■ 5.01
NPLOC4-215ENST00000574095 TRIM41Q8WV44 630 aa46.25■■■■■ 4.99
NPLOC4-215ENST00000574095 CHD1O14646 1710 aa46.17■■■■■ 4.98
NPLOC4-215ENST00000574095 WDR97A6NE52 1622 aa46.14■■■■■ 4.98
NPLOC4-215ENST00000574095 FBLN2P98095 1184 aa46.13■■■■■ 4.98
NPLOC4-215ENST00000574095 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.03■■■■■ 4.96
NPLOC4-215ENST00000574095 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.98■■■■■ 4.95
NPLOC4-215ENST00000574095 GRIN2BQ13224 1484 aa45.98■■■■■ 4.95
NPLOC4-215ENST00000574095 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.95■■■■■ 4.95
NPLOC4-215ENST00000574095 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.95■■■■■ 4.95
NPLOC4-215ENST00000574095 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.95■■■■■ 4.95
NPLOC4-215ENST00000574095 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.95■■■■■ 4.95
NPLOC4-215ENST00000574095 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.94■■■■■ 4.94
NPLOC4-215ENST00000574095 TOP2BQ02880 1626 aa45.93■■■■■ 4.94
NPLOC4-215ENST00000574095 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.93■■■■■ 4.94
NPLOC4-215ENST00000574095 SYNJ1O43426 1573 aa45.92■■■■■ 4.94
NPLOC4-215ENST00000574095 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.89■■■■■ 4.94
NPLOC4-215ENST00000574095 PBRM1Q86U86 1689 aa45.88■■■■■ 4.93
NPLOC4-215ENST00000574095 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.86■■■■■ 4.93
NPLOC4-215ENST00000574095 ARHGEF11O15085 1522 aa45.86■■■■■ 4.93
NPLOC4-215ENST00000574095 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.83■■■■■ 4.93
NPLOC4-215ENST00000574095 SYNJ2O15056 1496 aa45.75■■■■■ 4.91
NPLOC4-215ENST00000574095 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.6■■■■■ 4.89
NPLOC4-215ENST00000574095 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.55■■■■■ 4.88
NPLOC4-215ENST00000574095 ARAP1Q96P48 1450 aa45.45■■■■■ 4.87
NPLOC4-215ENST00000574095 ADAMTS12P58397 1594 aa45.44■■■■■ 4.86
NPLOC4-215ENST00000574095 GRIN2AQ12879 1464 aa45.4■■■■■ 4.86
NPLOC4-215ENST00000574095 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.38■■■■■ 4.86
NPLOC4-215ENST00000574095 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.35■■■■■ 4.85
NPLOC4-215ENST00000574095 CEP170Q5SW79 1584 aa45.22■■■■■ 4.83
NPLOC4-215ENST00000574095 NUP160Q12769 1436 aa45.2■■■■■ 4.83
NPLOC4-215ENST00000574095 KIF27Q86VH2 1401 aa45.06■■■■■ 4.8
NPLOC4-215ENST00000574095 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45■■■■■ 4.79
NPLOC4-215ENST00000574095 IGF1RP08069 1367 aa44.99■■■■■ 4.79
NPLOC4-215ENST00000574095 SHROOM2Q13796 1616 aa44.93■■■■■ 4.78
NPLOC4-215ENST00000574095 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
NPLOC4-215ENST00000574095 CUL7Q14999 1698 aa44.85■■■■■ 4.77
NPLOC4-215ENST00000574095 JPH4Q96JJ6 628 aa44.81■■■■■ 4.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1464.4 ms