RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 JPH4Q96JJ6 628 aa24.79■■□□□ 1.56
CMTM3-215ENST00000568477 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CMTM3-215ENST00000568477 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.76■■□□□ 1.55
CMTM3-215ENST00000568477 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.73■■□□□ 1.55
CMTM3-215ENST00000568477 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.58■■□□□ 1.52
CMTM3-215ENST00000568477 IQGAP2Q13576 1575 aa24.54■■□□□ 1.52
CMTM3-215ENST00000568477 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.5■■□□□ 1.51
CMTM3-215ENST00000568477 PTPRGP23470 1445 aa24.45■■□□□ 1.51
CMTM3-215ENST00000568477 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.45■■□□□ 1.5
CMTM3-215ENST00000568477 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.44■■□□□ 1.5
CMTM3-215ENST00000568477 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.44■■□□□ 1.5
CMTM3-215ENST00000568477 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.4■■□□□ 1.5
CMTM3-215ENST00000568477 PRXQ9BXM0 1461 aa24.39■■□□□ 1.5
CMTM3-215ENST00000568477 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
CMTM3-215ENST00000568477 DISP1Q96F81 1524 aa24.39■■□□□ 1.49
CMTM3-215ENST00000568477 MAPKBP1O60336 1514 aa24.37■■□□□ 1.49
CMTM3-215ENST00000568477 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.34■■□□□ 1.49
CMTM3-215ENST00000568477 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.32■■□□□ 1.48
CMTM3-215ENST00000568477 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.32■■□□□ 1.48
CMTM3-215ENST00000568477 KIAA0556O60303 1618 aa24.31■■□□□ 1.48
CMTM3-215ENST00000568477 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.29■■□□□ 1.48
CMTM3-215ENST00000568477 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.28■■□□□ 1.48
CMTM3-215ENST00000568477 ABCC2Q92887 1545 aa24.28■■□□□ 1.48
CMTM3-215ENST00000568477 EEA1Q15075 1411 aa24.27■■□□□ 1.48
CMTM3-215ENST00000568477 UACAQ9BZF9 1416 aa24.27■■□□□ 1.48
CMTM3-215ENST00000568477 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.26■■□□□ 1.47
CMTM3-215ENST00000568477 DIP2BQ9P265 1576 aa24.25■■□□□ 1.47
CMTM3-215ENST00000568477 GOLGA3Q08378 1498 aa24.25■■□□□ 1.47
CMTM3-215ENST00000568477 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.16■■□□□ 1.46
CMTM3-215ENST00000568477 ASXL2Q76L83 1435 aa24.16■■□□□ 1.46
CMTM3-215ENST00000568477 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.15■■□□□ 1.46
CMTM3-215ENST00000568477 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CMTM3-215ENST00000568477 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.1■■□□□ 1.45
CMTM3-215ENST00000568477 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CMTM3-215ENST00000568477 ABCA8O94911 1581 aa24.07■■□□□ 1.44
CMTM3-215ENST00000568477 GLI2P10070 1586 aa24.05■■□□□ 1.44
CMTM3-215ENST00000568477 TSPOAP1O95153 1857 aa24.04■■□□□ 1.44
CMTM3-215ENST00000568477 P3H3Q8IVL6 736 aa24.03■■□□□ 1.44
CMTM3-215ENST00000568477 KIF21BO75037 1637 aa24.02■■□□□ 1.44
CMTM3-215ENST00000568477 SAMD9Q5K651 1589 aa24.02■■□□□ 1.44
CMTM3-215ENST00000568477 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CMTM3-215ENST00000568477 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.99■■□□□ 1.43
CMTM3-215ENST00000568477 KDM6BO15054 1643 aa23.97■■□□□ 1.43
CMTM3-215ENST00000568477 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CMTM3-215ENST00000568477 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CMTM3-215ENST00000568477 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.92■■□□□ 1.42
CMTM3-215ENST00000568477 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.88■■□□□ 1.41
CMTM3-215ENST00000568477 ARID3CA6NKF2 412 aa23.87■■□□□ 1.41
CMTM3-215ENST00000568477 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.87■■□□□ 1.41
CMTM3-215ENST00000568477 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.87■■□□□ 1.41
CMTM3-215ENST00000568477 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.87■■□□□ 1.41
CMTM3-215ENST00000568477 ATP10BO94823 1461 aa23.86■■□□□ 1.41
CMTM3-215ENST00000568477 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CMTM3-215ENST00000568477 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.85■■□□□ 1.41
CMTM3-215ENST00000568477 KCNH8Q96L42 1107 aa23.85■■□□□ 1.41
CMTM3-215ENST00000568477 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CMTM3-215ENST00000568477 CD109Q6YHK3 1445 aa23.8■■□□□ 1.4
CMTM3-215ENST00000568477 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.79■■□□□ 1.4
CMTM3-215ENST00000568477 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CMTM3-215ENST00000568477 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.77■■□□□ 1.4
CMTM3-215ENST00000568477 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
CMTM3-215ENST00000568477 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CMTM3-215ENST00000568477 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CMTM3-215ENST00000568477 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.68■■□□□ 1.38
CMTM3-215ENST00000568477 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.67■■□□□ 1.38
CMTM3-215ENST00000568477 FMN1Q68DA7 1419 aa23.66■■□□□ 1.38
CMTM3-215ENST00000568477 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.64■■□□□ 1.37
CMTM3-215ENST00000568477 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CMTM3-215ENST00000568477 HECW1Q76N89 1606 aa23.58■■□□□ 1.36
CMTM3-215ENST00000568477 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.57■■□□□ 1.36
CMTM3-215ENST00000568477 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CMTM3-215ENST00000568477 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.57■■□□□ 1.36
CMTM3-215ENST00000568477 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.56■■□□□ 1.36
CMTM3-215ENST00000568477 NEO1Q92859 1461 aa23.54■■□□□ 1.36
CMTM3-215ENST00000568477 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
CMTM3-215ENST00000568477 ADGRL1O94910 1474 aa23.49■■□□□ 1.35
CMTM3-215ENST00000568477 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CMTM3-215ENST00000568477 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.47■■□□□ 1.35
CMTM3-215ENST00000568477 FANCAO15360 1455 aa23.43■■□□□ 1.34
CMTM3-215ENST00000568477 CLIP1P30622 1438 aa23.43■■□□□ 1.34
CMTM3-215ENST00000568477 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.43■■□□□ 1.34
CMTM3-215ENST00000568477 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.42■■□□□ 1.34
CMTM3-215ENST00000568477 RAPGEF3O95398 923 aa23.42■■□□□ 1.34
CMTM3-215ENST00000568477 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CMTM3-215ENST00000568477 AKNAQ7Z591 1439 aa23.41■■□□□ 1.34
CMTM3-215ENST00000568477 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CMTM3-215ENST00000568477 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CMTM3-215ENST00000568477 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.38■■□□□ 1.33
CMTM3-215ENST00000568477 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.38■■□□□ 1.33
CMTM3-215ENST00000568477 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.37■■□□□ 1.33
CMTM3-215ENST00000568477 PLCH2O75038 1416 aa23.37■■□□□ 1.33
CMTM3-215ENST00000568477 KIF14Q15058 1648 aa23.37■■□□□ 1.33
CMTM3-215ENST00000568477 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.36■■□□□ 1.33
CMTM3-215ENST00000568477 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.32■■□□□ 1.32
CMTM3-215ENST00000568477 RICTORQ6R327 1708 aa23.31■■□□□ 1.32
CMTM3-215ENST00000568477 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.3■■□□□ 1.32
CMTM3-215ENST00000568477 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.27■■□□□ 1.32
CMTM3-215ENST00000568477 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.27■■□□□ 1.32
CMTM3-215ENST00000568477 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.26■■□□□ 1.31
CMTM3-215ENST00000568477 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.25■■□□□ 1.31
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