RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567943.1

FANCA-228, Transcript of FA complementation group A, humanhuman

TSL 3

Gene FANCA, Length 860 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCA-228ENST00000567943 JPH4Q96JJ6 628 aa43.15■■■■■ 4.5
FANCA-228ENST00000567943 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.11■■■■■ 4.49
FANCA-228ENST00000567943 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.06■■■■■ 4.48
FANCA-228ENST00000567943 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.9■■■■■ 4.46
FANCA-228ENST00000567943 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.83■■■■■ 4.45
FANCA-228ENST00000567943 IQGAP2Q13576 1575 aa42.75■■■■■ 4.43
FANCA-228ENST00000567943 PRXQ9BXM0 1461 aa42.62■■■■■ 4.41
FANCA-228ENST00000567943 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.6■■■■■ 4.41
FANCA-228ENST00000567943 DISP1Q96F81 1524 aa42.55■■■■■ 4.4
FANCA-228ENST00000567943 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.54■■■■■ 4.4
FANCA-228ENST00000567943 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.53■■■■■ 4.4
FANCA-228ENST00000567943 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.51■■■■■ 4.39
FANCA-228ENST00000567943 PTPRGP23470 1445 aa42.5■■■■■ 4.39
FANCA-228ENST00000567943 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.49■■■■■ 4.39
FANCA-228ENST00000567943 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.4■■■■■ 4.38
FANCA-228ENST00000567943 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.4■■■■■ 4.38
FANCA-228ENST00000567943 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
FANCA-228ENST00000567943 KIAA0556O60303 1618 aa42.38■■■■■ 4.37
FANCA-228ENST00000567943 MAPKBP1O60336 1514 aa42.36■■■■■ 4.37
FANCA-228ENST00000567943 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.34■■■■■ 4.37
FANCA-228ENST00000567943 EEA1Q15075 1411 aa42.3■■■■■ 4.36
FANCA-228ENST00000567943 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.27■■■■■ 4.36
FANCA-228ENST00000567943 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.23■■■■■ 4.35
FANCA-228ENST00000567943 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.23■■■■■ 4.35
FANCA-228ENST00000567943 ABCC2Q92887 1545 aa42.22■■■■■ 4.35
FANCA-228ENST00000567943 UACAQ9BZF9 1416 aa42.21■■■■■ 4.35
FANCA-228ENST00000567943 DIP2BQ9P265 1576 aa42.18■■■■■ 4.34
FANCA-228ENST00000567943 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.16■■■■■ 4.34
FANCA-228ENST00000567943 GOLGA3Q08378 1498 aa42.15■■■■■ 4.34
FANCA-228ENST00000567943 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.12■■■■■ 4.33
FANCA-228ENST00000567943 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.05■■■■■ 4.32
FANCA-228ENST00000567943 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.03■■■■■ 4.32
FANCA-228ENST00000567943 ASXL2Q76L83 1435 aa42.01■■■■■ 4.32
FANCA-228ENST00000567943 KIF21BO75037 1637 aa42■■■■■ 4.31
FANCA-228ENST00000567943 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
FANCA-228ENST00000567943 ABCA8O94911 1581 aa41.97■■■■■ 4.31
FANCA-228ENST00000567943 SAMD9Q5K651 1589 aa41.95■■■■■ 4.31
FANCA-228ENST00000567943 P3H3Q8IVL6 736 aa41.9■■■■■ 4.3
FANCA-228ENST00000567943 TSPOAP1O95153 1857 aa41.87■■■■■ 4.29
FANCA-228ENST00000567943 GLI2P10070 1586 aa41.83■■■■■ 4.29
FANCA-228ENST00000567943 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
FANCA-228ENST00000567943 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
FANCA-228ENST00000567943 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
FANCA-228ENST00000567943 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.7■■■■■ 4.27
FANCA-228ENST00000567943 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.67■■■■■ 4.26
FANCA-228ENST00000567943 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.66■■■■■ 4.26
FANCA-228ENST00000567943 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.65■■■■■ 4.26
FANCA-228ENST00000567943 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.62■■■■■ 4.25
FANCA-228ENST00000567943 ATP10BO94823 1461 aa41.61■■■■■ 4.25
FANCA-228ENST00000567943 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.59■■■■■ 4.25
FANCA-228ENST00000567943 KDM6BO15054 1643 aa41.59■■■■■ 4.25
FANCA-228ENST00000567943 ARID3CA6NKF2 412 aa41.58■■■■■ 4.25
FANCA-228ENST00000567943 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
FANCA-228ENST00000567943 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
FANCA-228ENST00000567943 KCNH8Q96L42 1107 aa41.47■■■■■ 4.23
FANCA-228ENST00000567943 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.42■■■■■ 4.22
FANCA-228ENST00000567943 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.39■■■■■ 4.22
FANCA-228ENST00000567943 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
FANCA-228ENST00000567943 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.37■■■■■ 4.21
FANCA-228ENST00000567943 CD109Q6YHK3 1445 aa41.35■■■■■ 4.21
FANCA-228ENST00000567943 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.33■■■■■ 4.21
FANCA-228ENST00000567943 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
FANCA-228ENST00000567943 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
FANCA-228ENST00000567943 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.26■■■■■ 4.19
FANCA-228ENST00000567943 FMN1Q68DA7 1419 aa41.18■■■■■ 4.18
FANCA-228ENST00000567943 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
FANCA-228ENST00000567943 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.09■■■■■ 4.17
FANCA-228ENST00000567943 HECW1Q76N89 1606 aa41.08■■■■■ 4.17
FANCA-228ENST00000567943 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
FANCA-228ENST00000567943 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.02■■■■■ 4.16
FANCA-228ENST00000567943 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.99■■■■■ 4.15
FANCA-228ENST00000567943 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
FANCA-228ENST00000567943 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.98■■■■■ 4.155e-7■■■□□ 18.8
FANCA-228ENST00000567943 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.95■■■■■ 4.15
FANCA-228ENST00000567943 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.94■■■■■ 4.14
FANCA-228ENST00000567943 NEO1Q92859 1461 aa40.91■■■■■ 4.14
FANCA-228ENST00000567943 CLIP1P30622 1438 aa40.91■■■■■ 4.14
FANCA-228ENST00000567943 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
FANCA-228ENST00000567943 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.89■■■■■ 4.14
FANCA-228ENST00000567943 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.87■■■■■ 4.13
FANCA-228ENST00000567943 KIF14Q15058 1648 aa40.78■■■■■ 4.12
FANCA-228ENST00000567943 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.77■■■■■ 4.12
FANCA-228ENST00000567943 RAPGEF3O95398 923 aa40.76■■■■■ 4.12
FANCA-228ENST00000567943 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
FANCA-228ENST00000567943 FANCAO15360 1455 aa40.76■■■■■ 4.12
FANCA-228ENST00000567943 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.11
FANCA-228ENST00000567943 ADGRL1O94910 1474 aa40.73■■■■■ 4.11
FANCA-228ENST00000567943 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.72■■■■■ 4.11
FANCA-228ENST00000567943 AKNAQ7Z591 1439 aa40.72■■■■■ 4.11
FANCA-228ENST00000567943 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.71■■■■■ 4.11
FANCA-228ENST00000567943 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.7■■■■■ 4.11
FANCA-228ENST00000567943 PLCH2O75038 1416 aa40.7■■■■■ 4.11
FANCA-228ENST00000567943 RICTORQ6R327 1708 aa40.67■■■■■ 4.1
FANCA-228ENST00000567943 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.67■■■■■ 4.1
FANCA-228ENST00000567943 CEP162Q5TB80 1403 aa40.63■■■■■ 4.09
FANCA-228ENST00000567943 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
FANCA-228ENST00000567943 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.58■■■■■ 4.09
FANCA-228ENST00000567943 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.5■■■■■ 4.07
FANCA-228ENST00000567943 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.48■■■■■ 4.07
FANCA-228ENST00000567943 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.48■■■■■ 4.07
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