RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567943.1

FANCA-228, Transcript of FA complementation group A, humanhuman

TSL 3

Gene FANCA, Length 860 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCA-228ENST00000567943 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.14■■■■■ 7.54
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FANCA-228ENST00000567943 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.36■■■■■ 5.97
FANCA-228ENST00000567943 NACADO15069 1562 aa52.2■■■■■ 5.95
FANCA-228ENST00000567943 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.02■■■■■ 5.92
FANCA-228ENST00000567943 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.74■■■■■ 5.87
FANCA-228ENST00000567943 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.66■■■■■ 5.86
FANCA-228ENST00000567943 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.36■■■■■ 5.81
FANCA-228ENST00000567943 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.35■■■■■ 5.81
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FANCA-228ENST00000567943 SCRIBQ14160 1630 aa50.56■■■■■ 5.68
FANCA-228ENST00000567943 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.18■■■■■ 5.62
FANCA-228ENST00000567943 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.56■■■■■ 5.52
FANCA-228ENST00000567943 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.49■■■■■ 5.51
FANCA-228ENST00000567943 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.18■■■■■ 5.46
FANCA-228ENST00000567943 SMARCA4P51532 1647 aa48.32■■■■■ 5.33
FANCA-228ENST00000567943 NCAPD3P42695 1498 aa48.21■■■■■ 5.31
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FANCA-228ENST00000567943 SMARCA2P51531 1590 aa48.03■■■■■ 5.28
FANCA-228ENST00000567943 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.92■■■■■ 5.26
FANCA-228ENST00000567943 HMGXB3Q12766 1538 aa47.91■■■■■ 5.26
FANCA-228ENST00000567943 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.86■■■■■ 5.25
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FANCA-228ENST00000567943 NESP48681 1621 aa47.26■■■■■ 5.16
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FANCA-228ENST00000567943 ERCC6Q03468 1493 aa47.1■■■■■ 5.13
FANCA-228ENST00000567943 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.98■■■■■ 5.11
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FANCA-228ENST00000567943 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.68■■■■■ 5.06
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FANCA-228ENST00000567943 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.63■■■■■ 5.06
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FANCA-228ENST00000567943 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.18■■■■■ 4.98
FANCA-228ENST00000567943 WDR62O43379 1518 aa46.13■■■■■ 4.98
FANCA-228ENST00000567943 PRDM2Q13029 1718 aa46.04■■■■■ 4.96
FANCA-228ENST00000567943 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.98■■■■■ 4.95
FANCA-228ENST00000567943 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.85■■■■■ 4.93
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FANCA-228ENST00000567943 TOPBP1Q92547 1522 aa45.45■■■■■ 4.87
FANCA-228ENST00000567943 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.34■■■■■ 4.85
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FANCA-228ENST00000567943 IFT140Q96RY7 1462 aa45.23■■■■■ 4.83
FANCA-228ENST00000567943 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.16■■■■■ 4.82
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FANCA-228ENST00000567943 WDR97A6NE52 1622 aa44.57■■■■■ 4.72
FANCA-228ENST00000567943 CHD1O14646 1710 aa44.49■■■■■ 4.71
FANCA-228ENST00000567943 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.44■■■■■ 4.7
FANCA-228ENST00000567943 SYNJ1O43426 1573 aa44.43■■■■■ 4.7
FANCA-228ENST00000567943 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.43■■■■■ 4.7
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FANCA-228ENST00000567943 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.39■■■■■ 4.7
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FANCA-228ENST00000567943 GRIN2BQ13224 1484 aa44.33■■■■■ 4.69
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FANCA-228ENST00000567943 FBLN2P98095 1184 aa44.28■■■■■ 4.68
FANCA-228ENST00000567943 PBRM1Q86U86 1689 aa44.27■■■■■ 4.68
FANCA-228ENST00000567943 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.26■■■■■ 4.68
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FANCA-228ENST00000567943 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.2■■■■■ 4.67
FANCA-228ENST00000567943 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.2■■■■■ 4.67
FANCA-228ENST00000567943 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.2■■■■■ 4.67
FANCA-228ENST00000567943 ARHGEF11O15085 1522 aa44.11■■■■■ 4.65
FANCA-228ENST00000567943 SYNJ2O15056 1496 aa44.11■■■■■ 4.65
FANCA-228ENST00000567943 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.08■■■■■ 4.65
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FANCA-228ENST00000567943 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.83■■■■■ 4.61
FANCA-228ENST00000567943 GRIN2AQ12879 1464 aa43.79■■■■■ 4.6
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FANCA-228ENST00000567943 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.73■■■■■ 4.59
FANCA-228ENST00000567943 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.7■■■■■ 4.59
FANCA-228ENST00000567943 CEP170Q5SW79 1584 aa43.65■■■■■ 4.58
FANCA-228ENST00000567943 NUP160Q12769 1436 aa43.63■■■■■ 4.57
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FANCA-228ENST00000567943 CUL7Q14999 1698 aa43.33■■■■■ 4.53
FANCA-228ENST00000567943 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.25■■■■■ 4.51
FANCA-228ENST00000567943 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.16■■■■■ 4.5
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