RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567595.1

LMF1-210, Transcript of lipase maturation factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene LMF1, Length 663 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1-210ENST00000567595 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.71■■■□□ 2.51
LMF1-210ENST00000567595 JPH4Q96JJ6 628 aa30.7■■■□□ 2.51
LMF1-210ENST00000567595 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
LMF1-210ENST00000567595 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.59■■■□□ 2.49
LMF1-210ENST00000567595 IQGAP2Q13576 1575 aa30.47■■■□□ 2.47
LMF1-210ENST00000567595 PRXQ9BXM0 1461 aa30.45■■■□□ 2.47
LMF1-210ENST00000567595 EEA1Q15075 1411 aa30.37■■■□□ 2.45
LMF1-210ENST00000567595 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.35■■■□□ 2.45
LMF1-210ENST00000567595 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.34■■■□□ 2.45
LMF1-210ENST00000567595 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
LMF1-210ENST00000567595 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.31■■■□□ 2.44
LMF1-210ENST00000567595 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.3■■■□□ 2.44
LMF1-210ENST00000567595 DISP1Q96F81 1524 aa30.29■■■□□ 2.44
LMF1-210ENST00000567595 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.28■■■□□ 2.44
LMF1-210ENST00000567595 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.27■■■□□ 2.44
LMF1-210ENST00000567595 PTPRGP23470 1445 aa30.27■■■□□ 2.44
LMF1-210ENST00000567595 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.24■■■□□ 2.43
LMF1-210ENST00000567595 KIAA0556O60303 1618 aa30.18■■■□□ 2.42
LMF1-210ENST00000567595 MAPKBP1O60336 1514 aa30.14■■■□□ 2.42
LMF1-210ENST00000567595 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.13■■■□□ 2.41
LMF1-210ENST00000567595 GOLGA3Q08378 1498 aa30.12■■■□□ 2.41
LMF1-210ENST00000567595 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.11■■■□□ 2.41
LMF1-210ENST00000567595 UACAQ9BZF9 1416 aa30.07■■■□□ 2.4
LMF1-210ENST00000567595 ABCC2Q92887 1545 aa30.06■■■□□ 2.4
LMF1-210ENST00000567595 KIF21BO75037 1637 aa30.05■■■□□ 2.4
LMF1-210ENST00000567595 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
LMF1-210ENST00000567595 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
LMF1-210ENST00000567595 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.03■■■□□ 2.4
LMF1-210ENST00000567595 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.01■■■□□ 2.4
LMF1-210ENST00000567595 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.96■■■□□ 2.39
LMF1-210ENST00000567595 DIP2BQ9P265 1576 aa29.94■■■□□ 2.38
LMF1-210ENST00000567595 SAMD9Q5K651 1589 aa29.94■■■□□ 2.38
LMF1-210ENST00000567595 ABCA8O94911 1581 aa29.9■■■□□ 2.38
LMF1-210ENST00000567595 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.88■■■□□ 2.37
LMF1-210ENST00000567595 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.88■■■□□ 2.37
LMF1-210ENST00000567595 ASXL2Q76L83 1435 aa29.87■■■□□ 2.37
LMF1-210ENST00000567595 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
LMF1-210ENST00000567595 P3H3Q8IVL6 736 aa29.78■■■□□ 2.36
LMF1-210ENST00000567595 GLI2P10070 1586 aa29.77■■■□□ 2.36
LMF1-210ENST00000567595 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.76■■■□□ 2.35
LMF1-210ENST00000567595 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
LMF1-210ENST00000567595 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
LMF1-210ENST00000567595 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.68■■■□□ 2.34
LMF1-210ENST00000567595 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.68■■■□□ 2.34
LMF1-210ENST00000567595 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.66■■■□□ 2.34
LMF1-210ENST00000567595 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
LMF1-210ENST00000567595 ATP10BO94823 1461 aa29.63■■■□□ 2.33
LMF1-210ENST00000567595 TSPOAP1O95153 1857 aa29.61■■■□□ 2.33
LMF1-210ENST00000567595 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.6■■■□□ 2.33
LMF1-210ENST00000567595 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.59■■■□□ 2.33
LMF1-210ENST00000567595 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
LMF1-210ENST00000567595 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
LMF1-210ENST00000567595 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.55■■■□□ 2.32
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LMF1-210ENST00000567595 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.48■■■□□ 2.31
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LMF1-210ENST00000567595 ARID3CA6NKF2 412 aa29.47■■■□□ 2.31
LMF1-210ENST00000567595 FMN1Q68DA7 1419 aa29.46■■■□□ 2.31
LMF1-210ENST00000567595 KCNH8Q96L42 1107 aa29.45■■■□□ 2.31
LMF1-210ENST00000567595 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.44■■■□□ 2.3
LMF1-210ENST00000567595 CD109Q6YHK3 1445 aa29.43■■■□□ 2.3
LMF1-210ENST00000567595 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.38■■■□□ 2.29
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LMF1-210ENST00000567595 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
LMF1-210ENST00000567595 HECW1Q76N89 1606 aa29.34■■■□□ 2.29
LMF1-210ENST00000567595 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
LMF1-210ENST00000567595 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.32■■■□□ 2.28
LMF1-210ENST00000567595 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
LMF1-210ENST00000567595 CLIP1P30622 1438 aa29.26■■■□□ 2.27
LMF1-210ENST00000567595 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.22■■■□□ 2.27
LMF1-210ENST00000567595 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.22■■■□□ 2.27
LMF1-210ENST00000567595 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.19■■■□□ 2.26
LMF1-210ENST00000567595 NEO1Q92859 1461 aa29.17■■■□□ 2.26
LMF1-210ENST00000567595 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.17■■■□□ 2.26
LMF1-210ENST00000567595 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
LMF1-210ENST00000567595 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
LMF1-210ENST00000567595 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.17■■■□□ 2.26
LMF1-210ENST00000567595 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
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LMF1-210ENST00000567595 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.13■■■□□ 2.25
LMF1-210ENST00000567595 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.12■■■□□ 2.25
LMF1-210ENST00000567595 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
LMF1-210ENST00000567595 CEP162Q5TB80 1403 aa29.08■■■□□ 2.25
LMF1-210ENST00000567595 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.05■■■□□ 2.24
LMF1-210ENST00000567595 KIF14Q15058 1648 aa29.03■■■□□ 2.24
LMF1-210ENST00000567595 FANCAO15360 1455 aa29.03■■■□□ 2.24
LMF1-210ENST00000567595 PLCH2O75038 1416 aa29.03■■■□□ 2.24
LMF1-210ENST00000567595 AKNAQ7Z591 1439 aa28.99■■■□□ 2.23
LMF1-210ENST00000567595 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
LMF1-210ENST00000567595 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.97■■■□□ 2.23
LMF1-210ENST00000567595 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.96■■■□□ 2.23
LMF1-210ENST00000567595 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.96■■■□□ 2.23
LMF1-210ENST00000567595 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.93■■■□□ 2.22
LMF1-210ENST00000567595 RAPGEF3O95398 923 aa28.93■■■□□ 2.22
LMF1-210ENST00000567595 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
LMF1-210ENST00000567595 RICTORQ6R327 1708 aa28.9■■■□□ 2.22
LMF1-210ENST00000567595 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.88■■■□□ 2.21
LMF1-210ENST00000567595 ADGRL1O94910 1474 aa28.85■■■□□ 2.21
LMF1-210ENST00000567595 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.84■■■□□ 2.21
LMF1-210ENST00000567595 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.82■■■□□ 2.2
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