RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567595.1

LMF1-210, Transcript of lipase maturation factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene LMF1, Length 663 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1-210ENST00000567595 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.3■■■■■ 4.68
LMF1-210ENST00000567595 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.51■■■■□ 3.92
LMF1-210ENST00000567595 ABCC9O60706 1549 aa38.76■■■■□ 3.8
LMF1-210ENST00000567595 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.26■■■■□ 3.56
LMF1-210ENST00000567595 NACADO15069 1562 aa37.2■■■■□ 3.55
LMF1-210ENST00000567595 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.97■■■■□ 3.51
LMF1-210ENST00000567595 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.92■■■■□ 3.5
LMF1-210ENST00000567595 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
LMF1-210ENST00000567595 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.72■■■■□ 3.47
LMF1-210ENST00000567595 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.39■■■■□ 3.42
LMF1-210ENST00000567595 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.16■■■■□ 3.38
LMF1-210ENST00000567595 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.15■■■■□ 3.38
LMF1-210ENST00000567595 SCRIBQ14160 1630 aa35.93■■■■□ 3.34
LMF1-210ENST00000567595 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.84■■■■□ 3.33
LMF1-210ENST00000567595 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.8■■■■□ 3.32
LMF1-210ENST00000567595 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
LMF1-210ENST00000567595 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.1■■■■□ 3.21
LMF1-210ENST00000567595 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.89■■■■□ 3.18
LMF1-210ENST00000567595 SMARCA4P51532 1647 aa34.41■■■■□ 3.1
LMF1-210ENST00000567595 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
LMF1-210ENST00000567595 NCAPD3P42695 1498 aa34.33■■■■□ 3.09
LMF1-210ENST00000567595 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.29■■■■□ 3.08
LMF1-210ENST00000567595 SMARCA2P51531 1590 aa34.24■■■■□ 3.07
LMF1-210ENST00000567595 HMGXB3Q12766 1538 aa34.14■■■■□ 3.06
LMF1-210ENST00000567595 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.14■■■■□ 3.06
LMF1-210ENST00000567595 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.11■■■■□ 3.05
LMF1-210ENST00000567595 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
LMF1-210ENST00000567595 WIZO95785 1651 aa33.7■■■□□ 2.99
LMF1-210ENST00000567595 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
LMF1-210ENST00000567595 NESP48681 1621 aa33.49■■■□□ 2.95
LMF1-210ENST00000567595 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.45■■■□□ 2.95
LMF1-210ENST00000567595 ERCC6Q03468 1493 aa33.43■■■□□ 2.94
LMF1-210ENST00000567595 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
LMF1-210ENST00000567595 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.29■■■□□ 2.92
LMF1-210ENST00000567595 CUX2O14529 1486 aa33.25■■■□□ 2.91
LMF1-210ENST00000567595 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.21■■■□□ 2.91
LMF1-210ENST00000567595 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.1■■■□□ 2.89
LMF1-210ENST00000567595 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
LMF1-210ENST00000567595 CFTRP13569 1480 aa33.06■■■□□ 2.88
LMF1-210ENST00000567595 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.97■■■□□ 2.87
LMF1-210ENST00000567595 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.88■■■□□ 2.85
LMF1-210ENST00000567595 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.87■■■□□ 2.85
LMF1-210ENST00000567595 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.86■■■□□ 2.85
LMF1-210ENST00000567595 WDR62O43379 1518 aa32.8■■■□□ 2.84
LMF1-210ENST00000567595 PRDM2Q13029 1718 aa32.78■■■□□ 2.84
LMF1-210ENST00000567595 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
LMF1-210ENST00000567595 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
LMF1-210ENST00000567595 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.45■■■□□ 2.79
LMF1-210ENST00000567595 ABCC8Q09428 1581 aa32.37■■■□□ 2.77
LMF1-210ENST00000567595 TOPBP1Q92547 1522 aa32.35■■■□□ 2.77
LMF1-210ENST00000567595 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.3■■■□□ 2.76
LMF1-210ENST00000567595 IFT140Q96RY7 1462 aa32.21■■■□□ 2.75
LMF1-210ENST00000567595 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
LMF1-210ENST00000567595 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
LMF1-210ENST00000567595 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
LMF1-210ENST00000567595 CUX1P39880 1505 aa32.01■■■□□ 2.72
LMF1-210ENST00000567595 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.92■■■□□ 2.7
LMF1-210ENST00000567595 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
LMF1-210ENST00000567595 SOGA1O94964 1423 aa31.9■■■□□ 2.7
LMF1-210ENST00000567595 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.88■■■□□ 2.69
LMF1-210ENST00000567595 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.83■■■□□ 2.69
LMF1-210ENST00000567595 WDR97A6NE52 1622 aa31.82■■■□□ 2.68
LMF1-210ENST00000567595 OSCARQ8IYS5 282 aa31.77■■■□□ 2.68
LMF1-210ENST00000567595 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
LMF1-210ENST00000567595 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.72■■■□□ 2.673e-6■■■■■ 66.3
LMF1-210ENST00000567595 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.71■■■□□ 2.67
LMF1-210ENST00000567595 TOP2BQ02880 1626 aa31.7■■■□□ 2.66
LMF1-210ENST00000567595 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.65■■■□□ 2.66
LMF1-210ENST00000567595 SYNJ1O43426 1573 aa31.64■■■□□ 2.66
LMF1-210ENST00000567595 GRIN2BQ13224 1484 aa31.58■■■□□ 2.65
LMF1-210ENST00000567595 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.54■■■□□ 2.64
LMF1-210ENST00000567595 CHD1O14646 1710 aa31.54■■■□□ 2.64
LMF1-210ENST00000567595 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.53■■■□□ 2.64
LMF1-210ENST00000567595 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.53■■■□□ 2.64
LMF1-210ENST00000567595 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
LMF1-210ENST00000567595 PBRM1Q86U86 1689 aa31.48■■■□□ 2.63
LMF1-210ENST00000567595 FBLN2P98095 1184 aa31.41■■■□□ 2.62
LMF1-210ENST00000567595 SYNJ2O15056 1496 aa31.4■■■□□ 2.62
LMF1-210ENST00000567595 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
LMF1-210ENST00000567595 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.29■■■□□ 2.6
LMF1-210ENST00000567595 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.29■■■□□ 2.6
LMF1-210ENST00000567595 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.29■■■□□ 2.6
LMF1-210ENST00000567595 ARHGEF11O15085 1522 aa31.28■■■□□ 2.6
LMF1-210ENST00000567595 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.27■■■□□ 2.6
LMF1-210ENST00000567595 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.25■■■□□ 2.59
LMF1-210ENST00000567595 ADAMTS12P58397 1594 aa31.24■■■□□ 2.59
LMF1-210ENST00000567595 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.18■■■□□ 2.58
LMF1-210ENST00000567595 GRIN2AQ12879 1464 aa31.17■■■□□ 2.58
LMF1-210ENST00000567595 TRIM41Q8WV44 630 aa31.17■■■□□ 2.58
LMF1-210ENST00000567595 NUP160Q12769 1436 aa31.07■■■□□ 2.57
LMF1-210ENST00000567595 KIF27Q86VH2 1401 aa31.07■■■□□ 2.57
LMF1-210ENST00000567595 CEP170Q5SW79 1584 aa31.01■■■□□ 2.56
LMF1-210ENST00000567595 ARAP1Q96P48 1450 aa31.01■■■□□ 2.55
LMF1-210ENST00000567595 IGF1RP08069 1367 aa31■■■□□ 2.55
LMF1-210ENST00000567595 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.93■■■□□ 2.54
LMF1-210ENST00000567595 CUL7Q14999 1698 aa30.93■■■□□ 2.54
LMF1-210ENST00000567595 SHROOM2Q13796 1616 aa30.87■■■□□ 2.53
LMF1-210ENST00000567595 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.79■■■□□ 2.52
LMF1-210ENST00000567595 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.78■■■□□ 2.52
LMF1-210ENST00000567595 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.4 ms