RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567271.1

NME3-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-210ENST00000567271 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.35■■■■□ 3.41
NME3-210ENST00000567271 JPH4Q96JJ6 628 aa36.33■■■■□ 3.41
NME3-210ENST00000567271 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.33■■■■□ 3.41
NME3-210ENST00000567271 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.27■■■■□ 3.4
NME3-210ENST00000567271 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.25■■■■□ 3.39
NME3-210ENST00000567271 EEA1Q15075 1411 aa36.24■■■■□ 3.39
NME3-210ENST00000567271 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
NME3-210ENST00000567271 PRXQ9BXM0 1461 aa36.24■■■■□ 3.39
NME3-210ENST00000567271 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
NME3-210ENST00000567271 IQGAP2Q13576 1575 aa36.09■■■■□ 3.37
NME3-210ENST00000567271 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.94■■■■□ 3.34
NME3-210ENST00000567271 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.93■■■■□ 3.34
NME3-210ENST00000567271 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.92■■■■□ 3.34
NME3-210ENST00000567271 DISP1Q96F81 1524 aa35.88■■■■□ 3.33
NME3-210ENST00000567271 KIF21BO75037 1637 aa35.83■■■■□ 3.33
NME3-210ENST00000567271 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.83■■■■□ 3.33
NME3-210ENST00000567271 PTPRGP23470 1445 aa35.82■■■■□ 3.32
NME3-210ENST00000567271 KIAA0556O60303 1618 aa35.75■■■■□ 3.31
NME3-210ENST00000567271 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
NME3-210ENST00000567271 GOLGA3Q08378 1498 aa35.72■■■■□ 3.31
NME3-210ENST00000567271 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.65■■■■□ 3.3
NME3-210ENST00000567271 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.63■■■■□ 3.29
NME3-210ENST00000567271 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
NME3-210ENST00000567271 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.59■■■■□ 3.29
NME3-210ENST00000567271 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
NME3-210ENST00000567271 UACAQ9BZF9 1416 aa35.57■■■■□ 3.28
NME3-210ENST00000567271 P3H3Q8IVL6 736 aa35.53■■■■□ 3.28
NME3-210ENST00000567271 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.53■■■■□ 3.28
NME3-210ENST00000567271 SAMD9Q5K651 1589 aa35.52■■■■□ 3.28
NME3-210ENST00000567271 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
NME3-210ENST00000567271 ABCC2Q92887 1545 aa35.47■■■■□ 3.27
NME3-210ENST00000567271 MAPKBP1O60336 1514 aa35.43■■■■□ 3.26
NME3-210ENST00000567271 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.42■■■■□ 3.26
NME3-210ENST00000567271 ABCA8O94911 1581 aa35.38■■■■□ 3.25
NME3-210ENST00000567271 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.37■■■■□ 3.25
NME3-210ENST00000567271 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.36■■■■□ 3.25
NME3-210ENST00000567271 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.33■■■■□ 3.25
NME3-210ENST00000567271 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.29■■■■□ 3.24
NME3-210ENST00000567271 ASXL2Q76L83 1435 aa35.25■■■■□ 3.23
NME3-210ENST00000567271 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
NME3-210ENST00000567271 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.24■■■■□ 3.23
NME3-210ENST00000567271 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.22■■■■□ 3.23
NME3-210ENST00000567271 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.22■■■■□ 3.23
NME3-210ENST00000567271 DIP2BQ9P265 1576 aa35.2■■■■□ 3.23
NME3-210ENST00000567271 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.17■■■■□ 3.22
NME3-210ENST00000567271 ATP10BO94823 1461 aa35.11■■■■□ 3.21
NME3-210ENST00000567271 ARID3CA6NKF2 412 aa35.11■■■■□ 3.21
NME3-210ENST00000567271 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
NME3-210ENST00000567271 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.06■■■■□ 3.2
NME3-210ENST00000567271 FMN1Q68DA7 1419 aa35.06■■■■□ 3.2
NME3-210ENST00000567271 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
NME3-210ENST00000567271 GLI2P10070 1586 aa35.04■■■■□ 3.2
NME3-210ENST00000567271 CLIP1P30622 1438 aa35.02■■■■□ 3.2
NME3-210ENST00000567271 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.99■■■■□ 3.19
NME3-210ENST00000567271 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
NME3-210ENST00000567271 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
NME3-210ENST00000567271 KCNH8Q96L42 1107 aa34.94■■■■□ 3.18
NME3-210ENST00000567271 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
NME3-210ENST00000567271 TSPOAP1O95153 1857 aa34.87■■■■□ 3.17
NME3-210ENST00000567271 HECW1Q76N89 1606 aa34.86■■■■□ 3.17
NME3-210ENST00000567271 CEP162Q5TB80 1403 aa34.86■■■■□ 3.17
NME3-210ENST00000567271 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.84■■■■□ 3.17
NME3-210ENST00000567271 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.83■■■■□ 3.17
NME3-210ENST00000567271 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
NME3-210ENST00000567271 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.8■■■■□ 3.16
NME3-210ENST00000567271 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
NME3-210ENST00000567271 CD109Q6YHK3 1445 aa34.76■■■■□ 3.16
NME3-210ENST00000567271 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
NME3-210ENST00000567271 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.74■■■■□ 3.15
NME3-210ENST00000567271 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.7■■■■□ 3.15
NME3-210ENST00000567271 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.7■■■■□ 3.15
NME3-210ENST00000567271 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.69■■■■□ 3.14
NME3-210ENST00000567271 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.69■■■■□ 3.14
NME3-210ENST00000567271 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
NME3-210ENST00000567271 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.67■■■■□ 3.14
NME3-210ENST00000567271 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.64■■■■□ 3.14
NME3-210ENST00000567271 KDM6BO15054 1643 aa34.62■■■■□ 3.13
NME3-210ENST00000567271 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
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NME3-210ENST00000567271 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
NME3-210ENST00000567271 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.49■■■■□ 3.11
NME3-210ENST00000567271 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.44■■■■□ 3.1
NME3-210ENST00000567271 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.44■■■■□ 3.1
NME3-210ENST00000567271 KIF14Q15058 1648 aa34.44■■■■□ 3.1
NME3-210ENST00000567271 NEO1Q92859 1461 aa34.42■■■■□ 3.1
NME3-210ENST00000567271 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.39■■■■□ 3.1
NME3-210ENST00000567271 PLCH2O75038 1416 aa34.38■■■■□ 3.09
NME3-210ENST00000567271 FANCAO15360 1455 aa34.35■■■■□ 3.09
NME3-210ENST00000567271 AKNAQ7Z591 1439 aa34.3■■■■□ 3.08
NME3-210ENST00000567271 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.3■■■■□ 3.08
NME3-210ENST00000567271 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.3■■■■□ 3.08
NME3-210ENST00000567271 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.28■■■■□ 3.08
NME3-210ENST00000567271 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.26■■■■□ 3.08
NME3-210ENST00000567271 RAPGEF3O95398 923 aa34.23■■■■□ 3.07
NME3-210ENST00000567271 TIAM1Q13009 1591 aa34.21■■■■□ 3.07
NME3-210ENST00000567271 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.2■■■■□ 3.07
NME3-210ENST00000567271 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.2■■■■□ 3.06
NME3-210ENST00000567271 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
NME3-210ENST00000567271 ADGRL1O94910 1474 aa34.16■■■■□ 3.06
NME3-210ENST00000567271 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.16■■■■□ 3.06
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