RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566749.5

PPP4C-209, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,490 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-209ENST00000566749 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.48■■■■■ 4.23
PPP4C-209ENST00000566749 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.47■■■■■ 4.23
PPP4C-209ENST00000566749 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.45■■■■■ 4.23
PPP4C-209ENST00000566749 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
PPP4C-209ENST00000566749 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.4■■■■■ 4.22
PPP4C-209ENST00000566749 PRXQ9BXM0 1461 aa41.26■■■■■ 4.2
PPP4C-209ENST00000566749 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.25■■■■■ 4.19
PPP4C-209ENST00000566749 EEA1Q15075 1411 aa41.24■■■■■ 4.19
PPP4C-209ENST00000566749 IQGAP2Q13576 1575 aa41.23■■■■■ 4.19
PPP4C-209ENST00000566749 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
PPP4C-209ENST00000566749 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.07■■■■■ 4.17
PPP4C-209ENST00000566749 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.06■■■■■ 4.16
PPP4C-209ENST00000566749 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.98■■■■■ 4.15
PPP4C-209ENST00000566749 DISP1Q96F81 1524 aa40.93■■■■■ 4.14
PPP4C-209ENST00000566749 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.92■■■■■ 4.14
PPP4C-209ENST00000566749 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
PPP4C-209ENST00000566749 PTPRGP23470 1445 aa40.91■■■■■ 4.14
PPP4C-209ENST00000566749 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
PPP4C-209ENST00000566749 KIAA0556O60303 1618 aa40.83■■■■■ 4.13
PPP4C-209ENST00000566749 KIF21BO75037 1637 aa40.82■■■■■ 4.13
PPP4C-209ENST00000566749 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.78■■■■■ 4.12
PPP4C-209ENST00000566749 GOLGA3Q08378 1498 aa40.77■■■■■ 4.12
PPP4C-209ENST00000566749 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.75■■■■■ 4.11
PPP4C-209ENST00000566749 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.64■■■■■ 4.1
PPP4C-209ENST00000566749 UACAQ9BZF9 1416 aa40.62■■■■■ 4.09
PPP4C-209ENST00000566749 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.57■■■■■ 4.08
PPP4C-209ENST00000566749 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
PPP4C-209ENST00000566749 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
PPP4C-209ENST00000566749 P3H3Q8IVL6 736 aa40.55■■■■■ 4.08
PPP4C-209ENST00000566749 ABCC2Q92887 1545 aa40.54■■■■■ 4.08
PPP4C-209ENST00000566749 MAPKBP1O60336 1514 aa40.53■■■■■ 4.08
PPP4C-209ENST00000566749 SAMD9Q5K651 1589 aa40.52■■■■■ 4.08
PPP4C-209ENST00000566749 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.45■■■■■ 4.07
PPP4C-209ENST00000566749 ABCA8O94911 1581 aa40.38■■■■■ 4.06
PPP4C-209ENST00000566749 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.38■■■■■ 4.06
PPP4C-209ENST00000566749 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.38■■■■■ 4.05
PPP4C-209ENST00000566749 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.36■■■■■ 4.05
PPP4C-209ENST00000566749 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.33■■■■■ 4.05
PPP4C-209ENST00000566749 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.33■■■■■ 4.05
PPP4C-209ENST00000566749 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
PPP4C-209ENST00000566749 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.31■■■■■ 4.04
PPP4C-209ENST00000566749 ASXL2Q76L83 1435 aa40.3■■■■■ 4.04
PPP4C-209ENST00000566749 DIP2BQ9P265 1576 aa40.3■■■■■ 4.04
PPP4C-209ENST00000566749 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.17■■■■■ 4.02
PPP4C-209ENST00000566749 ARID3CA6NKF2 412 aa40.13■■■■■ 4.02
PPP4C-209ENST00000566749 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.12■■■■■ 4.01
PPP4C-209ENST00000566749 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.08■■■■■ 4.01
PPP4C-209ENST00000566749 ATP10BO94823 1461 aa40.06■■■■■ 4
PPP4C-209ENST00000566749 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
PPP4C-209ENST00000566749 GLI2P10070 1586 aa40.05■■■■■ 4
PPP4C-209ENST00000566749 TSPOAP1O95153 1857 aa40.02■■■■■ 4
PPP4C-209ENST00000566749 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
PPP4C-209ENST00000566749 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
PPP4C-209ENST00000566749 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
PPP4C-209ENST00000566749 FMN1Q68DA7 1419 aa39.98■■■■□ 3.99
PPP4C-209ENST00000566749 KCNH8Q96L42 1107 aa39.95■■■■□ 3.99
PPP4C-209ENST00000566749 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.87■■■■□ 3.97
PPP4C-209ENST00000566749 CLIP1P30622 1438 aa39.86■■■■□ 3.97
PPP4C-209ENST00000566749 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
PPP4C-209ENST00000566749 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
PPP4C-209ENST00000566749 HECW1Q76N89 1606 aa39.8■■■■□ 3.96
PPP4C-209ENST00000566749 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.76■■■■□ 3.96
PPP4C-209ENST00000566749 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.75■■■■□ 3.95
PPP4C-209ENST00000566749 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
PPP4C-209ENST00000566749 CD109Q6YHK3 1445 aa39.74■■■■□ 3.95
PPP4C-209ENST00000566749 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.74■■■■□ 3.95
PPP4C-209ENST00000566749 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.72■■■■□ 3.95
PPP4C-209ENST00000566749 KDM6BO15054 1643 aa39.71■■■■□ 3.95
PPP4C-209ENST00000566749 CEP162Q5TB80 1403 aa39.66■■■■□ 3.94
PPP4C-209ENST00000566749 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
PPP4C-209ENST00000566749 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.64■■■■□ 3.94
PPP4C-209ENST00000566749 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.64■■■■□ 3.94
PPP4C-209ENST00000566749 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.63■■■■□ 3.94
PPP4C-209ENST00000566749 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
PPP4C-209ENST00000566749 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.57■■■■□ 3.93
PPP4C-209ENST00000566749 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.54■■■■□ 3.92
PPP4C-209ENST00000566749 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.5■■■■□ 3.91
PPP4C-209ENST00000566749 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
PPP4C-209ENST00000566749 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.46■■■■□ 3.915e-11■■□□□ 12.7
PPP4C-209ENST00000566749 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.41■■■■□ 3.9
PPP4C-209ENST00000566749 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.41■■■■□ 3.9
PPP4C-209ENST00000566749 KIF14Q15058 1648 aa39.34■■■■□ 3.89
PPP4C-209ENST00000566749 NEO1Q92859 1461 aa39.33■■■■□ 3.89
PPP4C-209ENST00000566749 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.33■■■■□ 3.89
PPP4C-209ENST00000566749 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.29■■■■□ 3.88
PPP4C-209ENST00000566749 FANCAO15360 1455 aa39.25■■■■□ 3.87
PPP4C-209ENST00000566749 PLCH2O75038 1416 aa39.24■■■■□ 3.87
PPP4C-209ENST00000566749 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.23■■■■□ 3.87
PPP4C-209ENST00000566749 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.22■■■■□ 3.87
PPP4C-209ENST00000566749 AKNAQ7Z591 1439 aa39.19■■■■□ 3.86
PPP4C-209ENST00000566749 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.18■■■■□ 3.86
PPP4C-209ENST00000566749 RAPGEF3O95398 923 aa39.13■■■■□ 3.85
PPP4C-209ENST00000566749 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.12■■■■□ 3.85
PPP4C-209ENST00000566749 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.11■■■■□ 3.85
PPP4C-209ENST00000566749 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.08■■■■□ 3.85
PPP4C-209ENST00000566749 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.85
PPP4C-209ENST00000566749 ADGRL1O94910 1474 aa39.04■■■■□ 3.84
PPP4C-209ENST00000566749 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.03■■■■□ 3.84
PPP4C-209ENST00000566749 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.02■■■■□ 3.84
PPP4C-209ENST00000566749 PREX2Q70Z35 1606 aa39.01■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms