RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566749.5

PPP4C-209, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,490 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-209ENST00000566749 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.48■■■■■ 4.23
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PPP4C-209ENST00000566749 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
PPP4C-209ENST00000566749 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.4■■■■■ 4.22
PPP4C-209ENST00000566749 PRXQ9BXM0 1461 aa41.26■■■■■ 4.2
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PPP4C-209ENST00000566749 EEA1Q15075 1411 aa41.24■■■■■ 4.19
PPP4C-209ENST00000566749 IQGAP2Q13576 1575 aa41.23■■■■■ 4.19
PPP4C-209ENST00000566749 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
PPP4C-209ENST00000566749 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.07■■■■■ 4.17
PPP4C-209ENST00000566749 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.06■■■■■ 4.16
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PPP4C-209ENST00000566749 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
PPP4C-209ENST00000566749 KIAA0556O60303 1618 aa40.83■■■■■ 4.13
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PPP4C-209ENST00000566749 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.75■■■■■ 4.11
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PPP4C-209ENST00000566749 ABCA8O94911 1581 aa40.38■■■■■ 4.06
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PPP4C-209ENST00000566749 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.36■■■■■ 4.05
PPP4C-209ENST00000566749 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.33■■■■■ 4.05
PPP4C-209ENST00000566749 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.33■■■■■ 4.05
PPP4C-209ENST00000566749 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
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PPP4C-209ENST00000566749 ASXL2Q76L83 1435 aa40.3■■■■■ 4.04
PPP4C-209ENST00000566749 DIP2BQ9P265 1576 aa40.3■■■■■ 4.04
PPP4C-209ENST00000566749 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.17■■■■■ 4.02
PPP4C-209ENST00000566749 ARID3CA6NKF2 412 aa40.13■■■■■ 4.02
PPP4C-209ENST00000566749 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.12■■■■■ 4.01
PPP4C-209ENST00000566749 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.08■■■■■ 4.01
PPP4C-209ENST00000566749 ATP10BO94823 1461 aa40.06■■■■■ 4
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PPP4C-209ENST00000566749 CLIP1P30622 1438 aa39.86■■■■□ 3.97
PPP4C-209ENST00000566749 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
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PPP4C-209ENST00000566749 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.76■■■■□ 3.96
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PPP4C-209ENST00000566749 CD109Q6YHK3 1445 aa39.74■■■■□ 3.95
PPP4C-209ENST00000566749 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.74■■■■□ 3.95
PPP4C-209ENST00000566749 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.72■■■■□ 3.95
PPP4C-209ENST00000566749 KDM6BO15054 1643 aa39.71■■■■□ 3.95
PPP4C-209ENST00000566749 CEP162Q5TB80 1403 aa39.66■■■■□ 3.94
PPP4C-209ENST00000566749 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
PPP4C-209ENST00000566749 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.64■■■■□ 3.94
PPP4C-209ENST00000566749 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.64■■■■□ 3.94
PPP4C-209ENST00000566749 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.63■■■■□ 3.94
PPP4C-209ENST00000566749 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
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PPP4C-209ENST00000566749 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.5■■■■□ 3.91
PPP4C-209ENST00000566749 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
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PPP4C-209ENST00000566749 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.41■■■■□ 3.9
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PPP4C-209ENST00000566749 NEO1Q92859 1461 aa39.33■■■■□ 3.89
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PPP4C-209ENST00000566749 FANCAO15360 1455 aa39.25■■■■□ 3.87
PPP4C-209ENST00000566749 PLCH2O75038 1416 aa39.24■■■■□ 3.87
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PPP4C-209ENST00000566749 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.11■■■■□ 3.85
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PPP4C-209ENST00000566749 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.85
PPP4C-209ENST00000566749 ADGRL1O94910 1474 aa39.04■■■■□ 3.84
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PPP4C-209ENST00000566749 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.02■■■■□ 3.84
PPP4C-209ENST00000566749 PREX2Q70Z35 1606 aa39.01■■■■□ 3.84
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