RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.73■■■□□ 2.35
SPNS1-208ENST00000566059 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.73■■■□□ 2.35
SPNS1-208ENST00000566059 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.73■■■□□ 2.35
SPNS1-208ENST00000566059 JPH4Q96JJ6 628 aa29.7■■■□□ 2.34
SPNS1-208ENST00000566059 SHROOM2Q13796 1616 aa29.67■■■□□ 2.34
SPNS1-208ENST00000566059 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.59■■■□□ 2.33
SPNS1-208ENST00000566059 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
SPNS1-208ENST00000566059 KIF21BO75037 1637 aa29.57■■■□□ 2.32
SPNS1-208ENST00000566059 IQGAP2Q13576 1575 aa29.57■■■□□ 2.32
SPNS1-208ENST00000566059 ARAP1Q96P48 1450 aa29.56■■■□□ 2.32
SPNS1-208ENST00000566059 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.53■■■□□ 2.32
SPNS1-208ENST00000566059 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.5■■■□□ 2.31
SPNS1-208ENST00000566059 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.49■■■□□ 2.31
SPNS1-208ENST00000566059 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.44■■■□□ 2.3
SPNS1-208ENST00000566059 GOLGA3Q08378 1498 aa29.44■■■□□ 2.3
SPNS1-208ENST00000566059 DISP1Q96F81 1524 aa29.39■■■□□ 2.3
SPNS1-208ENST00000566059 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.39■■■□□ 2.3
SPNS1-208ENST00000566059 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
SPNS1-208ENST00000566059 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.31■■■□□ 2.28
SPNS1-208ENST00000566059 KIAA0556O60303 1618 aa29.29■■■□□ 2.28
SPNS1-208ENST00000566059 PTPRGP23470 1445 aa29.27■■■□□ 2.28
SPNS1-208ENST00000566059 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
SPNS1-208ENST00000566059 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
SPNS1-208ENST00000566059 P3H3Q8IVL6 736 aa29.2■■■□□ 2.27
SPNS1-208ENST00000566059 SAMD9Q5K651 1589 aa29.19■■■□□ 2.26
SPNS1-208ENST00000566059 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.11■■■□□ 2.25
SPNS1-208ENST00000566059 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.09■■■□□ 2.25
SPNS1-208ENST00000566059 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.08■■■□□ 2.25
SPNS1-208ENST00000566059 UACAQ9BZF9 1416 aa29.08■■■□□ 2.25
SPNS1-208ENST00000566059 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.06■■■□□ 2.24
SPNS1-208ENST00000566059 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.03■■■□□ 2.24
SPNS1-208ENST00000566059 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.02■■■□□ 2.24
SPNS1-208ENST00000566059 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.02■■■□□ 2.24
SPNS1-208ENST00000566059 ABCC2Q92887 1545 aa28.99■■■□□ 2.23
SPNS1-208ENST00000566059 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.23
SPNS1-208ENST00000566059 ABCA8O94911 1581 aa28.98■■■□□ 2.23
SPNS1-208ENST00000566059 CLIP1P30622 1438 aa28.94■■■□□ 2.22
SPNS1-208ENST00000566059 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.89■■■□□ 2.22
SPNS1-208ENST00000566059 CEP162Q5TB80 1403 aa28.87■■■□□ 2.21
SPNS1-208ENST00000566059 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.85■■■□□ 2.21
SPNS1-208ENST00000566059 MAPKBP1O60336 1514 aa28.84■■■□□ 2.21
SPNS1-208ENST00000566059 FMN1Q68DA7 1419 aa28.84■■■□□ 2.21
SPNS1-208ENST00000566059 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
SPNS1-208ENST00000566059 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
SPNS1-208ENST00000566059 ARID3CA6NKF2 412 aa28.8■■■□□ 2.2
SPNS1-208ENST00000566059 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
SPNS1-208ENST00000566059 ATP10BO94823 1461 aa28.77■■■□□ 2.2
SPNS1-208ENST00000566059 ASXL2Q76L83 1435 aa28.76■■■□□ 2.19
SPNS1-208ENST00000566059 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
SPNS1-208ENST00000566059 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.7■■■□□ 2.18
SPNS1-208ENST00000566059 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
SPNS1-208ENST00000566059 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.66■■■□□ 2.18
SPNS1-208ENST00000566059 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
SPNS1-208ENST00000566059 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.66■■■□□ 2.18
SPNS1-208ENST00000566059 HECW1Q76N89 1606 aa28.64■■■□□ 2.18
SPNS1-208ENST00000566059 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.64■■■□□ 2.18
SPNS1-208ENST00000566059 DIP2BQ9P265 1576 aa28.63■■■□□ 2.17
SPNS1-208ENST00000566059 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
SPNS1-208ENST00000566059 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.61■■■□□ 2.17
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SPNS1-208ENST00000566059 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
SPNS1-208ENST00000566059 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.58■■■□□ 2.17
SPNS1-208ENST00000566059 KCNH8Q96L42 1107 aa28.58■■■□□ 2.17
SPNS1-208ENST00000566059 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.54■■■□□ 2.16
SPNS1-208ENST00000566059 GLI2P10070 1586 aa28.53■■■□□ 2.16
SPNS1-208ENST00000566059 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.53■■■□□ 2.16
SPNS1-208ENST00000566059 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.5■■■□□ 2.15
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.49■■■□□ 2.15
SPNS1-208ENST00000566059 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
SPNS1-208ENST00000566059 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.4■■■□□ 2.14
SPNS1-208ENST00000566059 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
SPNS1-208ENST00000566059 CD109Q6YHK3 1445 aa28.37■■■□□ 2.13
SPNS1-208ENST00000566059 TSPOAP1O95153 1857 aa28.36■■■□□ 2.13
SPNS1-208ENST00000566059 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.36■■■□□ 2.13
SPNS1-208ENST00000566059 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.35■■■□□ 2.13
SPNS1-208ENST00000566059 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.34■■■□□ 2.13
SPNS1-208ENST00000566059 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
SPNS1-208ENST00000566059 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
SPNS1-208ENST00000566059 KIF14Q15058 1648 aa28.27■■■□□ 2.12
SPNS1-208ENST00000566059 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.26■■■□□ 2.12
SPNS1-208ENST00000566059 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.25■■■□□ 2.11
SPNS1-208ENST00000566059 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.25■■■□□ 2.11
SPNS1-208ENST00000566059 TIAM1Q13009 1591 aa28.25■■■□□ 2.11
SPNS1-208ENST00000566059 MAP3K1Q13233 1512 aa28.21■■■□□ 2.11
SPNS1-208ENST00000566059 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.17■■■□□ 2.1
SPNS1-208ENST00000566059 PLCH2O75038 1416 aa28.17■■■□□ 2.1
SPNS1-208ENST00000566059 APLP2Q06481 763 aa28.15■■■□□ 2.1
SPNS1-208ENST00000566059 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
SPNS1-208ENST00000566059 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.15■■■□□ 2.1
SPNS1-208ENST00000566059 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
SPNS1-208ENST00000566059 NEO1Q92859 1461 aa28.11■■■□□ 2.09
SPNS1-208ENST00000566059 KDM6BO15054 1643 aa28.1■■■□□ 2.09
SPNS1-208ENST00000566059 FANCAO15360 1455 aa28.1■■■□□ 2.09
SPNS1-208ENST00000566059 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.09■■■□□ 2.09
SPNS1-208ENST00000566059 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.08■■■□□ 2.09
SPNS1-208ENST00000566059 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.08■■■□□ 2.09
SPNS1-208ENST00000566059 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.06■■■□□ 2.08
SPNS1-208ENST00000566059 AKNAQ7Z591 1439 aa28.05■■■□□ 2.08
SPNS1-208ENST00000566059 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
SPNS1-208ENST00000566059 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.04■■■□□ 2.08
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