RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565849.5

E2F4-206, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 639 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-206ENST00000565849 JPH4Q96JJ6 628 aa45.87■■■■■ 4.93
E2F4-206ENST00000565849 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.86■■■■■ 4.93
E2F4-206ENST00000565849 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.82■■■■■ 4.92
E2F4-206ENST00000565849 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.67■■■■■ 4.9
E2F4-206ENST00000565849 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
E2F4-206ENST00000565849 IQGAP2Q13576 1575 aa45.55■■■■■ 4.88
E2F4-206ENST00000565849 PRXQ9BXM0 1461 aa45.41■■■■■ 4.86
E2F4-206ENST00000565849 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.35■■■■■ 4.85
E2F4-206ENST00000565849 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.32■■■■■ 4.85
E2F4-206ENST00000565849 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.26■■■■■ 4.84
E2F4-206ENST00000565849 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.26■■■■■ 4.84
E2F4-206ENST00000565849 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.25■■■■■ 4.83
E2F4-206ENST00000565849 DISP1Q96F81 1524 aa45.25■■■■■ 4.83
E2F4-206ENST00000565849 PTPRGP23470 1445 aa45.24■■■■■ 4.83
E2F4-206ENST00000565849 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.24■■■■■ 4.83
E2F4-206ENST00000565849 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.23■■■■■ 4.83
E2F4-206ENST00000565849 EEA1Q15075 1411 aa45.2■■■■■ 4.83
E2F4-206ENST00000565849 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.2■■■■■ 4.83
E2F4-206ENST00000565849 KIAA0556O60303 1618 aa45.13■■■■■ 4.82
E2F4-206ENST00000565849 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
E2F4-206ENST00000565849 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.1■■■■■ 4.81
E2F4-206ENST00000565849 MAPKBP1O60336 1514 aa45■■■■■ 4.79
E2F4-206ENST00000565849 KIF13AQ9H1H9 1805 aa44.96■■■■■ 4.79
E2F4-206ENST00000565849 GOLGA3Q08378 1498 aa44.96■■■■■ 4.79
E2F4-206ENST00000565849 UACAQ9BZF9 1416 aa44.92■■■■■ 4.78
E2F4-206ENST00000565849 ABCC2Q92887 1545 aa44.91■■■■■ 4.78
E2F4-206ENST00000565849 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.9■■■■■ 4.78
E2F4-206ENST00000565849 KIF21BO75037 1637 aa44.84■■■■■ 4.77
E2F4-206ENST00000565849 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.84■■■■■ 4.77
E2F4-206ENST00000565849 DIP2BQ9P265 1576 aa44.8■■■■■ 4.76
E2F4-206ENST00000565849 FAM69CQ0P6D2 419 aa44.77■■■■■ 4.76
E2F4-206ENST00000565849 PLB1Q6P1J6 1458 aa44.72■■■■■ 4.75
E2F4-206ENST00000565849 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.7■■■■■ 4.75
E2F4-206ENST00000565849 SAMD9Q5K651 1589 aa44.69■■■■■ 4.75
E2F4-206ENST00000565849 P3H3Q8IVL6 736 aa44.69■■■■■ 4.74
E2F4-206ENST00000565849 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.67■■■■■ 4.74
E2F4-206ENST00000565849 ASXL2Q76L83 1435 aa44.67■■■■■ 4.74
E2F4-206ENST00000565849 ABCA8O94911 1581 aa44.65■■■■■ 4.74
E2F4-206ENST00000565849 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.62■■■■■ 4.73
E2F4-206ENST00000565849 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.61■■■■■ 4.73
E2F4-206ENST00000565849 TSPOAP1O95153 1857 aa44.5■■■■■ 4.71
E2F4-206ENST00000565849 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.47■■■■■ 4.71
E2F4-206ENST00000565849 GLI2P10070 1586 aa44.43■■■■■ 4.7
E2F4-206ENST00000565849 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.43■■■■■ 4.7
E2F4-206ENST00000565849 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
E2F4-206ENST00000565849 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.4■■■■■ 4.7
E2F4-206ENST00000565849 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.38■■■■■ 4.69
E2F4-206ENST00000565849 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.35■■■■■ 4.69
E2F4-206ENST00000565849 ARID3CA6NKF2 412 aa44.33■■■■■ 4.69
E2F4-206ENST00000565849 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
E2F4-206ENST00000565849 ATP10BO94823 1461 aa44.26■■■■■ 4.68
E2F4-206ENST00000565849 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.25■■■■■ 4.67
E2F4-206ENST00000565849 KDM6BO15054 1643 aa44.19■■■■■ 4.66
E2F4-206ENST00000565849 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
E2F4-206ENST00000565849 KCNH8Q96L42 1107 aa44.17■■■■■ 4.66
E2F4-206ENST00000565849 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.13■■■■■ 4.65
E2F4-206ENST00000565849 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.07■■■■■ 4.65
E2F4-206ENST00000565849 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.07■■■■■ 4.65
E2F4-206ENST00000565849 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.06■■■■■ 4.64
E2F4-206ENST00000565849 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.03■■■■■ 4.64
E2F4-206ENST00000565849 CD109Q6YHK3 1445 aa43.99■■■■■ 4.63
E2F4-206ENST00000565849 FMN1Q68DA7 1419 aa43.97■■■■■ 4.63
E2F4-206ENST00000565849 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.92■■■■■ 4.62
E2F4-206ENST00000565849 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.88■■■■■ 4.62
E2F4-206ENST00000565849 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.87■■■■■ 4.61
E2F4-206ENST00000565849 HECW1Q76N89 1606 aa43.86■■■■■ 4.61
E2F4-206ENST00000565849 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.86■■■■■ 4.61
E2F4-206ENST00000565849 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.84■■■■■ 4.61
E2F4-206ENST00000565849 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.81■■■■■ 4.6
E2F4-206ENST00000565849 CLIP1P30622 1438 aa43.73■■■■■ 4.59
E2F4-206ENST00000565849 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.66■■■■■ 4.58
E2F4-206ENST00000565849 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
E2F4-206ENST00000565849 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.62■■■■■ 4.578e-9■■■■■ 57.3
E2F4-206ENST00000565849 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.59■■■■■ 4.57
E2F4-206ENST00000565849 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.59■■■■■ 4.57
E2F4-206ENST00000565849 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
E2F4-206ENST00000565849 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.55■■■■■ 4.56
E2F4-206ENST00000565849 NEO1Q92859 1461 aa43.53■■■■■ 4.56
E2F4-206ENST00000565849 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.52■■■■■ 4.56
E2F4-206ENST00000565849 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43.5■■■■■ 4.55
E2F4-206ENST00000565849 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.48■■■■■ 4.55
E2F4-206ENST00000565849 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.47■■■■■ 4.55
E2F4-206ENST00000565849 CEP162Q5TB80 1403 aa43.45■■■■■ 4.55
E2F4-206ENST00000565849 KIF14Q15058 1648 aa43.44■■■■■ 4.55
E2F4-206ENST00000565849 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.44■■■■■ 4.54
E2F4-206ENST00000565849 FANCAO15360 1455 aa43.4■■■■■ 4.54
E2F4-206ENST00000565849 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.4■■■■■ 4.54
E2F4-206ENST00000565849 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.39■■■■■ 4.54
E2F4-206ENST00000565849 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.34■■■■■ 4.53
E2F4-206ENST00000565849 RAPGEF3O95398 923 aa43.34■■■■■ 4.53
E2F4-206ENST00000565849 AKNAQ7Z591 1439 aa43.33■■■■■ 4.53
E2F4-206ENST00000565849 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.33■■■■■ 4.53
E2F4-206ENST00000565849 PLCH2O75038 1416 aa43.31■■■■■ 4.52
E2F4-206ENST00000565849 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.31■■■■■ 4.52
E2F4-206ENST00000565849 ADGRL1O94910 1474 aa43.24■■■■■ 4.51
E2F4-206ENST00000565849 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.23■■■■■ 4.51
E2F4-206ENST00000565849 RICTORQ6R327 1708 aa43.22■■■■■ 4.51
E2F4-206ENST00000565849 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.15■■■■■ 4.5
E2F4-206ENST00000565849 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.14■■■■■ 4.5
E2F4-206ENST00000565849 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.1■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms